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1、牛PPARaPPARγ基因多態(tài)性及其與生長性狀相關(guān)性分析第1章引言1.1中國地方黃牛牛品種介紹農(nóng)業(yè)是支撐我國國民經(jīng)濟(jì)的基礎(chǔ)產(chǎn)業(yè)，是我國的第一產(chǎn)業(yè)。畜牧業(yè)作為現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的重要組成部分，是衡量一個(gè)國家和地區(qū)現(xiàn)代化發(fā)展?fàn)顩r的重要標(biāo)志⑴。改革幵放以來，特別是進(jìn)入21世紀(jì)以來，隨著人民生活水平的不斷提高和社會(huì)經(jīng)濟(jì)的快速發(fā)展，人們對(duì)于動(dòng)物蛋白的需求量日益增加，我國畜牧業(yè)急速發(fā)展，目前已成為我國農(nóng)村經(jīng)濟(jì)發(fā)展中最具活力的支柱性產(chǎn)業(yè)。作為重要的動(dòng)物蛋白，肉牛業(yè)必將成為極具潛力的朝陽產(chǎn)業(yè)[2]。黃牛是我國傳統(tǒng)的役用畜，但隨著農(nóng)業(yè)機(jī)械化程度的不斷提高，作為役用的牛逐步
2、向肉用轉(zhuǎn)變。與其它肉類相比較，牛肉具有脂肪少、瘦肉多、蛋白含量高、膽固醇含量低、必需氨基酸含量均衡[3]，同時(shí)維生素和微量元素含量豐富，是人們生活理想的食品之一。隨著人們對(duì)牛肉營養(yǎng)價(jià)值認(rèn)識(shí)的深入，養(yǎng)牛也幵始向肉用方向轉(zhuǎn)變，并已成為黃牛開發(fā)利用的主導(dǎo)方向。我國地方黃牛品種資源繁多、分布廣泛，且品種之間差異較大，優(yōu)勢特征較為明顯。例如，肉脂品質(zhì)好、對(duì)農(nóng)副產(chǎn)品詞料具有良好的利用能力、繁殖能力強(qiáng)、適應(yīng)性強(qiáng)和有害性狀的遺傳頻率相對(duì)較低等優(yōu)良特性。因此，我國地方黃牛品種成為我國乃至全世界牛繁殖育種的重要遺傳資源[4]。然而，役用黃牛作為肉用品種進(jìn)行規(guī)?；?/p>
3、產(chǎn)，仍然存在很多缺陷。例如，生產(chǎn)性能低、生長慢、體型小、產(chǎn)肉量少、肉品質(zhì)差及高檔優(yōu)質(zhì)牛肉產(chǎn)量低等劣勢，這些因素制約著我國肉牛業(yè)的發(fā)展。針對(duì)我國肉牛產(chǎn)業(yè)目前的發(fā)展?fàn)顩r，只有對(duì)黃牛生長性能和牛肉品質(zhì)進(jìn)行改良，培育出優(yōu)良的肉牛品種才能滿足現(xiàn)代社會(huì)對(duì)牛肉的需求，這也是我國肉牛產(chǎn)業(yè)化發(fā)展的重要出路[5]。動(dòng)物的生長性狀通常由多個(gè)基因共同控制，單個(gè)基因?qū)δ骋恍誀畹挠绊懴鄬?duì)較小，并且基因與基因之間、基因與環(huán)境之間都可能存在多重互相影響，即復(fù)雜性狀一般符合的微效多基因理論[6]。傳統(tǒng)的育種方法對(duì)提高后代的生長發(fā)育性能有一定效果，但是受到多個(gè)基因共同控制的影響，
4、其選擇效率低、準(zhǔn)確性差、選擇周期長，這些因素都會(huì)限制優(yōu)質(zhì)地方資源的育種進(jìn)程。動(dòng)物分子標(biāo)記育種從分子水平上對(duì)影響動(dòng)物生長性狀和屠宰性狀的遺傳機(jī)理進(jìn)行研究。選取對(duì)某性狀有較大影響的基因作為候選基因，從分子水平來研究所選候選基因的單核苷酸多態(tài)性（Singlenucleotidepolymorphism,SNP)及其與生長發(fā)育的遺傳調(diào)控規(guī)律，以此來尋找影響黃牛生長發(fā)育性能相關(guān)的分子遺傳標(biāo)記[7]。1.2分子遺傳標(biāo)記簡介廣義上，遺傳標(biāo)記可以理解成生物體內(nèi)受基因控制的全部可變異的性狀，并且這些性狀可以通過有效的方法和手段進(jìn)行測定或度量。根據(jù)遺傳標(biāo)記的本質(zhì)和
5、檢測方法的不同，遺傳標(biāo)記一般可分為形態(tài)學(xué)標(biāo)記、生化標(biāo)記、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記和分子標(biāo)記。在這4類遺傳標(biāo)記中，分子遺傳標(biāo)記彌補(bǔ)了其他遺傳標(biāo)記數(shù)目少、多型性不豐富等方面的不足，是目前使用最多、應(yīng)用范圍最廣的一類有效標(biāo)記。分子遺傳標(biāo)記是根據(jù)基因組存在的豐富多型性而發(fā)展起來，它是一類在DNA水平上直接反映生物個(gè)體差異的遺傳標(biāo)記。這種DNA水平上的差異是由于構(gòu)成DNA分子的堿基或核苦酸序列發(fā)生缺失、插入、重復(fù)、易位、倒位或重排等一系列原因引起的，從而產(chǎn)生的多型現(xiàn)象。目前，分子遺傳標(biāo)記技術(shù)已有數(shù)十種，常用的有單核苷酸多態(tài)性（Singlenucleotidepolym
6、orphism,SNP)、限制性片段長度多態(tài)性（Restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP)、隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(RandomamplifiedpolymorphicDNA，RAPD)、擴(kuò)增片段長度多態(tài)性（Amplifiedfragmentlengthpolymorphism，AFLP)、微衛(wèi)星DNA標(biāo)記（Simplesequencerepeat，SSR)等分子遺傳標(biāo)記。第2章材料與方法2.1實(shí)驗(yàn)材料本研究所使用的DNA樣品分別提取于5個(gè)中國地方黃牛品種和一個(gè)高原牦牛群體，包括郟縣紅牛、南陽牛、魯西牛
7、、秦川牛和勸海黑牛在內(nèi)共計(jì)514頭（見表2-1)。每頭牛采集適量頸靜脈血樣并按照按照抗凝劑與血樣1：6的比例加入適量抗凝劑，超低溫保存?zhèn)溆?。在釆集牛血樣時(shí)同時(shí)測定并記錄其生長數(shù)據(jù)，主要包括體高（BH)、體斜長(BL)、胸圍（CC)、腹圍（AC)、腰角寬（HBJly基因SNPs檢測及其與牛生長性狀..........443.3.1牛PMy基因突變區(qū)域的PCR擴(kuò)增..........443.3.2牛PE4Ry基因三個(gè)多態(tài)位點(diǎn)PCR-RFLP分析..........463.3.3牛基因三個(gè)多態(tài)位點(diǎn)的群體遺傳學(xué)分析..........483.3.4?；?/p>
8、因三個(gè)位點(diǎn)多態(tài)性與牛經(jīng)濟(jì)性狀關(guān)聯(lián)分析..........513.3.5牛基因三個(gè)多態(tài)位點(diǎn)的連鎖不平衡..........573.3.6討論......
