對(duì)葉榕傳粉榕小蜂轉(zhuǎn)錄因子的注釋與表達(dá)

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1、關(guān)于學(xué)位論文原創(chuàng)性和使用授權(quán)的聲明本人所呈交的學(xué)位論文，是在導(dǎo)師指導(dǎo)下，獨(dú)立進(jìn)行科學(xué)研究所取得的成果。對(duì)在論文研究期間給予指導(dǎo)、幫助和做出重要貢獻(xiàn)的個(gè)人或集體，均在文中明確說(shuō)明。本聲明的法律責(zé)任由本人承擔(dān)。本人完全了解山東農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留和使用學(xué)位論文的規(guī)定，同意學(xué)校保留和按要求向國(guó)家有關(guān)部門(mén)或機(jī)構(gòu)送交論文紙質(zhì)本和電子版，允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)山東農(nóng)業(yè)大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索，可以采用影印、縮印或其他復(fù)制手段保存論文和匯編本學(xué)位論文，同時(shí)授權(quán)中國(guó)科學(xué)技術(shù)信息研究所將本學(xué)位論文收錄到《中國(guó)學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù)》并

2、向社會(huì)公眾提供信息服務(wù)。保密論文在解密后應(yīng)遵守此規(guī)定。論文作者簽名：他導(dǎo)師簽名：缸符號(hào)說(shuō)明DBD．-DNA—bindingdomain，DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域SUPERFAMILY：superfamilydatabase，超家族數(shù)據(jù)庫(kù)Pfam：proteinfamilydatabase，蛋白家族數(shù)據(jù)庫(kù)HMM：HiddenMarkovModels，隱馬爾可夫模型SCOP：Structuralclassificationofproteinsdatabase，蛋白結(jié)構(gòu)分類數(shù)據(jù)庫(kù)mRNA：MessengerRNA，信使RNASAGE：serialanalysiso

3、fgeneexpression，基因表達(dá)連續(xù)性分析MPSS：massivelyparallelsignaturesequencing，大規(guī)模平行信號(hào)測(cè)序系統(tǒng)RNA—Seq：RNAsequencing，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序rRNA：ribosomalRNA，核糖體RNAtRNA：transferRNA，轉(zhuǎn)運(yùn)RNAncRNA：non-codingRNA，非編碼RNAlncRNA：longnon-codingRNA，長(zhǎng)非編碼RNAFDR：falsediscoveryrate，發(fā)現(xiàn)錯(cuò)誤率P—value：Probability，假定值cDNA：Complementary

4、DNA，互補(bǔ)DNA項(xiàng)目資助本研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金委生命科學(xué)部重大項(xiàng)目“榕小蜂DNA條形碼標(biāo)準(zhǔn)基因的進(jìn)化和隱存生物多樣性研究”(31090253)、國(guó)家自然基金委重大國(guó)際(地區(qū))合作研究項(xiàng)目“Wolbachia在榕果內(nèi)的進(jìn)化格局及其對(duì)榕小蜂的影響”(31210103912)的資助。中文摘要Abstract目錄1前言????????。1．1榕樹(shù)與榕小蜂?????????????????????????????～l1．1．1榕樹(shù)???????????????????????????????????????????．11．1．1．1榕果結(jié)構(gòu)???????

5、???????????????????????l1．1-1．2榕小孔?????????????????????????????????????????11．1．1．3榕果的發(fā)育時(shí)期???????????????????????????21．1．2榕小蜂??????????????????????????????????????????21．1．2．1雌雄傳粉榕小蜂的形態(tài)特征差異????????????????????31．1．2．2雌雄傳粉榕小蜂的生活環(huán)境差異????????????????????41．1．2．3榕樹(shù)與榕小蜂的協(xié)同進(jìn)化???????

6、????????????????41．2轉(zhuǎn)錄因子簡(jiǎn)介?????????????????????????????．51．2．1轉(zhuǎn)錄因子分類?????????????????????????????51．2．2轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)????????????????????????????51．2．2．1DNA結(jié)構(gòu)域????????????????????????????一51．2．2．2效應(yīng)結(jié)構(gòu)域?????????????????????????????61．2．3轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)方法???????????????????????????61．2．3．1轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)

7、方法簡(jiǎn)介????????????????????????61．2．3．2基于DBD數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄因子????????????????????61．3轉(zhuǎn)錄組????????????????????????????????．81．3．1轉(zhuǎn)錄組學(xué)簡(jiǎn)介?????????????????????????????81．3．2轉(zhuǎn)錄組研究進(jìn)展????????????????????????????91．3．3RNA-Seq原理?????????????????????????????????????．101．3．4RNA-Seq的應(yīng)用????????????????

8、???????????ll1．3．4．1編碼基因表達(dá)譜研究????????????????????????～