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《長(zhǎng)鏈非編碼rna在骨肉瘤患者中的差異表達(dá)研究》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、博士學(xué)位論文中文摘要原創(chuàng)性聲明本人聲明，所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。盡我所知，除了論文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含為獲得中南大學(xué)或其他單位的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我共同工作的同志對(duì)本研究所作的貢獻(xiàn)均己在論文中作了明確的說明。作者簽名：斗屆，、例學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本人了解中南大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，即：學(xué)校有權(quán)保留學(xué)位論文并根據(jù)國家或湖南省有關(guān)部門規(guī)定送交學(xué)位論文，允許學(xué)位論文被查閱和借閱；學(xué)?？梢怨紝W(xué)
2、位論文的全部或部分內(nèi)容，可以采用復(fù)印、縮印或其它手段保存學(xué)位論文。同時(shí)授權(quán)中國科學(xué)技術(shù)信息研究所將本學(xué)位論文收錄到《中國學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫》，并通過網(wǎng)絡(luò)向社會(huì)公眾提供信息服務(wù)。作者簽名：杯跏簽中文摘要長(zhǎng)鏈非編碼RNA在骨肉瘤患者中的差異表達(dá)研究目的：lncRNA在基因調(diào)控中起重要作用，目前它對(duì)骨肉瘤的發(fā)病機(jī)制的影響仍不清楚。本研究利用微矩陣基因芯片技術(shù)研究lncRNA在骨肉瘤和癌旁組織表達(dá)譜的差異并初步探討其生物學(xué)作用。方法：分別取9例骨肉瘤癌組織和對(duì)照癌旁組織，提取總RNA后進(jìn)行質(zhì)量測(cè)定，合格后雜交合成cDNA后
3、經(jīng)過Microarray基因芯片掃描儀掃描后得到原始數(shù)據(jù)，原始數(shù)據(jù)經(jīng)過統(tǒng)計(jì)軟件轉(zhuǎn)換后進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析，得到兩種組織之間IncRNA和mRNA的差異表達(dá)譜。分別選取上調(diào)的IncRNA6個(gè)：ASLNC21868，ASLNC22124，ASLNC23844，ASLNC24587，BE503655，BC050642，下調(diào)的lncRNA4個(gè)：ASLNC00339，ASLNCl1435，ASLNCl3387，ASLNCl8814采用SYBRGREENI實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(ImPCR)驗(yàn)證，并用GAPDH做內(nèi)參。綜合NCBIR
4、efSeq，UCSC，RNAdb，LncRNAs等數(shù)據(jù)庫資源，對(duì)芯片結(jié)果進(jìn)行GeneOntology、Pathways分析等初步生物信息學(xué)分析，并通過計(jì)算Pearson相關(guān)系數(shù)(20．95)建立lncRNA與靶基因的基因網(wǎng)絡(luò)圖。結(jié)果：將差異表達(dá)的標(biāo)準(zhǔn)設(shè)為：Folgchange值>2，P值-<0．05，發(fā)現(xiàn)兩種不同組織芯片表達(dá)有明顯差異。骨肉瘤組織與對(duì)照癌旁組織相比，在檢測(cè)的lncRNA表達(dá)譜中，9例樣本平均上調(diào)的lncRNAs為n博士學(xué)位論文中文摘要3528個(gè)(從2723到4537)，平均下調(diào)的lncRNAs為39
5、58(從3469到4368)，其中在9例樣本都上調(diào)的lncRNAs403個(gè)，都下調(diào)的IncRNAs798個(gè)，上調(diào)倍數(shù)最大的是ASLNC02724，7．23倍，下調(diào)倍數(shù)最大的是ASLNC05129，27．39倍。上調(diào)的lncRNAs略少于下調(diào)的lncRNAs。在檢測(cè)的rnRNA表達(dá)譜中，9例樣本平均上調(diào)的mRNAs為2604個(gè)(從1394到3710)，平均下調(diào)的rnRNAs為2344(從1513到2867)，其中在9例樣本都上調(diào)的mRNAs986個(gè)，都下調(diào)的mRNAs933個(gè)。采用SYBR綠色熒光染料I(SYBRGR
6、EENI)實(shí)時(shí)檢測(cè)的聚合酶鏈反應(yīng)(ImPCR)驗(yàn)證表達(dá)上調(diào)的6個(gè)lncRNAs：ASLNC21868，ASLNC22124，ASLNC23844，ASLNC24587，BE503655，BC050642，表達(dá)下調(diào)的4個(gè)lncRNAs：ASLNC00339，ASLNCll435，ASLNCl3387，ASLNCl8814，RT-PCR結(jié)果顯示ASLNC21868，ASLNC22124，ASLNC23844，ASLNC24587，BE503655，BC0506426個(gè)基因表達(dá)上調(diào)，ASLNC00339，ASLNCl14
7、35，ASLNCl3387，ASLNCl88144個(gè)基因表達(dá)下調(diào)，和芯片結(jié)果基本吻合。GO(GeneOntology)分析顯示，在上調(diào)表達(dá)的mRNAs中，celladhesion、extracellularmatrix和proteinbinding分別在生物學(xué)進(jìn)程(ontology：biologicalprocess)、細(xì)胞組件(ontology：cellularcomponent)和分子功日?u(ontology：molecularfunction)_三個(gè)方面富集程度最高，提示這些上調(diào)的mRNAs與這三者相關(guān)程度
8、最高；在下調(diào)表達(dá)的mRNAs中，musclesystemprocess、contractilefiber和structuralconstituentofmuscle分別在生物學(xué)進(jìn)程(ontology：biologicalprocess)、細(xì)胞組件1II中文摘要(ontology：cellularcomponent)和分子功能(ontology：molecul
