沙子嶺豬和大白豬背最長肌轉(zhuǎn)錄組與蛋白組研究

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1、博：ｉｒ?qū)W位論文沙子齡豬和大白豬背最長肌轉(zhuǎn)錄組與蛋白組硏究研究生姓名楊祗指導(dǎo)教師馬海明教授學(xué)科專業(yè)動物遺傳育種與繁殖硏究方向豬的分子遺傳學(xué)二〇—五年六月分類號密級ＵＤＣ單位代碼顯齋《皮丈＃博±學(xué)位論文沙子嶺豬和大白豬背最長肌轉(zhuǎn)錄組與蛋白組研究ＴｍｎｓｃｒｉｔｏｍｅａｎｄＰｒｏｂｏｍｅＳｔｕｄｏｎｐｙＬｏｎｇｉｓｓｉｍｕｓＤｏｒｓｉＭｕｓｃｌｅＢｅｔｗｅｅｎＳｈａｚｉｌｉｎｇａｎｄＹｏｒｋｓｈｉｒｅＰ

2、ｉｓｇ研究生姓名楊虎指導(dǎo)教師馬海明教授學(xué)科專業(yè)動物遺傳育種與繁殖研究方向豬的分子遺傳學(xué)論義答辯日期２０１５年６月１１日答辯委員會主席王曉清論文評閱人姜運良楊官品陳平王賢純李加琪二〇—五年六月獨創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的論文是我個人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的硏究工作及取得的研究成果。盡我所知，除了文中特別加Ｗ標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含為獲得湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)或其它教育機構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料一同工作的同志

3、對本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明。與我確的說明并表示了謝意。＇？／：時間研究生簽名氣枉瓜：＞１＾年少月｜７曰關(guān)于論文使用授權(quán)的說明本人完全了解源南農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，目Ｐ：學(xué)校有權(quán)保留送交論文的復(fù)印件和磁盈，允許論文被查閱和借闊，可采用影印、縮印或掃描等復(fù)＾制手段保存、匯編學(xué)位論文。同意湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)可以用不同方式在不同媒體上發(fā)表、傳播學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容，并同意田此產(chǎn)生的收益捐贈給學(xué)校教育基金會用于發(fā)展?fàn)柧可逃＃崳姡ūＣ艿膶W(xué)位論文在解密后應(yīng)

4、遵守此協(xié)議）一：研究生簽名＾時間：年／月／？日：指導(dǎo)師簽名時間：年＾月曰心？／Ｘ後摘要摘要，其突出特點是肌肉大理石紋明顯沙子吟豬是湖南省優(yōu)良地方品種，肌內(nèi)脂肪含－４５３，ＤＦＤ肉ＰＳＥ量可達(dá)．５．％，且氨基酸含量高且種類豐富無和肉。本研究Ｗ沙子嶺豬和大白豬為研究對象，利用轉(zhuǎn)錄組及蛋白組的方法探索不同品種間背最長肌發(fā)育的差異表達(dá)基因，并分析可能影響肉質(zhì)形成的分子機制：，主要研究工作如下（１）利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)對２５日齡沙子吟豬和大白豬的背最長肌進(jìn)行轉(zhuǎn)錄姐分析，獲

5、得沙子嶺豬Ｃｅａｎｒｅａｄｓ２９５２２８４，ｅａｎｒｅａｄｓ３４７１０ｌ條大白豬Ｃｌ９３７條，將這，聲，，些Ｃｌｅａｎｒｅａｄｓ進(jìn)行化ｎｏｎｖｅ拼接后獲得７９，３２０條ｕｎｉｇｅｎｅｓ，其中可Ｗ比對到ＮＲ數(shù)據(jù)２３０５５條．庫的有，０７％根據(jù)基因表法量發(fā)現(xiàn)４８９個顯著差異表達(dá)基因Ｆｏｌｄ，占巧；（＝２９７Ｃｈａｎｇｅ＞２，其中有個基因在沙子吟豬背最長肌表達(dá)顯著上調(diào)，有１９２個基因表）達(dá)顯著下調(diào)。２－（２）利用ＤＥ電泳技術(shù)對沙子嶺豬與大白豬背最長肌組織中差異蛋白進(jìn)行分析，共發(fā)現(xiàn)

6、３８個顯著差異蛋白點，其中在沙子嶺豬表達(dá)上調(diào)的蛋白點有２７個，大白豬表達(dá)－ＴＯＦ－ＴＯＦ上調(diào)的蛋白點有１１個；將這些差異蛋白點利用質(zhì)譜技術(shù)ＭＡＬＤＩ／ＭＳ進(jìn)行鑒定，共得到２３種蛋白對應(yīng)３６個差異蛋白點，ＧＯ分析顯示這些差異蛋白參與豬的生長發(fā)育調(diào)控、能量代謝、細(xì)胞骨架組成等重要過程。（３）Ｔ－ＰＣＲ驗證了８個差異表達(dá)基ｑＲ因在背最長肌的表達(dá)情況，實驗結(jié)果與轉(zhuǎn)錄一２－ＤＥ組及結(jié)果基本致，說明研究結(jié)果可Ｗ反映沙子嶺豬與大白豬背最長肌組織基因的表達(dá)情況。（４）根據(jù)測序獲得的序列，實驗利

7、用ＲＡＣＥ技術(shù)分別克隆了與代謝相關(guān)的基因－及仍的ｃＤＮＡ全長，ＲＴＰＣＲ技術(shù)比較并作了生物信息學(xué)分析，利用ｑ了這２個基因在沙子嶺豬及大白豬的背最長肌、也臟、肝臟、肺臟、脾臟、小腸、盲腸、腿肌、釋臟及膚臟共１０種組織的表達(dá)譜；同時檢測了沙子嶺豬基因及巧７＇一ＮＰ－Ａ基因是否存在Ｓ位點，發(fā)現(xiàn)在基因的３ＵＴＲ區(qū)存在個Ｇ／突變位點。：沙子嶺豬轉(zhuǎn)錄組關(guān)鍵詞；蛋白組；背最長肌差異表達(dá)基因；；Ｉ湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)博－上學(xué)位論文ＡｂｓｔｒａｃｔＣｈｉｎａｉｓａｂｕｎｄａｎｔｉｎｂ

8、ｒｅｅｄｒｅｓｏｕｒｃｅｓｏｆａｎｉｍａｌ．Ｓｈａｚｉｌｉｎｇｐｉｇｉｓａｎｅｘｃｅｌｌｅｎｔｎａｔｉｖｅｂｒｅｅｄｉ打ｔｈｅＸｉａｎｇｔａｎｒｅｇｉｏｎｏｆＨｕｎａｎｐｒｏｖｉｎｃｅ．Ｉｔｈａｓｓｏｍｅｐｏｓｉｔｉｖｅｆｅａｔｕｒｅｓ，ｓｕｃｈａｓ〇ｏｂｖ－４５／ｔｒｔｔｉｏｕｓｍａｒｂｌｉ打３．５．〇ｉ打ａｍｕｓｃｕｌａｒｆａｒｉｃｈａｍｉ打０