去勢大鼠骨質(zhì)疏松癥基因表達(dá)譜特征初步研究

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1、去勢大鼠骨質(zhì)疏松癥基因表達(dá)譜特征初步研究摘要:目的探討去勢大鼠骨質(zhì)疏松癥與正常大鼠基因表達(dá)譜的差異,初步分析去勢大鼠骨質(zhì)疏松癥基因表達(dá)譜的特征。方法應(yīng)用基因芯片技術(shù)檢測去勢大鼠骨質(zhì)疏松癥與正常大鼠相關(guān)基因的表達(dá),通過GeneOntology(GO)數(shù)據(jù)庫對差異表達(dá)基因進(jìn)行基因信息學(xué)分析,運(yùn)用AgilentGeneSpringGX11軟件對差異基因進(jìn)行GO分析。結(jié)果去勢大鼠骨質(zhì)疏松癥共有118條基因發(fā)生了差異表達(dá),其中有48條基因上調(diào),70條基因下調(diào)。結(jié)論多種基因表達(dá)異常與去勢大鼠骨質(zhì)疏松癥相關(guān)。關(guān)鍵詞:去勢大鼠;骨質(zhì)疏松;基因表達(dá)譜D

2、0I:10.3969/j.issn.1005-5304.2012.12.011中圖分類號:R446文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號:1005-5304(2012)12-0029-03PreliminaryAnalysisonGeneExpressionProfilesofOsteoporosisinOvariectomizedRatsGAOFengl,M0Xin-minl,LIJin-ping2,LIUShi-jiel,ZHANGXiao-junl(1.HunanUniversityofTCM,Changsha410007,China;2.Co

3、llegeofPharmacy,CentralSouthUniversity,Changsha410013,China)Abstract:ObjectiveToinvestigatethedifferenceofthegeneexpressionprofilebetweenosteoporosisofovariectomizedratsandnormalrats,andanalyzethecharactersofthegeneexpressionprofileoftheosteoporosisofovariectomizedrats.

4、MethodThegeneexpressiondifferencebetweenosteoporosisofovariectomizedratsandnormalratswastestedbyusingcDNAmicroarraytechnology.ThegeneinformationofthegeneexpressiondifferencewasanalyzedinGenethem,48geneswereupregulated,70weredownregulated?ConclusionManyabnormalgenesexpre

5、ssionrelatedwithosteoporosisinovariectomizedrats?Ontology(GO)database,analyzedbyGOanalysisGenespringGX11.ResultsdifferentiallyexpressedandthedifferentgeneswereusingthesoftwareAgilentAtotalof118significantgenesweredetected,amongKeywords:ovariectomizedrats;osteoporosis;ge

6、neexpressionprofiles骨質(zhì)疏松癥(osteoporosis,OP)是以骨量減少、骨的微觀結(jié)構(gòu)退化為特征,骨的脆性增加易于發(fā)生骨折的一種疾病。骨質(zhì)疏松癥的發(fā)生、發(fā)展是一個(gè)復(fù)雜過程,其演化過程涉及大量的基因突變、缺失、擴(kuò)增及失活等異常表達(dá)信息,因此,發(fā)揮基因芯片技術(shù)多樣本、高通量、高效率和平行監(jiān)測識(shí)別功能,對闡明骨質(zhì)疏松癥的病因,揭示其發(fā)病機(jī)制以及開辟新的診斷途徑和治療方法有廣闊前景。本研究利用大鼠全基因組微珠芯片初步探討0P基因表達(dá)譜系的變化,并對差異表達(dá)基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,以探討原發(fā)性骨質(zhì)疏松癥的發(fā)生機(jī)制。1材料

7、與方法1.1動(dòng)物采用3月齡SD雌性大鼠20只,體質(zhì)量250g左右,SPF級。飼料為標(biāo)準(zhǔn)普通飼料,湖南中醫(yī)藥大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心提供,許可證號:SCXK(湘)2009-0004o1.2試劑RatRef-12_Vl5590097019大鼠全基因組微珠芯片,美國Illumina公司制作;Cy3AmershampharmaliaEiotech;反轉(zhuǎn)錄酶(SuperscriptII),GibcoBRL;Oligo(dt)18,生研(上海)基金項(xiàng)目:國家自然科學(xué)基金(30873291)通訊作者:莫新民,Tel:0731-85539630,E-mail

8、:moxinmin52@hotmail.com生物科技有限公司;dNTP,PROMEGAo1.3主要儀器電動(dòng)玻璃勻漿機(jī),DY89-1,寧波新芝科器研究所;電泳儀FR-280,上海復(fù)日科技凝膠成像儀FR-200,上海復(fù)日科

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