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《玉米穗行數(shù)全基因組關聯(lián)分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關內容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、作物學報ACTAAGRONOMICASINICA2014,40(1):1?6http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2014.00001玉米穗行數(shù)全基因組關聯(lián)分析**張煥欣翁建峰張曉聰劉昌林雍洪軍郝轉芳李新海中國農(nóng)業(yè)科學院作物科學研究所/作物分子育種國家工程實驗室,北京100081摘要:穗行數(shù)是玉米產(chǎn)量的重要組成性狀,其遺傳解析對高產(chǎn)育種具有指導意義。本文以203份主要玉米自交系為材料,2007年在新疆烏魯木齊、吉林公主嶺
2、和海南三亞進行穗行數(shù)測定;采用分布于玉米基因組的41101個單核苷酸多態(tài)性(SNP)標記對穗行數(shù)進行關聯(lián)分析。共鑒定出9個與穗行數(shù)顯著關聯(lián)(P<0.0001)的SNP,分別位于染色體框1.02、1.10、7.03、8.02、9.06和10.03。8個SNP位于已定位的數(shù)量性狀座位(QTL)區(qū)間內。在顯著SNP位點LD區(qū)域內發(fā)掘出4個候選基因,分別編碼含F(xiàn)-box結構域的生長素受體蛋白、玉米kn1蛋白、AP2結構域蛋白和富亮氨酸重復的跨膜蛋白激酶。采用全基因組關聯(lián)分析策略發(fā)掘穗行數(shù)基因位點及候選基因,將為克隆控制玉米產(chǎn)量性狀基因奠定基礎。關鍵詞:玉米;穗行數(shù);全基因組關聯(lián)分析;候選基因Gen
3、ome-wideAssociationAnalysisofKernelRowNumberinMaize*ZHANGHuan-Xin,WENGJian-Feng,ZHANGXiao-Cong,LIUChang-Lin,YONGHong-Jun,HAO*Zhuan-Fang,andLIXin-HaiInstituteofCropScience,ChineseAcademyofAgriculturalSciences/NationalEngineerLaboratoryofCropMolecularBreeding,Beijing100081,ChinaAbstract:Kernelrownum
4、ber(KRN)isoneofgrainyieldcomponentsinmaize(ZeamaysL.).Investigationofitsgeneticarchi-tecturewillhelpdevelophigh-yieldvarietiesinmaize.Inthisstudy,theKRNinapanelof203maizeinbredlineswasdetectedinUrumqiofXinjiang,GongzhulingofJilin,andSanyaofHainanin2007,andusedtoperformthegenome-wideanalysisforKRNu
5、singMaizeSNP50BeadChip.AtotalofnineSNPswerefoundtobesignificantlyassociatedwithKRNatathresholdofP<0.0001,whichwereonchromosomeBins1.02,1.10,7.03,8.02,9.06,and10.03,respectively.EightoftheseSNPswerelocatedintheQTLintervalsreportedpreviously.Meanwhile,fourcandidategeneswerescanned,encodingauxinsigna
6、lingF-boxcontainingprotein,kn1protein,AP2domaincontainingproteinandleucine-richrepeattransmembraneproteinkinaserespectively.Insum-mary,theseidentifiedgenesandSNPswillofferessentialinformationforcloningyield-relatedgenesinmaize.Keywords:Maize;Kernelrownumber;Genome-wideassociationanalysis;Candidate
7、gene玉米穗行數(shù)(kernelrownumber,KRN)形成于小的294份重組自交系(recombinantinbredline,RIL)[1]穗分化期,由小穗成對分生組織數(shù)目決定。穗行數(shù)群體檢測出13個穗行數(shù)QTL,分別位于第1、第3、[5]是決定玉米產(chǎn)量的主要構成因素,屬于數(shù)量性狀,第4、第5、第8、第9和第10染色體。Lu等利[2]廣義遺傳力較高,其遺傳解析對玉米高產(chǎn)育種具用掖478×丹340的150個F2:3
