漢族人群聚腺苷二磷酸核糖聚合酶

漢族人群聚腺苷二磷酸核糖聚合酶

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1、漢族人群聚腺苷二磷酸核糖聚合酶:梁海榮,唐煥文,胡大林,莊志雄【關(guān)鍵詞】苷二磷酸核【摘要】目的:通過檢測(cè)人聚腺苷二磷酸核糖聚合酶1(hPARP1)7個(gè)外顯子核苷酸多態(tài)性,了解在廣東的漢族人群中hPARP1基因多態(tài)性分布,為建立民族特色的DNA修復(fù)基因多態(tài)性數(shù)據(jù)提供基礎(chǔ)資料。方法:選取在廣東地區(qū)的漢族健康人群320名的基礎(chǔ)資料及血液樣本,抽提血液DNA,用PCR法擴(kuò)增hPARP1基因7個(gè)外顯子,采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)和銀染技術(shù)檢測(cè)hPARP1基因多態(tài)性,并進(jìn)行DNA序列測(cè)定。結(jié)果:在廣東的漢族正常人320名血標(biāo)本的7個(gè)外顯子擴(kuò)增產(chǎn)物SSCP電泳條

2、帶中,4個(gè)樣本hPARP1基因外顯子17的SSCP電泳條帶檢出1條多態(tài)性條帶,3個(gè)樣本第12內(nèi)含子檢出1條多態(tài)性條帶,其余6個(gè)外顯子擴(kuò)增產(chǎn)物SSCP電泳未見多態(tài)性條帶。正常帶型DNA測(cè)序結(jié)果與genebank中已知序列完全一致,第17外顯子上有1種基因突變類型(T→C)。結(jié)論:在廣東地區(qū)的漢族人群的hPARP1基因第17外顯子和第12內(nèi)含子上可能存在多態(tài)性?!娟P(guān)鍵詞】聚腺苷二磷酸核糖聚合酶-1;遺傳多態(tài)性;聚合酶鏈反應(yīng)【Abstract】Objective:Toinvestigatethenucleotidepolymorphismsanddistributionsofsev

3、enexonsinhumanpoly(ADPribose)polymerase1(PARP1)geneandtocontributetotheconstructionofthespecialDNArepairgenepolymorphismsdatabank.Methods:Thebasicmaterialsandbloodsamplesfrom320GuangdonghealthHanpopulationorphismofexon3,11,12,13,16,17andexon20ofhPARP1geneed.Results:Apolymorphismsofexon20ofP

4、ARP1genealbandstheanalysisofPCRSSCPinotherexons.Also,DNAsequenceofnormalbandsturnedoutthatPCRproductsutations(T→C)and(G→A)orphismsmayexistinexon17andintron12ofhPARP1geneinGuangdongHanpopulation.PCRSSCPsilverstainingcouldbeasatooltoscreenrapidlythepolymorphismshPARP1gene.【Keyerase1;geicpolym

5、orphism;polymerasechainreactionDNA修復(fù)系統(tǒng)在修復(fù)DNA損傷、維持基因組完整和穩(wěn)定性中起著不容忽視的作用。聚腺苷二磷酸核糖聚合酶1[poly(ADPribose)polymerase1,PARP1]是真核細(xì)胞中存在的一種蛋白質(zhì)翻譯后修飾酶??蓞⑴c許多與細(xì)胞功能有關(guān)的重要反應(yīng),并與癌癥的發(fā)生、發(fā)展和治療、預(yù)后密切相關(guān),對(duì)維持DNA的完整性方面起著重要的作用[1],其多態(tài)位點(diǎn)的確認(rèn)對(duì)疾病易感性的流行病學(xué)研究具有重大意義?;驒z測(cè)能有效篩查基因突變攜帶者,可以為進(jìn)一步鑒定該突變功能上的意義提供基礎(chǔ)的分子遺傳學(xué)資料,因而具有重要的意義。本文應(yīng)用PCRS

6、SCP基因篩查技術(shù)和分子流行病學(xué)方法檢測(cè)了在廣東的漢族人群中正常人hPARP1基因的多態(tài)性,為hPARP1基因多態(tài)性人群分布和建立民族特色的DNA修復(fù)基因多態(tài)性數(shù)據(jù)庫(kù)提供基礎(chǔ)資料?,F(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。1方法1.1樣本收集選取在廣東地區(qū)的健康狀況良好(通過體檢選擇取)、無家族史和遺傳病史、三代及以上均為漢族的320名個(gè)體(其中男174例,女146例,年齡38~67歲,平均年齡(43.15±6.70)歲)并取血樣標(biāo)本。1.2血液DNA的抽提[2]采集外周抗凝全血5mL,用經(jīng)典酚氯仿法提取外周血DNA,并在4℃保存。1.3引物設(shè)計(jì)根據(jù)已確定的hPARP1基因cDNA和內(nèi)含子/外顯子連

7、接序列,用PrimerPremier5.0引物設(shè)計(jì)軟件設(shè)計(jì)hPARP1基因7個(gè)外顯子的引物,該引物由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成(表1)。表1擴(kuò)增hPARP1基因外顯子的引物序列 1.4PCR擴(kuò)增PCR反應(yīng)總體積為25μL,各成分終濃度為:引物0.125μmol/L,dNTP0.2mmol/L,Mg2+1.8mmol/L,DNA模板25~250ng,TaqDNA聚合酶2.5u。反應(yīng)參數(shù)為:98 ℃預(yù)變性5min,94℃30 s,53~59℃30 s,72℃45 s,30次循環(huán)后72℃延伸8min

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