基因表達(dá)調(diào)控轉(zhuǎn)錄

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1、基因表達(dá)調(diào)控—基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控基因表達(dá)調(diào)控在在基因工程中的意義基因工程的本質(zhì)即是將外源基因與載體進(jìn)行體外拼接后轉(zhuǎn)入宿主細(xì)胞,使宿主高效穩(wěn)定地表達(dá)蛋白質(zhì)產(chǎn)物,因此基因表達(dá)調(diào)控的分子機(jī)制是基因工程原理的指導(dǎo)思想。結(jié)構(gòu)基因或者蛋白編碼基因的表達(dá)都是需要轉(zhuǎn)錄和翻譯2個(gè)環(huán)節(jié),而每個(gè)環(huán)節(jié)都存在不同的基因表達(dá)調(diào)控的位點(diǎn)?;虮磉_(dá)的時(shí)空性其實(shí)也是通過(guò)對(duì)轉(zhuǎn)錄和翻譯兩個(gè)環(huán)節(jié)的調(diào)控實(shí)現(xiàn)的。其中轉(zhuǎn)錄調(diào)控是更為關(guān)鍵和主要的調(diào)控位點(diǎn)?;虮磉_(dá)調(diào)控具有時(shí)空雙重性:時(shí)序調(diào)控是指基因表達(dá)的先后次序和相對(duì)強(qiáng)弱;空間調(diào)控是指基因表達(dá)的區(qū)域和環(huán)

2、節(jié)?;虮磉_(dá)第一步—轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄是指以DNA的一條鏈(編碼鏈或反義鏈)為模板,在RNA聚合酶(以DNA為模板的RNA聚合酶)的作用下,合成RNA的過(guò)程;為更清楚地研究轉(zhuǎn)錄,我們?nèi)藶榈膶⑥D(zhuǎn)錄分為三個(gè)階段:轉(zhuǎn)錄起始轉(zhuǎn)錄延伸轉(zhuǎn)錄終止Figure9.7Transcriptionhasthreestages,whichinvolvedifferenttypesofinteractionbetweenRNApolymeraseandDNA.TheenzymebindstothepromoterandmeltsDNA,r

3、emainsstationaryduringinitiation,movesalongthetemplatedurignelongation,anddissociatesattermination.轉(zhuǎn)錄起始RNA聚合酶結(jié)合于啟動(dòng)子(Promoter)序列啟動(dòng)子(Promoter)是一段提供RNA聚合酶定位與結(jié)合的靶序列。一般來(lái)說(shuō),啟動(dòng)子位于基因上游,一般不超過(guò)200bp。一旦RNA聚合酶定位并結(jié)合于啟動(dòng)子,即可啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄過(guò)程,因此啟動(dòng)子是基因表達(dá)調(diào)控的重要順式元件。啟動(dòng)子具有以下幾方面的特性:序列特異性:

4、在組成啟動(dòng)子的DNA序列中,一般由20bp是相對(duì)保守的,其中更換或增減一個(gè)核苷酸就可能導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄速度發(fā)生變化;方向特異性:為一種極性順式調(diào)控元件,即正反兩種方向只有一種有功能;位置特異性:?jiǎn)?dòng)子一般只能在受調(diào)控基因的上游或基因內(nèi)部前端。甚至在基因上游,啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)之間的距離也是相對(duì)固定的;種屬特異性:原核生物的不同物種、真核生物不同組織、細(xì)胞都可能存在不同的啟動(dòng)子。啟動(dòng)子確定的方法:footprinting原核生物轉(zhuǎn)錄起始人們對(duì)啟動(dòng)子區(qū)的序列進(jìn)行大量突變的結(jié)果表明:對(duì)于大腸桿菌或者其親緣關(guān)系密切的其它

5、原核細(xì)菌而言,最佳的啟動(dòng)子構(gòu)成為Pribnowbox位于Inr上游-7bp,Sextman位于Pribnowbox上游17bp處Inr7bpPribnowbox17bpSextmanbox原核生物轉(zhuǎn)錄起始原核細(xì)菌的RNA聚合酶(RNApolymerase):以DNA為模板的RNA聚合酶。原核細(xì)菌種僅由一種聚合酶完成全部RNA的轉(zhuǎn)錄;大腸桿菌RNA聚合酶的結(jié)構(gòu):RNA聚合酶全酶由5個(gè)亞基構(gòu)成,分別為?2??,?,總分子量為480KDa。事實(shí)上,RNA聚合酶在轉(zhuǎn)錄前和轉(zhuǎn)錄過(guò)程中均以核心酶(?2??,)和?因

6、子兩種分離形式存在于細(xì)胞內(nèi),并且實(shí)驗(yàn)證明RNA聚合酶識(shí)別序列的特異性取決于?因子。RNA聚合酶中各亞基的功能:?識(shí)別啟動(dòng)子?RNA合成;抑制劑:利福霉素,利迪鏈霉素?’負(fù)責(zé)與DNA結(jié)合?增強(qiáng)聚合酶與啟動(dòng)子的專一性結(jié)合原核生物轉(zhuǎn)錄起始EubacterialRNApolymeraseshavefourtypesofsubunit;a,b,andbhaveratherconstantsizesindifferentbacterialspecies,butsvariesmorewidely.原核生物轉(zhuǎn)錄起始在轉(zhuǎn)

7、錄以前,核心酶與DNA之間就有親和力,這種親和力來(lái)自蛋白堿性側(cè)鏈基團(tuán)和DNA磷酸根骨架之間的靜電引力,無(wú)序列特異性,為二者之間的松弛結(jié)合。當(dāng)?亞基與松弛結(jié)合在DNA任何位點(diǎn)的核心酶結(jié)合后,核心酶構(gòu)象發(fā)生了改變:全酶與非特異DNA序列的親和力下降幾萬(wàn)倍,致使全酶從非特異的DNA鏈上脫落下來(lái),而后?亞基與-35相互作用,使聚合酶識(shí)別特定的啟動(dòng)子序列,形成封閉的啟動(dòng)子復(fù)合物。RNA聚合酶結(jié)合到覆蓋-35區(qū)到-10區(qū)上下游在內(nèi)的約60bp。然后在-10區(qū)內(nèi)的堿基對(duì)打開,產(chǎn)生開放復(fù)合物(因?yàn)椋保皡^(qū)為AT富集序列

8、,AT之間只有2個(gè)氫鍵,因此消耗較低的能量即可打開雙螺旋)。形成開放的啟動(dòng)子復(fù)合物后,轉(zhuǎn)錄就開始了,這時(shí)?亞基又從全酶與DNA和RNA的復(fù)合物中解離下來(lái),全酶變成核心酶后繼續(xù)延伸轉(zhuǎn)錄。(MarrMTetal,1997,Science,276:1258-1260)RNApolymerasepassesthroughseveralstepspriortoelongation.Aclosedbinarycomplexisconvertedtoan

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