基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)與調(diào)控

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1、第三章生物信息學(xué)的傳遞-從DNA到RNA(2)南昌大學(xué)生科院彭曉玨原核生物3.5真核生物的轉(zhuǎn)錄真核生物的轉(zhuǎn)錄和原核轉(zhuǎn)錄的不同點(diǎn):(1)原核只有一種RNA聚合酶,而真核細(xì)胞有三種聚合酶;(2)啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)不同,真核有三種不同的啟動(dòng)子和有關(guān)的元件;(3)真核的轉(zhuǎn)錄有很多蛋白質(zhì)因子的介入。3.5.1真核的RNA聚合酶真核生物中的轉(zhuǎn)錄可以分為三類,每類轉(zhuǎn)錄分別由不同的RNA聚合酶執(zhí)行:1.RNA聚合酶I轉(zhuǎn)錄rRNA,與細(xì)胞的大部分活動(dòng)有關(guān)2.RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄mRNA,結(jié)構(gòu)基因,擁有最多的產(chǎn)物3.RNA聚合酶III轉(zhuǎn)錄tRNA和其它的sRNA(smallRNA)3.5.

2、1真核的RNA聚合酶表12-2真核生物的三種RNA聚合酶的特點(diǎn)RNAPol位置產(chǎn)物相對(duì)活性對(duì)α-鵝膏蕈的敏PolⅠ核仁28s,18s,5.8srRNAs50~70%不敏感PolⅡ核質(zhì)hnRNA,mRNA,某些SnRNA20~40%高度敏感PolⅢ核質(zhì)tRNA,5SrRNA,某些SnRNAs~10%片段特異,中等敏感表12-3轉(zhuǎn)錄的抑制劑抑制劑靶酶抑制作用利福霉素細(xì)菌全酶和β亞基結(jié)合,抑制起始鏈霉溶菌素細(xì)菌核心酶和β亞基結(jié)合,抑制起始放射線素D真核PolⅠ和DNA結(jié)合,阻止延伸α-鵝膏蕈真核PolⅡ和RNAPolⅡ結(jié)合B220~240Kda—與模板結(jié)合,與鏈的起始,延伸

3、有關(guān),相當(dāng)于原核RNAPol的β′亞基C端含有羧基末端功能區(qū)大亞基B140~150Kda—與DNA、底物和新生的RNA結(jié)合,相當(dāng)于原核RNAPolβB44.5—酶的連接,相當(dāng)于原核RNA的α亞基RNAPolⅡABC27KDa磷酸化蛋白,1類—三種RNAPol共有,如ABC25.5KDa與DNA結(jié)合有關(guān)ABC23KDaB12.6小亞基2類—PolⅡ特有B23B14.5B103類—在某些條件下可除去的亞基B23參與酶的基本結(jié)構(gòu)B16.5細(xì)胞器的RNAPol—和噬菌體的RNA相似,因有單一固定的功能,分子量較小表12-3真核生物聚合酶的成分及功能3.5.2真核生物的啟動(dòng)子真

4、核生物細(xì)胞中有三種轉(zhuǎn)錄方式,分別由三種RNA聚合酶(I、II和Ⅲ)催化,因此有三種啟動(dòng)子。根據(jù)啟動(dòng)子的不同,將真核生物的基因分為三類,即I類、II類和III類基因。這三種基因分別由三種啟動(dòng)子控制,它們?cè)诮Y(jié)構(gòu)上各有特點(diǎn)。3.5.2.1真核生物的啟動(dòng)子II啟動(dòng)子Ⅱ最為復(fù)雜,它和原核的啟動(dòng)子有很多不同:(1)有多種元件:TATA框,GC框,CATT框,OCT等;(2)結(jié)構(gòu)不恒定;(3)它們的位置、序列、距離和方向都不完全相同;(4)有的有遠(yuǎn)距離的調(diào)控元件存在,如增強(qiáng)子;(5)這些元件常常起到控制轉(zhuǎn)錄效率和選擇起始位點(diǎn)的作(6)不直接和RNApol結(jié)合;(7)需多種轉(zhuǎn)錄因子介

5、入。真核啟動(dòng)子含有不同的組件SV40早期啟動(dòng)子胸苷激酶組蛋白H2B-140-120-100-80-60-40-20+1OctCAATGCTATA(一)Ⅱ類基因的啟動(dòng)子和調(diào)控區(qū)TATA框核心元件啟始子(initiator,Inr):一般由PY2CAPY5構(gòu)成,位于-3~+5,可能提供RNApolⅡ識(shí)別。CAATbox、Ⅱ類啟動(dòng)子上游元件組成GCboxOct.增強(qiáng)子(enhomcer)遠(yuǎn)端調(diào)控區(qū)減弱子(dehancer)靜息子(sisencer)上游激活序列(upstreamactivatingseguencesUASs)起始子起始點(diǎn)一般沒有同源序列mRNA的第一個(gè)堿基傾

6、向A,另一側(cè)翼由Py組成稱為起始子(initiator,Inr).(在原核CAT起始序列也有這種情況)。一般由PY2CAPY5構(gòu)成位于-3~+5提供RNApolⅡ識(shí)別。無論TATA是否存在,Inr對(duì)啟動(dòng)子的強(qiáng)度和起始位點(diǎn)的選擇都是重要的?,F(xiàn)已純化了Inr結(jié)合蛋白。核心元件TATA框合又稱Hogness框,Goldberg-Hogness框,俚語稱為金磚(Goldbrick)其一致序列是:T85A97T93A85A63A83A50常在-25左右,相當(dāng)于原核的-10序列。其作用是:(1)選擇正確的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),保證精確起始,故也稱為選擇子(selector)。(2)影響轉(zhuǎn)

7、錄的速率。.上游啟動(dòng)子元件(UPE)表12-4哺乳動(dòng)物RNAPolⅡ上游轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的元元件保守序列結(jié)合DNA的長度蛋白質(zhì)因子TATAboxTATAAAA~10bpTBPCAATboxGGCCAATCT~22bpCTF/NF1GCboxGGGCGG~20bpSP1OctamerATTTGCAT~20bpOct-1OctamerATTTGCAT23bpOct-2KBGGGACTTTCC~10bpNFKBATFGTGACGT~20bpATFB.Lewin:《GENES》Ⅵ.1997,Table28.2增強(qiáng)子它是在1981年由Benerji,Rusconi

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