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《川牛膝全基因組高通量測(cè)序及初步數(shù)據(jù)分析》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、萬(wàn)方數(shù)據(jù)SichuanAgriculturalUniversityMasterDissertationCyathulaOfficinalisKuanHigh-·throughputGenomeSequencingandPreliminaryDataAnalysisBy物nShenDirectedbyProf．TianMengliang(Genetics)Chengdu611130，Sichuan,P．RChinaJune，2014萬(wàn)方數(shù)據(jù)論文獨(dú)創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明：所呈交的學(xué)位論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行研究工
2、作所取得的成果。盡我所知，除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，學(xué)位論文中不包含其他個(gè)人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫(xiě)過(guò)的研究成果，也不包含為獲得四川農(nóng)業(yè)大學(xué)或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書(shū)所使用過(guò)的材料。與我一同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均己在論文中作了明確的說(shuō)明并表示了謝意。研究生簽名：ia槳≥D／爭(zhēng)年參月，z-日關(guān)于論文使用授權(quán)的聲明本人完全了解四川農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，即：學(xué)校有權(quán)保留并向國(guó)家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版，允許論文被查閱和借閱，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)
3、位論文。同意四川農(nóng)業(yè)大學(xué)可以用不同方式在不同媒體上發(fā)表、傳播學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容。研究生簽名：i穗，導(dǎo)師簽名：YD膨年g月，2日圳諺年6其
4、埔萬(wàn)方數(shù)據(jù)摘要J11牛膝(CyathulaofficinaiisKuan)是中國(guó)傳統(tǒng)唪藥材之一，也是莧科杯莧屬植物中唯一在我國(guó)被大規(guī)模人工種植、開(kāi)發(fā)利用的品種。但是，同其它中藥植物一樣，目前對(duì)川牛膝的研究仍主要集中在化學(xué)成分、品質(zhì)監(jiān)測(cè)、藥理活性等方面，使用研究手段也仍然停留在實(shí)驗(yàn)生物學(xué)階段，急需從更深入的角度進(jìn)行研究和探索。目前高通量測(cè)序技術(shù)作為基因組學(xué)最重要的研究技術(shù)
5、之一，被大量應(yīng)用于作物研究方面。但是，由于其程序復(fù)雜，投入大，對(duì)于大量類似于川牛膝等藥用植物來(lái)說(shuō)，進(jìn)行傳統(tǒng)的高通量測(cè)序，完成整個(gè)流程需要耗費(fèi)大量的資金。以目前我國(guó)實(shí)際經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展水平和產(chǎn)業(yè)基礎(chǔ)來(lái)考慮，缺乏推廣應(yīng)用價(jià)值。因此，開(kāi)發(fā)藥用植物簡(jiǎn)化基因組從頭測(cè)序流程，并評(píng)價(jià)其實(shí)際結(jié)果、考察其應(yīng)該用推廣價(jià)值具有了重大的研究意義。本研究通過(guò)小深度高通量測(cè)序及后續(xù)數(shù)據(jù)處理及分析，建立起了一套數(shù)據(jù)預(yù)處理技術(shù)。此外，還探索了不同數(shù)據(jù)組裝方法對(duì)川牛膝小深度全基因組從頭測(cè)序拼裝結(jié)果的影響，并在最終數(shù)據(jù)中對(duì)影響』tl-牛膝品質(zhì)的關(guān)鍵化
6、合物合成通路上的相關(guān)基因進(jìn)行了電子克隆。關(guān)鍵詞：川牛膝、基因組、高通量測(cè)序、杯莧甾酮萬(wàn)方數(shù)據(jù)AbstractCyathulaofficinalisKuani§OneoftraditionalcNneseherbsandtheonlyoneofcultivarsofAmaranthaceaeinchina，whichhavebeenwidelyplantedandwelldeveloped．Liketherraditionalchineseherbs，somemoredeeperstudiesareurgentl
7、yneedtoexploreinCyathulaofficinalisKuan，apartfromchemicalandactivityanalysis．Asoneofmaintechniquesofgenomics，thenextgenerationsequence(NGS)hasbeenwidelyappliedincropresearchbutrarelyinherbsincludeofCyathulaofficinalisKuan．Becauseitismoney．wastefulforthebigge
8、stdevelopingcountrywhichhasmorethantenthousandherbs．Inthisthesis，anewdataanalysismethodhasbeenproposedbaseonasimple，economicNGSandcomparedthedifferentinfluencebetweennewmethodandconventionalmethods．Moreover，somegenesthatmaycontrolCyasteronesynthesisarebepoin
9、tout．Keywords：CyathulaofficinalisKuan；genome；NGS；Cyasterone2萬(wàn)方數(shù)據(jù)目錄1文獻(xiàn)綜述??????????????．11．1川牛膝相關(guān)研究綜述????????????????．11．1．1資源現(xiàn)狀???????????????????．i1．1-2化學(xué)成分???????????????????．21．1．3藥用價(jià)值????????
