人參中苯甲酸脅迫響應(yīng)基因wrky7的克隆與表達(dá)分析

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1、人參中苯甲酸脅迫響應(yīng)基因WRKY7的克隆與表達(dá)分析  [摘要]WRKY轉(zhuǎn)錄因子是高等植物中最重要的轉(zhuǎn)錄因子基因家族之一,其在植物形態(tài)建成、生長發(fā)育以及應(yīng)對生物(病菌、害蟲等)、非生物(干旱、鹽、冷、熱等)脅迫過程中發(fā)揮重要作用。該研究根據(jù)人參化感自毒物質(zhì)苯甲酸誘導(dǎo)的人參轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),設(shè)計(jì)全長擴(kuò)增引物,利用RTPCR方法獲得1條編碼WRKY轉(zhuǎn)錄因子的基因,暫命名為WRKY7,并對其進(jìn)行TA克隆、測序和序列分析。該基因cDNA全長1216bp,其開放閱讀框(openreadingframe,ORF)為1014bp,編碼337個(gè)氨基酸。序列分析及系統(tǒng)進(jìn)化

2、分析表明,該蛋白屬于WRKY家族第Ⅲ類成員,與西洋參種的WRKY6轉(zhuǎn)錄因子親緣關(guān)系最近,同源性為87%。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析發(fā)現(xiàn),苯甲酸脅迫后WRKY7的表達(dá)量顯著升高,推測該基因可能參與了人參響應(yīng)苯甲酸脅迫的過程,為進(jìn)一步研究人參自毒脅迫響應(yīng)的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)?! 關(guān)鍵詞]人參;WRKY轉(zhuǎn)錄因子;化感自毒作用;克??;序列分析  [Abstract]WRKYtranscriptionfactorisoneofthemostimportanttranscriptionfactorfamilieswidelyexistinginhigherpl

3、ants,whichplayingcriticalroleinplantmorphogenesis,development,biotic(includingphytopathogens,pestsetc.)andabiotic(drought,salt,chilling,hightemperature,etc.)stress.Inthepresentwork,primersusedtoamplifyfulllengthgeneencodingWRKYtranscriptionfactorweredesignedbasedonthetranscri

4、ptomedataofP.ginsengthatinducedbybenzoicacid,oneofthemostimportantautotoxinsidentifiedfromrootexudatesandrhizospheresoilofP.ginseng.Then,aWRKYgene,temporarilynamedasWRKY7,wasconfirmedbyRTRCR.Furthermore,sequencingandsequenceanalysisofWRKY7wasconducted.Resultsindicatedthat,the

5、fulllengthcDNAofWRKY7was1216bp,theopenreadingframe(ORF)ofwhichwas1014bp,encodes337aminoacids.Homologousanalysisandphylogenetictreeshowedthat,WRKY7belongedtotheⅢcategoryofWRKYfamilies,whichshowing87%similaritytoWRKY6inP.quinquefolius.RealtimePCRresultsshowedthattheexpressionof

6、WRKY7inP.ginsenginducedbybenzoicacidwasupregulatedmarkedlythanthecontrol,sowespeculatedthatWRKY7wasinvolvedintheresponsetobenzoicacidstress,whichwillbehelpfulforfurtherresearchonthemolecularmechanismofginsengplantresponsetobenzoicacidstress.  [Keywords]Panaxginseng;WRKYtransc

7、riptionfactors;autotoxicity;cloning;bioinformaticanalysis  ?D錄因子是一類含有DNA結(jié)合域的蛋白質(zhì),能識(shí)別基因上游特異的核苷酸序列,形成轉(zhuǎn)錄復(fù)合體從而激活或抑制靶基因的表達(dá),WRKY是植物十大轉(zhuǎn)錄因子家族之一。這類轉(zhuǎn)錄因子最早發(fā)現(xiàn)于甘薯[1],后相繼從20余種植物中分離出WRKY轉(zhuǎn)錄因子[2]。WRKY蛋白的共同特點(diǎn)是含有60個(gè)氨基酸組成的WRKY結(jié)構(gòu)域,在N端有一段高度保守的WRKYGQK多肽序列,其是WRKY結(jié)構(gòu)域的核心,如果上述氨基酸發(fā)生變異,將直接影響WRKY轉(zhuǎn)錄因子的DNA結(jié)合

8、活性[3]。根據(jù)WRKY轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)域的數(shù)量和鋅指結(jié)構(gòu),可將WRKY轉(zhuǎn)錄因子分為3類[4]:第Ⅰ類含有2個(gè)WRKY結(jié)構(gòu)域,其鋅指結(jié)構(gòu)為C

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