豬背最長肌中肌肉生長和脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達(dá)和主成分分析

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1、ISSN100727626中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報2008年1月CN1123870PQChineseJournalofBiochemistryandMolecularBiology24(1):46~54豬背最長肌中肌肉生長和脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達(dá)和主成分分析1)1)31)2)2)1)1)李明洲,李學(xué)偉,朱礪,滕曉坤,肖華勝,李強(qiáng),陳磊(1)2)四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院,雅安625014;生物芯片上海國家工程研究中心,上海201203)摘要骨骼肌細(xì)胞和脂肪細(xì)胞在分化生長速度上相對競爭的平衡點(diǎn)是豬肉質(zhì)和胴體性狀的決定因素.利用O

2、ligo功能分類芯片檢測了瘦肉型的長白豬和脂肪型的太湖豬在初生、1、2、3、4和5月齡間背最長肌中肌肉生長和脂肪沉積相關(guān)基因的動態(tài)表達(dá)變化.差異表達(dá)分析結(jié)果顯示,在初生至5月齡的品種間分別有15、16、11、13、18和20個基因的表達(dá)差異倍數(shù)大于2倍.品種內(nèi)的方差分析表明,長白豬分別有18和22個基因,太湖豬分別有3和7個基因在月齡間的表達(dá)差異達(dá)極顯著(P<0101)和顯著水平(P<0105).主成分分析結(jié)果顯示,先降后升是兩品種內(nèi)最具代表性的基因表達(dá)模式,且長白豬和太湖豬分別有7和6個基因的表達(dá)模式明顯偏離其他基因,提示其可能

3、受到了重要的調(diào)控.此外,5個差異表達(dá)基因的熒光定量RT2PCR驗證結(jié)果均與芯片結(jié)果呈正相關(guān)趨勢.以上結(jié)果篩選出了對于豬肉質(zhì)和胴體性狀可能具有重要影響,值得深入研究的一些候選基因,為深入研究生長發(fā)育過程中參與肌纖維生長和脂肪酸合成關(guān)鍵基因的表達(dá)變化規(guī)律和互作調(diào)控機(jī)制提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù).關(guān)鍵詞豬;基因芯片;肌肉;脂肪;基因差異表達(dá);主成分分析中圖分類號Q756DifferentialExpressionandPrincipalComponentAnalysisofGenesRelatedtoMuscleGrowthandAdiposeDe

4、positioninPorcineLongissimusDorsiMuscle1)1)31)2)2)LIMing2Zhou,LIXue2Wei,ZHULi,TENGXiao2Kun,XIAOHua2Sheng,1)1)LIQiang,CHENLei(1)CollegeofAnimalScienceandTechnology,SichuanAgriculturalUniversity,Ya’an625014,Sichuan,China;2)NationalEngineeringCenterforBiochipatShanghai,S

5、hanghai201203,China)AbstractThecompetitiveequilibriumofgrowthrateofskeletalmusclecellsandadiposecellsdeterminesporcinemeatqualityandcarcasstraitssimultaneously.Theexpressionchangesofgenesassociatedwithmusclegrowthandadiposedepositioninlongissimusdorsimuscleatsixgrowth

6、stages(birth,1,2,3,4and5months)ofLandraceandTaihupigswereexaminedbyusingpathway2focusedOligomicroarray.Thecomparativeresultsofchangeratiosbetweentwopigbreedsshowedthatthefoldchangesof15,16,11,13,收稿日期:2007208202,接受日期:2007209226教育部長江學(xué)者和創(chuàng)新團(tuán)隊發(fā)展計劃項目(No.IRT055526)、教育部高等學(xué)校博士

7、學(xué)科點(diǎn)專項基金項目(No.20060626003)、四川省教育廳自然科學(xué)重點(diǎn)科研項目(No.2006D004)和四川省教育廳青年基金項目(No.2006B004)資助3聯(lián)系人Tel:083522886000,E2mail:lixuewei9125@126.comReceived:August2,2007;Accepted:September26,2007SupportedbyProgramforChangjiangScholarsandInnovativeResearchTeaminUniversityofChineseMinis

8、tryofEducation(No.IRT055526),SpecializedResearchFundfortheDoctoralProgramofHigherEducationofChina(No.20060626003),MajorProje

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