谷子農(nóng)藝性狀和蒸煮品質(zhì)與gbss1基因等位變異分析

谷子農(nóng)藝性狀和蒸煮品質(zhì)與gbss1基因等位變異分析

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1、分類號S515學(xué)校代碼10129UDC633學(xué)號2010202024谷子農(nóng)藝性狀和蒸煮品質(zhì)與GBSS1基因等位變異分析AnalysisonAgronomicTraitsandCookingQualitiesAssociatedwithAllelicVariationsofGBSS1inFoxtailMillets申請人:陳曉敏學(xué)科門類:農(nóng)學(xué)學(xué)科專業(yè):作物遺傳育種研究方向:作物品質(zhì)育種指導(dǎo)教師:郭世華教授楊自力副教授論文提交日期:二〇一三年六月摘要Waxy(GBSS1)基因編碼直鏈淀粉的合成,其堿基插入或缺失使編碼的氨基酸序列改變,胚乳

2、直鏈淀粉含量低,支鏈淀粉含量較高,甚至全為支鏈淀粉,使谷子表現(xiàn)為糯質(zhì)。本文以引進(jìn)的88份谷子品種(系)為材料,對GBSS1基因插入突變和exon2-exon4區(qū)間序列變異,以及其中53份材料的農(nóng)藝性狀和蒸煮品質(zhì)進(jìn)行分析,為中國谷子Waxy基因等位變異、蒸煮食味品質(zhì)與分子育種研究奠定基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下:(1)農(nóng)藝性狀的變異幅度為10.13%-36.08%,其中穗粒重的變異幅度最大(變異系數(shù)為36.08%,下同),株高的變異幅度最?。?0.13%)。株高與穗長、節(jié)數(shù)呈極顯著正相關(guān),與葉片數(shù)、穗下節(jié)間長呈顯著正相關(guān),但與穗粒重呈顯著負(fù)相關(guān)。

3、采用類平均法,在歐式距離4.0281,將供試材料聚為九大類群。第一類群的株高最大,節(jié)數(shù)、葉片數(shù)較多,但產(chǎn)量組合較低;第八(赤10-224)和第九(公矮5號)類群的穗重、穗粒重和千粒重較高。(2)豐谷12等15份材料的糊化溫度為70-74℃(堿消值在4-5),頻率為28.3%。赤谷10號、利谷21等29份材料(頻率54.7%)的膠稠度大于115cm。非糯、低直鏈淀粉和糯質(zhì)類型頻率分別為24.5%、60.4%和0,它們的直鏈淀粉含量分別為17.0%-31.9%、7.8%-16.0%和0-3.5%。(3)引物ex1/ex2、M5/R7、M7

4、/R10、M2/R4、M4/R5和M8/R9分別在8、85、14、32、22和68份材料中擴(kuò)增出1000bp、800bp、500bp、1000bp、700bp和300bp的片段。引物ex2int2/ex4r分別在8、10、9、19和29份材料中擴(kuò)增出800bp、2000bp、3000bp、800/2000bp和1800/3000bp的片段;引物M1/R3在5份材料只擴(kuò)增出3000bp的特異帶,在19份材料同時擴(kuò)增出1800bp和3000bp的譜帶;引物M5/R9在28份材料中同時擴(kuò)增出1000bp和1500bp的譜帶,在19份材料中只

5、出現(xiàn)1500bp的譜帶。(4)exon2-exon4區(qū)間序列比對表明,大紅谷在第10、11堿基處均有CT插入,白沙在第13、14和15堿基處分別有T、GG和GG插入,在第255堿基處G替換為A;赤谷四號和赤谷五號兩個粳谷品種在13、14、15均無插入,也沒有替換。利谷21在第15堿基檢測到G的插入,在17-24堿基處GGCACAGC突變?yōu)镃-ACAGCA。黔南農(nóng)家種和貓爪粘均在第347、348和350堿基處出現(xiàn)堿基替換,依次分別由C替換為G,T替換為G和G替換為A。(5)按exon2-exon4區(qū)間的序列變異,以閾值為70將53份材料

6、聚為九大類。其中第一類最多有24份,其次為第五類有10份。關(guān)鍵詞:谷子;農(nóng)藝性狀;蒸煮品質(zhì);GBSS1基因AnalysisonAgronomicTraitsandCookingQualitiesAssociatedwithAllelicVariationsofGBSS1inFoxtailMilletsAbstractWaxy(GBSS1)genescodeamylosesynthesis,theirinsertedordeletedbasechangetheaminoacidsequence,decreaseamylaseconten

7、tinendosperm,andincreasethecontentofamylopectin,whichmakefoxtailmilletwaxytypes.Eighty-eightmilletcultivarsandlineswereusedforanalysisoninsertmutationsandexon2-exon4sequencevariationsofGBSS1,fifty-threeofthemwereusedforagronomictraitsandcookingqualityanalysis.Itwilllayt

8、hefoundationforwaxyallelicvariations,cookingandeatingqualities,andthemolecularbreedinginChinesemillet.Mainresu

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