玉米種子萌發(fā)相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析

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1、作物學(xué)報ActaAgronomicaSinicaISSN0496-3490,CN11-1809/S《作物學(xué)報》網(wǎng)絡(luò)首發(fā)論文題目：玉米種子萌發(fā)相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析作者：田潤苗，張雪海，湯繼華，白光紅，付志遠(yuǎn)收稿日期：2017-11-02網(wǎng)絡(luò)首發(fā)日期：2018-03-16引用格式：田潤苗，張雪海，湯繼華，白光紅，付志遠(yuǎn)．玉米種子萌發(fā)相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析．作物學(xué)報.http://kns.cnki.net/kcms/detail/11.1809.S.20180316.0917.006.html網(wǎng)絡(luò)首發(fā)：在編輯部工作流程中，稿件從錄用到出版要經(jīng)歷錄用定稿、排版定稿、整期匯編定稿等階段。錄用定

2、稿指內(nèi)容已經(jīng)確定，且通過同行評議、主編終審?fù)饪玫母寮?。排版定稿指錄用定稿按照期刊特定版式（包括網(wǎng)絡(luò)呈現(xiàn)版式）排版后的稿件，可暫不確定出版年、卷、期和頁碼。整期匯編定稿指出版年、卷、期、頁碼均已確定的印刷或數(shù)字出版的整期匯編稿件。錄用定稿網(wǎng)絡(luò)首發(fā)稿件內(nèi)容必須符合《出版管理?xiàng)l例》和《期刊出版管理規(guī)定》的有關(guān)規(guī)定；學(xué)術(shù)研究成果具有創(chuàng)新性、科學(xué)性和先進(jìn)性，符合編輯部對刊文的錄用要求，不存在學(xué)術(shù)不端行為及其他侵權(quán)行為；稿件內(nèi)容應(yīng)基本符合國家有關(guān)書刊編輯、出版的技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)，正確使用和統(tǒng)一規(guī)范語言文字、符號、數(shù)字、外文字母、法定計量單位及地圖標(biāo)注等。為確保錄用定稿網(wǎng)絡(luò)首發(fā)的嚴(yán)肅性，錄用定稿一經(jīng)發(fā)布，不得修

3、改論文題目、作者、機(jī)構(gòu)名稱和學(xué)術(shù)內(nèi)容，只可基于編輯規(guī)范進(jìn)行少量文字的修改。出版確認(rèn)：紙質(zhì)期刊編輯部通過與《中國學(xué)術(shù)期刊（光盤版）》電子雜志社有限公司簽約，在《中國學(xué)術(shù)期刊（網(wǎng)絡(luò)版）》出版?zhèn)鞑テ脚_上創(chuàng)辦與紙質(zhì)期刊內(nèi)容一致的網(wǎng)絡(luò)版，以單篇或整期出版形式，在印刷出版之前刊發(fā)論文的錄用定稿、排版定稿、整期匯編定稿。因?yàn)椤吨袊鴮W(xué)術(shù)期刊（網(wǎng)絡(luò)版）》是國家新聞出版廣電總局批準(zhǔn)的網(wǎng)絡(luò)連續(xù)型出版物（ISSN2096-4188，CN11-6037/Z），所以簽約期刊的網(wǎng)絡(luò)版上網(wǎng)絡(luò)首發(fā)論文視為正式出版。網(wǎng)絡(luò)首發(fā)時間：2018-03-1611:08:40網(wǎng)絡(luò)首發(fā)地址：http://kns.cnki.net/kcms/

4、detail/11.1809.S.20180316.0917.006.html玉米種子萌發(fā)相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析1,**1,**121,*田潤苗張雪海湯繼華白光紅付志遠(yuǎn)12河南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院，河南鄭州450002;新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)，新疆烏魯木齊830052摘要:種子萌發(fā)是出苗的前提，對玉米產(chǎn)量影響重大。為了解玉米種子萌發(fā)相關(guān)性狀的遺傳機(jī)制，本研究對476份玉米自交系種子萌發(fā)相關(guān)的6個性狀進(jìn)行調(diào)查，結(jié)合125萬(1.25M)SNP標(biāo)記，利用3種統(tǒng)計模型(Q,K,Q+K)進(jìn)行全基因關(guān)聯(lián)分析(GWAS)。結(jié)果表明K模型能夠較好地評價吸脹前重量、吸脹前體積、吸脹后重量、吸脹后體積和吸脹體積5個性狀;Q

5、+K模型能更好地評價吸脹重量性狀?；谶@6個性狀的最優(yōu)模型的GWAS結(jié)果，共檢測到15個種子萌發(fā)相關(guān)性狀的顯著SNP，15個SNP對應(yīng)6個QTL，集中分布在玉米第3、第6、第7和第10染色體上，QTL內(nèi)單個SNP能解釋的表型變異為5.09%~7.85%。其中5個QTL可在多個生物學(xué)重復(fù)中被檢測到。以最顯著SNP所在基因或附近基因作為QTL的候選基因，共篩選到6個最可能的候選基因。GRMZM2G148411是吸脹后重量、吸脹重量和吸脹體積3個性狀共同鑒定到的QTL候選基因，根據(jù)基因的功能注釋，該基因編碼一個包含TLD-domain的鈣離子結(jié)合蛋白，可能是一種調(diào)控種子休眠與萌發(fā)的信號分子。本研究鑒

6、定的QTL為解析玉米種子萌發(fā)的遺傳機(jī)制和相應(yīng)功能標(biāo)記的開發(fā)奠定了基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞:玉米;種子萌發(fā);全基因組關(guān)聯(lián)分析;候選基因Genome-wideAssociationStudiesofSeedGerminationRelatedTraitsinMaize1,**1,**121,*TIANRun-Miao,ZHANGXue-Hai,TANGJi-Hua,BAIGuang-Hong,andFUZhi-Yuan12CollegeofAgronomy,HenanAgriculturalUniversity,Zhengzhou450002,China;XinjiangAgriculturalUnivers

7、ity,Urumqi830052,Xinjiang,ChinaAbstract:Germinationisimportantforseedemergence,whichhassignificantimpactonmaizeyield.Torevealthegeneticmechanismofmaizeseedgermination,weinvestigatedsixtraitsrelatedtos