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《陸地棉農(nóng)藝性狀與ssr標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、棉花學(xué)報CottonScience2014袁26淵5冤院387~395陸地棉農(nóng)藝性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析1,222221,2*梁冰袁范術(shù)麗袁宋美珍袁龐朝友袁魏恒玲袁喻樹迅(1.西北農(nóng)林科技大學(xué)農(nóng)學(xué)院袁陜西楊凌712100曰2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所/棉花生物學(xué)國家重點實驗室袁河南安陽455000)摘要院利用關(guān)聯(lián)分析方法以160對SSR引物對68份陸地棉品種2個播期組成的自然群體進(jìn)行基因型檢測袁在利用STRUCTURE2.3.4軟件分析群體結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上袁采用TASSEL4.0軟件的GLM程序和MLM程序?qū)?7
2、個農(nóng)藝性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析遙結(jié)果顯示袁STRUCTURE群體結(jié)構(gòu)分析將68份供試材料劃分為3個亞群袁基于Nei's遺傳距離的聚類分析也將68份供試材料劃分為3個亞群袁與群體結(jié)構(gòu)劃分結(jié)果基本一致遙6個SSR位點均能通過GLM和MLM程序檢測到袁且在2個播期下穩(wěn)定出現(xiàn)袁其中袁CER0098-400與全生育期顯著關(guān)聯(lián)袁DPL0375-250和HAU2414-147與果枝始節(jié)顯著關(guān)聯(lián)袁DPL0504-135堯HAU0883-120和NAU1298-524與衣分顯著關(guān)聯(lián)遙本研究結(jié)果為棉花分子標(biāo)記輔助選擇提供了依據(jù)遙關(guān)鍵詞院陸
3、地棉曰早熟性曰產(chǎn)量性狀曰纖維品質(zhì)曰關(guān)聯(lián)分析中圖分類號院S562.035.2文獻(xiàn)標(biāo)志碼院A文章編號院1002-7807(2014)05-0387-091,222221,2*LiangBing,FanShuli,SongMeizhen,PangChaoyou,WeiHengling,YuShuxun(1.712100,;2.,455000,)Inthisstudy,68samplesofuplandcottonsowedontwodifferentdateswerescannedusing160pairsofSSR
4、primerstoperformassociationanalysisof17agronomictraits,includingthoserelatedtoearlymaturity,yieldandfiberquality,whicharemostlyquantitativetraits.STRUCTURE2.3.4softwarewasusedtoestimatethepopulationstructureofthe68varieties,whichcouldbedividedintothreesubgro
5、ups.ClusteranalysisbasedonNei'sgeneticdistancewasalmostidenticaltothatthe68sam-plescouldbedividedintothreesubgroups.Usinggenerallinearmodel(GLM)andmixedlinearmodel(MLM)toperformasso-ciationanalysisbyTASSEL4.0software,sixSSRlociweredetectedatthetwosowingdates
6、,ofwhichCER0098-400isex-tremelysignificantlyassociatedwithgrowthstage,DPL0375-250andHAU2414-147areextremelysignificantlyassociatedwithlocationofthefirstbranch,threeSSRloci,DPL0504-135,HAU0883-120andNAU1298-524,wereextremelysignificantlyasso-ciatedwithlintper
7、centage.Thisresearchprovidesthebasesformarker-assistedselection(MAS)inuplandcottonbreeding.uplandcotton;earlymaturity;yieldtraits;fiberquality;associationanalysis棉花是一種重要的經(jīng)濟作物袁培育早熟堯豐助選擇袁可以大幅度提高育種效率遙產(chǎn)和優(yōu)質(zhì)的棉花品種是目前棉花育種的主要目目前袁研究植物數(shù)量性狀的方法有基于遺傳標(biāo)遙棉花早熟堯產(chǎn)量以及纖維品質(zhì)性狀都是數(shù)量連
8、鎖的QTL作圖分析和基于連鎖不平衡(Link-性狀袁受多個數(shù)量性狀基因位點淵Quantitativetraitagedisequilibrium,LD)的關(guān)聯(lián)分析遙關(guān)聯(lián)分析locus袁QTL冤控制袁遺傳機理復(fù)雜且易受環(huán)境因素(Associationanalysis)是一種將標(biāo)記或者候選基因影響遙因此袁傳統(tǒng)育種方法進(jìn)展緩慢袁效率低遙利的等位基因變異與目標(biāo)性狀表型聯(lián)系起來的分[1]用與QT
