沙子嶺豬和大白豬背最長肌轉錄組與蛋白組研究

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1、博:ir學位論文沙子齡豬和大白豬背最長肌轉錄組與蛋白組硏究研究生姓名楊祗指導教師馬海明教授學科專業(yè)動物遺傳育種與繁殖硏究方向豬的分子遺傳學二〇—五年六月分類號密級UDC單位代碼顯齋《皮丈#博±學位論文沙子嶺豬和大白豬背最長肌轉錄組與蛋白組研究TmnscritomeandProbomeStudonpyLongissimusDorsiMuscleBetweenShazilingandYorkshireP

2、isg研究生姓名楊虎指導教師馬海明教授學科專業(yè)動物遺傳育種與繁殖研究方向豬的分子遺傳學論義答辯日期2015年6月11日答辯委員會主席王曉清論文評閱人姜運良楊官品陳平王賢純李加琪二〇—五年六月獨創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的論文是我個人在導師指導下進行的硏究工作及取得的研究成果。盡我所知,除了文中特別加W標注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已經發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包含為獲得湖南農業(yè)大學或其它教育機構的學位或證書而使用過的材料一同工作的同志

3、對本研究所做的任何貢獻均已在論文中作了明。與我確的說明并表示了謝意。'?/:時間研究生簽名氣枉瓜:>1^年少月|7曰關于論文使用授權的說明本人完全了解源南農業(yè)大學有關保留、使用學位論文的規(guī)定,目P:學校有權保留送交論文的復印件和磁盈,允許論文被查閱和借闊,可采用影印、縮印或掃描等復^制手段保存、匯編學位論文。同意湖南農業(yè)大學可以用不同方式在不同媒體上發(fā)表、傳播學位論文的全部或部分內容,并同意田此產生的收益捐贈給學校教育基金會用于發(fā)展爾究生教育。(保密的學位論文在解密后應

4、遵守此協(xié)議)一:研究生簽名^時間:年/月/?日:指導師簽名時間:年^月曰心?/X後摘要摘要,其突出特點是肌肉大理石紋明顯沙子吟豬是湖南省優(yōu)良地方品種,肌內脂肪含-453,DFD肉PSE量可達.5.%,且氨基酸含量高且種類豐富無和肉。本研究W沙子嶺豬和大白豬為研究對象,利用轉錄組及蛋白組的方法探索不同品種間背最長肌發(fā)育的差異表達基因,并分析可能影響肉質形成的分子機制:,主要研究工作如下(1)利用轉錄組測序技術對25日齡沙子吟豬和大白豬的背最長肌進行轉錄姐分析,獲

5、得沙子嶺豬Ceanreads2952284,eanreads34710l條大白豬Cl937條,將這,聲,,些Cleanreads進行化nonve拼接后獲得79,320條unigenes,其中可W比對到NR數(shù)據(jù)23055條.庫的有,07%根據(jù)基因表法量發(fā)現(xiàn)489個顯著差異表達基因Fold,占巧;(=297Change>2,其中有個基因在沙子吟豬背最長肌表達顯著上調,有192個基因表)達顯著下調。2-(2)利用DE電泳技術對沙子嶺豬與大白豬背最長肌組織中差異蛋白進行分析,共發(fā)現(xiàn)

6、38個顯著差異蛋白點,其中在沙子嶺豬表達上調的蛋白點有27個,大白豬表達-TOF-TOF上調的蛋白點有11個;將這些差異蛋白點利用質譜技術MALDI/MS進行鑒定,共得到23種蛋白對應36個差異蛋白點,GO分析顯示這些差異蛋白參與豬的生長發(fā)育調控、能量代謝、細胞骨架組成等重要過程。(3)T-PCR驗證了8個差異表達基qR因在背最長肌的表達情況,實驗結果與轉錄一2-DE組及結果基本致,說明研究結果可W反映沙子嶺豬與大白豬背最長肌組織基因的表達情況。(4)根據(jù)測序獲得的序列,實驗利

7、用RACE技術分別克隆了與代謝相關的基因-及仍的cDNA全長,RTPCR技術比較并作了生物信息學分析,利用q了這2個基因在沙子嶺豬及大白豬的背最長肌、也臟、肝臟、肺臟、脾臟、小腸、盲腸、腿肌、釋臟及膚臟共10種組織的表達譜;同時檢測了沙子嶺豬基因及巧7'一NP-A基因是否存在S位點,發(fā)現(xiàn)在基因的3UTR區(qū)存在個G/突變位點。:沙子嶺豬轉錄組關鍵詞;蛋白組;背最長肌差異表達基因;;I湖南農業(yè)大學博-上學位論文AbstractChinaisabundantinb

8、reedresourcesofanimal.Shazilingpigisanexcellentnativebreedi打theXiangtanregionofHunanprovince.Ithassomepositivefeatures,suchas〇obv-45/trttiousmarbli打3.5.〇i打amuscularfarichami打0

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