高郵鴨vldlr基因的序列分析及其多態(tài)性與生長和屠宰性狀的相關(guān)性研究

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1、分類號(hào)學(xué)＾ＭＺ１２５０２ＵＤＣ密級(jí)媛叫義葦祖ＹＡＮＱＺ巧ＱＵＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ含碩去學(xué)佐冷文（專業(yè)型）高郵鴨ＶＬＤＬ民基因的序列分析及其多態(tài)性與生長和屠宰性狀的相關(guān)性研究趙南南２２５００９指導(dǎo)教師姓名，拐州大學(xué)，泣，：張湯杰教授蘇揚(yáng)州申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩壬學(xué)科專業(yè)名稱：獸醫(yī)碩壬論文提交日期：２０１５年４月論文答辯日期：２０１５年６月學(xué)位授予單位：揚(yáng)州大學(xué)學(xué)位授予日期：２０１５年６月答辯委員會(huì)主席：高玉時(shí)論文評(píng)閱人：許小琴歐陽紅生．２０

2、１５年６月高郵鴨ＶＬＤＬ民基因的序列分析及其多態(tài)性與生長和屠宰性狀的相關(guān)性研究ＳｅｕｅｎｃｅａｎａｌｓｉｓｏｆＶＬＤＬＲｅｎｅａｎｄｓｔｕｄｏｎｉｆｓｑｙｇｙｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓａｎｄａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｗｉｔｈｇｒｏｗｔｈａｎｄｃａｒｃａｓｓｔｒａｉｔｓｉｎＧａｏｏｕｄｕｃｋｙ本研究由江蘇高校優(yōu)勢(shì)學(xué)科建設(shè)工程資助項(xiàng)目江蘇省動(dòng)物重要疫病與人獸共患病防控協(xié)同創(chuàng)新中也資助研究生；趙南南導(dǎo)師；張湯杰教授揚(yáng)州大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院二零一五年六月趙南南

3、：高郵鴨ＶＬＤＬ民基因的序列分析及其多態(tài)性與生長和屠宰性狀的相關(guān)性研巧１高郵鴨ＶＬＤＬＲ基因的序列分析及其多態(tài)性與生長和屠宰性狀的相關(guān)性研究中文摘要極低密度脂蛋白受體（Ｖｅｒｙｌｏｗｄｅｎｓｉｔｙｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｒｅｃｅｐｔｏｒ，ＶＬＤＬＲ）是低密度脂蛋白一受體（Ｌｏｗｄｅｎｓｉｔｙｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｒｅｃｅｐｔｏｒ，ＬＤＬＲ）家族的員，能高親和為結(jié)合富含ＡｐｏＥ的脂蛋白參與甘油王脂的代謝。ＶＬＤＬＲ廣泛分布在也臟、骨骼肌、脂肪組織和腦等機(jī)體組織，但是在肝臟中表達(dá)較少。本

4、實(shí)驗(yàn)首先對(duì)高郵鴨ＶＬＤＬＲ基因進(jìn)行了克隆測(cè)序，并利用生物信息學(xué)方法對(duì)該基因的分子特征和結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析和預(yù)測(cè)；然后對(duì)ＶＬＤＬＲ基因序列進(jìn)行多態(tài)性與生長及屠宰性狀的相關(guān)性分析，為高郵鴨的分子育種奠定理論和實(shí)踐基礎(chǔ)。１高郵鴨ＶＬＤＬＲ基因的克隆及序列分析－為探討高郵鴨ＶＬＤＬＲ基因的生物信息學(xué)功能，本研巧采用ＲＴＰＣＲ方法克隆高郵鴨肌肉組織中ＶＬＤＬＲ基因的編碼區(qū)序列，并對(duì)其核巧酸序列和推導(dǎo)的氨基酸序列進(jìn)行了分析。結(jié)果表明；高郵鴨ＶＬＤＬ民基因的編碼區(qū)含有２２４４個(gè)核巧酸，編碼７４７個(gè)氨基酸，Ｇｅｎｂａｎ

5、ｋ登錄號(hào)為ＫＰ３３５１４９；高郵鴨與雜交鴨、雞、牛、人、小鼠、家兔、大鼠、野豬、斑馬魚的ＶＬＤＬＲ基因編碼區(qū)核巧酸序列的同源性分別為９０．９％、８４．５％、７１．３％、７３．３％、７１．８％、７２．１％、７２．１％、７１．７％、６３．２％，高郵鴨ＶＬＤＵＩ基因編碼的氨基酸序列與雜交鴨、雞、牛、人、小鼠、家兔、大鼠、野豬、斑馬魚的同源性分別為９３．７％、９２．５％、７７．９％、〇■７８一．１％、７８．７％、７８．１％、７７．９／〇、７８．５％、６５．９％。高郵鴨ＶＬＤＬＲ蛋白質(zhì)是個(gè)親水１生跨膜蛋白二Ｎ－，在３

6、，其級(jí)結(jié)構(gòu)由ａ螺旋、Ｐ轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲構(gòu)成其胞外區(qū)有個(gè)糖基化位點(diǎn)－和８個(gè)０糖基化位點(diǎn)。信號(hào)化分析表明，ＶＬＤＬＲ蛋白為分泌性蛋白，最有可能的切割位一點(diǎn)位于第％位和３７位氨基酸之間。本研究為進(jìn)步研究鴨ＶＬＤＬ民基因表達(dá)、生物學(xué)活性和應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。２高郵鴨ＶＬＤＬＲ基因的多態(tài)性及其與生長和屠宰性巧的關(guān)聯(lián)分析為研究ＶＬＤＬＲ基因多態(tài)性對(duì)高郵鴨生長發(fā)育和屠宰性狀的遺傳效應(yīng)，本實(shí)驗(yàn)Ｗ２８０只高郵鴨為實(shí)驗(yàn)材料，采用ＤＮＡ測(cè)序技術(shù)對(duì)ＶＬＤＬＲ基因進(jìn)行多態(tài)性檢測(cè)，共篩選出８＞Ａ＞Ｔ＞Ａ－＞Ｔ個(gè)ＳＮＰｓ位點(diǎn)．ｌ６７

7、Ｇ，．２３１Ｃ，．２４３Ｇ，．３％３＾ｉｎｓＣＴ，．３５９ｄｅｌＴ．４９８Ｃ，，ｇｇｇｇｇｇ２揚(yáng)州大學(xué)碩±學(xué)位論文－＞＞Ａｇ．５６３５６４ｉｎｓＧＡ和ｇ．６３１ＧＡ，其中ｇ．２３１ＯＴ和ｇ．２４３Ｇ位點(diǎn)位于編碼區(qū)內(nèi)，為同義突－變：．２３１Ｃ＞、．３５ｉｎｓＣＴ，不引起氨基酸的改變。遺傳多態(tài)性分析結(jié)果表明公鴨的ｇＴｇ６３５７＞（及母鴨的ｇ．６３１ＧＡ位點(diǎn)為低度多態(tài)ＰＩＣ＜０．２５），其余位點(diǎn)均表現(xiàn)為中度多態(tài)２（０．２５＜ＰＩＣ＜０．５）；義適合性檢驗(yàn)顯示，ｇ．４９８Ｃ＞Ｔ和．６３１Ｇ＞Ａ顯著偏離了

8、Ｈａｒｄ－Ｗｅｉｎｂｅｒｇｙｇ＾＞ａｒｄ－Ｗｅｎｂｅｒ平衡（ＰＯ．０５），而其它ＳＮＰ位點(diǎn)服從Ｈｙｉｇ平衡（Ｐ０．０５）?；谶@８個(gè)ＳＮＰｓ８位點(diǎn)，采用Ｐｈａｓｅ軟件共組建了個(gè)單倍型，其中ＨＩ單倍型在公母兩個(gè)群體中所占比例二？最高