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《鹽脅迫下紅花基因組dna甲基化的msap分析》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在教育資源-天天文庫(kù)。
1、萬(wàn)方數(shù)據(jù)每此肇讓孝報(bào)2011,20(12):116-120壘!竺壘苧蘭!蘭!!蘭竺!里!!竺!!:!!!型竺絲竺蘭!!!竺鹽脅迫下紅花基因組DNA甲基化的MSAP分析李慧1,彭立新1,于瑋瑋1,馮濤1林木強(qiáng)2,閻國(guó)榮1(1.天津農(nóng)學(xué)院園藝系,天津300384;2.天津市靜??h良王莊鄉(xiāng)政府,天津301601)摘要:以紅花幼苗為研究材料,經(jīng)200mmol·L-1NaCl溶液分別處理4、8、12h,以未經(jīng)鹽脅迫處理為對(duì)照(CK),對(duì)DNA甲基化變化特征進(jìn)行MsAP(甲基化敏感擴(kuò)增多態(tài)性)分析。選用13對(duì)選擴(kuò)引物,共檢測(cè)到3140個(gè)基因位點(diǎn)。甲基化水
2、平分析表明,CK,4、8、12h處理樣本中總甲基化率分別為31.8%、27.1%、31.0%和31.3%。進(jìn)一步對(duì)不同處理時(shí)間紅花基因組DNA甲基化模式的變化特征進(jìn)行分析表明,NaCl處理4h后DNA的去甲基化模式調(diào)整占優(yōu)勢(shì),而處理8h及12h后DNA甲基化水平恢復(fù)到CK水平,甲基化及去甲基化模式調(diào)整基本一致。上述結(jié)果顯示,鹽脅迫條件下紅花基因組DNA甲基化狀態(tài)發(fā)生了一定變化,并且這種變化與鹽脅迫程度相關(guān),推測(cè)DNA甲基化修飾可能參與了紅花的鹽脅迫應(yīng)答。關(guān)鍵詞:DNA甲基化;MSAP;鹽脅迫;紅花中圖分類號(hào):Q751;$567.2文獻(xiàn)標(biāo)志碼:
3、A文章編號(hào):1004—1389(2011)12—0116—05AnalysisofDNACytosineMethylationunderSaltStressinCarthamustinctoriusBasedonMSAPLIHuil,PENGLixinl,YUWeiweil,F(xiàn)ENGTa01,LINMuqian92andYANGuoron91(1.DepartmentofHorticulture,TianjinAgriculturalUniversity,Tianjin300384,China:2.GovernmentoftheLiangwa
4、ngzhuangVillage,Tianjin301601,China)Abstract:AnalysisofDNAmethylationstatuswascarriedoutbyMSAP(methylation—sensitiveampli—fledpolymorphism)methodinCarthamustinctoriusL.a(chǎn)fter200mmol·L1NaClstressfor0,4,8and12h,respectively.Totally,3140geneticlociwereproducedby13pairsofselecti
5、veprimers.TheresultsindicatedthatthecorrespondingtotalDNAmethylationratioswere31.8%,27.1%31.0%and31.3%inthesamplestreatedbyNaClstressfor0,4,8and12h,respectively.FurtheranalysisoftheDNAmethylationpatternssuggestedthatdemethylationadjustmentwaspredominantin4hsamples,however,t
6、hemethylationlevelwasgotbacktothelevelofCKin8and12hsamples,andmethylationadjustmentwasalmostconsistentwithdemethylationadjustment.TheseresultsindicatedthatthechangesofDNAmethylationstatuswerecloselyassociatedwiththeresponsesofsaltstressinCarthamustinctoriusL.Keywords:DNAcyt
7、osinemethylation;MSAP;Saltstress;CarthamustinctoriusL.DNA甲基化(DNAmethylation)是發(fā)現(xiàn)最早,也是最主要的表觀遺傳修飾途徑之一,其主要發(fā)生在DNA序列中胞嘧啶第5位碳原子上。在高等植物中,DNA甲基化修飾在調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育、逆境耐受等方面發(fā)揮著重要作用,其調(diào)控作用主要是通過(guò)對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控來(lái)實(shí)現(xiàn)。一般情況下,DNA發(fā)生甲基化與基因的沉默相關(guān),而去甲基化則可導(dǎo)致基因表達(dá)。因此,通過(guò)探究基因組內(nèi)DNA甲基化水平與模式的變化,可進(jìn)一步從表觀遺傳的角度揭示基因的表達(dá)調(diào)控特征及機(jī)收稿
8、日期:2011—04—15修回日期:2011-06—15基金項(xiàng)目:天津市農(nóng)業(yè)科技成果轉(zhuǎn)化與推廣項(xiàng)目(0802210);天津農(nóng)學(xué)院科學(xué)研究發(fā)展基金計(jì)劃(200701)