陸地棉產(chǎn)量、纖維品質(zhì)性狀與ssr標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析-種業(yè)專業(yè)畢業(yè)論文

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2、會(huì)公眾提供信息服務(wù)。保密論文在解密后應(yīng)遵守此規(guī)定。論文作者簽名:控絲導(dǎo)師簽名:赴日萬方數(shù)據(jù)英文縮略表萬方數(shù)據(jù)目錄中文摘要...IAbstract..II1引言.11.1棉花的遺傳多樣性.11.1.1遺傳多樣性的研究方法一11.1.2遺傳多樣性的研究進(jìn)展一31-2關(guān)聯(lián)分析.41.2.1關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ).41.2.2連鎖不平衡的度量一41.2.3關(guān)聯(lián)分析的優(yōu)勢(shì)一51.2.4關(guān)聯(lián)分析的方法及策略。51.2.5關(guān)聯(lián)分析的影響因素一61.3植物中關(guān)聯(lián)分析的應(yīng)用.71.4關(guān)聯(lián)分析在棉花上的應(yīng)用.91.5本研究的目的意義102材料與方法.102.1植物材料102.2材料種

3、植一112.3表型性狀測(cè)定一1l2.3.1產(chǎn)量及農(nóng)藝性狀112.3.2纖維品質(zhì)的測(cè)定112.4DNA的提取。142.5SSR擴(kuò)增及擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)162.5.1SSR引物的選用162.5.2SSR反應(yīng)體系及擴(kuò)增程序162.5.3電泳.172.5.4銀染.172.6數(shù)據(jù)分析與統(tǒng)計(jì)18萬方數(shù)據(jù)3結(jié)果分析..193.1性狀的方差分析和描述性統(tǒng)計(jì)193.2相關(guān)性分析193.3引物篩選及遺傳多樣性分析263.4聚類分析263.5群體結(jié)構(gòu)分析273.6性狀和標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析..303.7表型效應(yīng)分析及優(yōu)異等位變異發(fā)掘324討j蹌..444.1群體結(jié)構(gòu)與關(guān)聯(lián)分析444.2表型

4、性狀與標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析454-3優(yōu)異關(guān)聯(lián)位點(diǎn)及等位變異..465結(jié)論一47參考文獻(xiàn)48致謝53攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文.54Il萬方數(shù)據(jù)山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要棉花是我國(guó)重要的天然纖維作物。提高產(chǎn)量、改善品質(zhì)是棉花育種的重要目標(biāo)。發(fā)掘與產(chǎn)量和纖維品質(zhì)關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記,對(duì)于提高棉花育種效率具有重要意義。本研究開展了陸地棉產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析,以期發(fā)掘與重要性狀關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記和重要的等位變異及優(yōu)異種質(zhì)資源,為棉花分子標(biāo)記輔助育種提供依據(jù)。主要結(jié)果如下:1.對(duì)209份供試材料進(jìn)行了2年的表型鑒定,發(fā)現(xiàn)性狀的變異系數(shù)范圍為O.89%.

5、23.59%,平均變異系數(shù)為7.45%。結(jié)果表明供試材料在14個(gè)產(chǎn)量和品質(zhì)性狀上具有較大的表型多樣性。2.利用218對(duì)SSR引物進(jìn)行了遺傳多樣性分析,在209份材料中檢測(cè)到841個(gè)等位變異,平均單個(gè)引物檢測(cè)到3.86個(gè)等位變異。平均基因多樣性指數(shù)為O.45,多態(tài)信息含量(PIC)的變異范圍O.02.0.75,平均為O.38。表明材料問在分子水平具有有豐富的遺傳多樣性。3.通過STRUCTURE2.3.1軟件進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)分析,將209份供試材料劃分到POP.1、POP.2和POP一3三個(gè)亞群,分別包含44份、72份和93份材料?;贜ei的遺傳距離的聚類分析

6、也將209份材料劃分為三個(gè)亞群,與群體結(jié)構(gòu)分析結(jié)果具有一致性。4.基于GLM模型的關(guān)聯(lián)分析,共檢測(cè)到與14個(gè)性狀相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)167個(gè),其中64個(gè)與產(chǎn)量相關(guān)性狀相關(guān)聯(lián),103個(gè)與纖維品質(zhì)性狀相關(guān)聯(lián)。在這些位點(diǎn)中,45個(gè)SSR位點(diǎn)同時(shí)與兩個(gè)或兩個(gè)以上的性狀顯著相關(guān)聯(lián)。5.對(duì)穩(wěn)定關(guān)聯(lián)的標(biāo)記位點(diǎn)進(jìn)行了優(yōu)異等位基因分析,發(fā)掘出一批優(yōu)異等位基因位點(diǎn)和攜帶這些優(yōu)異等位基因的載體材料。研究結(jié)果為進(jìn)一步開展棉花產(chǎn)量和纖維品質(zhì)的精細(xì)定位、分子標(biāo)記輔助育種提供參考。關(guān)鍵詞:陸地棉;產(chǎn)量;纖維品質(zhì);SSR;關(guān)聯(lián)分析萬方數(shù)據(jù)陸地棉產(chǎn)量、纖維品質(zhì)性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析Abstra

7、ctCottonisarlimportantnaturalfibrecropinChina.Developmentofvarietieswithhighyieldandgoodfiberqualityisanimportanttargetincottonbreedingprogram.Identificationoflinkedmolecularmarkersforsubsequentmarkerassistedbreedingisessentialtoimprovebreedingefficiencyespeciallyforyieldandfiberq

8、uality,whichwerecontrolledbymulti

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