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《玉米苗期耐低磷相關(guān)性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、萬方數(shù)據(jù)SichuanAgriculturalUniversityMASTERDissertationGenome--wideassociationanalysisofmaizetraitsatseedlingstageunderlowphosphorusconditionByZhangLi-TianDirectedby:ProfessorRongTing-ZhaoProfessorLuYan.LiMajor:CropGeneticsandBreedingDirection:MaizeGeneticsandBreedingMay,2014ChengDu,SiChuan論文獨創(chuàng)性聲明㈣
2、嬲萬方數(shù)據(jù)本人鄭重聲明:所呈交的學(xué)位論文是我個人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行研究工作所取得的成果。盡我所知,除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,學(xué)位論文中不包含其他個人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包含為獲得四川農(nóng)業(yè)大學(xué)或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書所使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻(xiàn)均己在論文中作了明確的說明并表示了謝意。研究生簽名:弘矽夭山(v年舌月/。日關(guān)于論文使用授權(quán)的聲明本人完全了解四川農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,即:學(xué)校有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版,允許論文被查閱和借閱,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。
3、同意四川農(nóng)業(yè)大學(xué)可以用不同方式在不同媒體上發(fā)表、傳播學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容。
4、酗本論文不保密??诒菊撐谋C?,在一年解密后適用本授權(quán)。(請在以上口內(nèi)劃“√’’)研究生簽名:導(dǎo)師簽名:象矽云字托碭山I中年‘月rD日矽,妒年易月,7.-日萬方數(shù)據(jù)摘要缺磷是當(dāng)今發(fā)展玉米生產(chǎn)所面臨的限制因素之一。玉米耐低磷分子標(biāo)記輔助育種是提高玉米品種耐低磷能力,減少低磷造成產(chǎn)量損失的有效途徑。近年來,大量研究表明,在表型鑒定的基礎(chǔ)上,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析可有效地鑒定和分離耐低磷相關(guān)基因。本研究在低磷脅迫和正常供磷條件下,對456份玉米自交系苗期性狀進(jìn)行表型與遺傳評價,并運用全基因組關(guān)聯(lián)分析發(fā)掘應(yīng)答低磷脅迫
5、的候選基因。主要研究結(jié)果如下:1、對456份自交系進(jìn)行低磷和正常供磷條件下的沙培試驗,方差分析表明:相同處理下不同白交系間的差異以及白交系在不同處理間的差異均達(dá)到極顯著水平。不同性狀間遺傳率估計存在明顯差異,其中干重具有較高遺傳率,而廣泛使用的耐低磷評價指標(biāo)根冠比的遺傳率不高。利用綜合指數(shù)可以將供試材料劃分為低磷敏感、中等耐低磷和高耐低磷的3個類群。低磷條件下3個類群的異速分配指數(shù)k不斷增高,而正常供磷條件下k值保持恒定。根據(jù)耐低磷的選擇指標(biāo)建立的多元逐步回歸模型,在低磷和正常供磷條件下可以分別解釋總干重變異的67.8%和76.8%。利用聯(lián)合干重的耐低磷指數(shù)與綜合指數(shù)的標(biāo)準(zhǔn),共篩選出
6、23份高耐低磷和109份低磷敏感的玉米白交系,可用于今后玉米耐低磷的遺傳改良。2、利用IlluminaSNP50芯片對供試材料進(jìn)行基因型鑒定,共獲得50761個高質(zhì)量和高多態(tài)性SNP標(biāo)記,用于后續(xù)全基因組關(guān)聯(lián)分析。關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明:在P≥4.71的顯著水平下,檢測到44個SNP標(biāo)記與低磷脅迫下的15個性狀關(guān)聯(lián);在正常供磷條件下,檢測到62個SNP標(biāo)記與16個性狀顯著關(guān)聯(lián)。這些顯著的SNP標(biāo)記所能解釋的表型變異在4.87.7.71%范圍內(nèi)。3、利用NCBI、MaizeGDB等數(shù)據(jù)庫進(jìn)行基因序列比對,將定位到的候選基因進(jìn)行功能分析。結(jié)果表明,4個目標(biāo)基因在植物耐低磷中發(fā)揮重要功能,包括生
7、長素響應(yīng)因子(auxinresponsefactor)、生長素響應(yīng)蛋白(AUX/IAAprotein)、ADP.核糖基化因子(ADP-ribosylationfactor)、MYB轉(zhuǎn)錄因子(MYBfamilytranscriptionfactor)。關(guān)鍵詞:玉米,苗期,低磷,關(guān)聯(lián)分析萬方數(shù)據(jù)AbstractPhosphorus(P)deficiencyisoneofthemajorlimitingfactorsinmaizeproduction.Molecularbreedingisaneffectivewaytoimprovemaizeresistlowphosphoruscond
8、itionandreducetheyieldlossescausedbylowphosphorus.Inrecentyears,manyresearchesindicatedthatwholegenomicswhichwasusedtogeneassociationanalysishadbeenaneffectivemethodforlowphosphorusresistancegeneisolationandidentification.Inourres