環(huán)糊精與持久性有機(jī)污染物相互作用的分子模擬

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1、‘犬？＾ｉｔ技大愛(ài)ＤＡＬＩＡＮＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹＯＦＴＥＣＨＮＯＬＯＧＹ碩士字位ｉ￡文ＭＡＳＴＥＲＡＬＤＩＳＳＥＲＴＡＴＩＯＮｗ環(huán)糊精與持久性有機(jī)污染物相互作用的分子模擬生物化工學(xué)科專(zhuān)業(yè)作去姓戈賀紅德指忌救肺賈凌云教授．２０１５年６月答辯日期碩士學(xué)位論文環(huán)糊精與持久性有機(jī)污染物相互作用的分子模擬ＭｏｌｅｃｕｌａｒＳｉｍｕｌａｔｉｏｎｏｆｔｈｅＩｎｃｌｕｓｉｏｎＣｏｍｌｅｘｅｓｏｆＣｙｃｌｏｄｅｘｔｒｉｎｓｐｗｉｔｈＰｅｒｓｉｓｔｅｎｔＯｒｇａｎｉｃＰｏｌｌｕｔａ

2、ｎｔｓ作者姓名：賀紅德學(xué)科、專(zhuān)業(yè)：生物化工學(xué)號(hào)：２１２１８１２８指導(dǎo)教師：賈凌云教授完成日期：２０１５年６月大違理工大營(yíng)ＤａｌｉａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ大連理工大學(xué)學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明作者鄭重聲明：所呈交的學(xué)位論文，是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下進(jìn)行研究工作所取得的成果。盡我所知，除文中已經(jīng)注明引用內(nèi)容和致謝的地方外，本論文不包含其他個(gè)人或集體巳經(jīng)發(fā)表的研究成果，也不包含其他已申請(qǐng)學(xué)位或其他用途使用過(guò)的成果一。與我同工作的同志對(duì)本研究所做的貢獻(xiàn)均已在論文中做了明確的說(shuō)明并表示了謝意。若有

3、不實(shí)之處，本人愿意承擔(dān)相關(guān)法律責(zé)任。學(xué)位論文題目：碰ＩＩＭ■脅練＿聊悔伽作者簽名：Ｔ－期：月日＾像日＿２＾年＿￡」＾雄理工大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要持久性有機(jī)污染物（ＰｅｒｓｉｓｔｅｎｔＯｒｇａｎｉｃＰｏｌｌｕｔａｎｔｓ，ＰＯＰｓ）污染土壤修復(fù)的主要難點(diǎn)。在于ＰＯＰｓ以吸附態(tài)存在于土壤有機(jī)質(zhì)中，生物修復(fù)效率極低已有通過(guò)輕丙基環(huán)糊精作為增溶劑提高土壤中多環(huán)芳經(jīng)生物修復(fù)效率的報(bào)道，但相關(guān)研宄多局限于部分較易生物降解的污染物，對(duì)疏水及生物毒性更強(qiáng)的ＰＯＰｓ還缺乏相關(guān)研宄。論文的研宄目的在于構(gòu)建不同的環(huán)糊精衍生物（Ｃｙｃｌｏｄｅｘｔｒｉｎｓ

4、，ＣＤｓ）并從中尋找能夠提高土壤中多種ＰＯＰｓ分子向微生物的傳遞效率的ＣＤｓ，最終加快土壤污染物修復(fù)效率。本研究首先考察了ＭＯＰＡＣ、Ｇａｕｓｓｉａｎ兩種軟件的不同優(yōu)化條件、優(yōu)化方法對(duì)環(huán)糊精的優(yōu)化情況。經(jīng)過(guò)與標(biāo)準(zhǔn)結(jié)構(gòu)的ＲＭＳＤ及能量比較，并結(jié)合相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道，最終確定釆用Ｇａｕｓｓ－ｉａｎ軟件依次進(jìn)行ｍ３、ｈｆ７６３１的優(yōu)化方法。并以此為基礎(chǔ)構(gòu)建出所需的ｐｇＣＤｓ及ＰＯＰｓ結(jié)構(gòu)。分子對(duì)接部分，考察了３０種不同結(jié)構(gòu)的ＣＤｓ與２４０種ＰＯＰｓ的包合效果。以三乙－－－環(huán)糊精和磺丁基－－ｃｄ－０醜基ＰＰ環(huán)糊精為代表，其對(duì)節(jié)并［１２３花的結(jié)合能分別為１．６

5、０，，］－－－ｋｃａｌ／ｍｏＫ８．８７ｋｃａｌ／ｍｏｌ環(huán)糊精對(duì)其結(jié)合能僅為．１０ｋｃｌ／ｍｏｌ。，而未經(jīng)修飾的Ｐ７ａ對(duì)接分析表明，在環(huán)糊精的２位與６位輕基修飾物中，２位修飾更有利于提高其包合穩(wěn)定性。－２６－０－甲基－環(huán)糊精在包合效果和水溶性上其中磺丁基環(huán)糊精與全（，均滿足實(shí)際要求。，）Ｐ－－動(dòng)力學(xué)計(jì)算部分，以ＣＨＡＲＭＭ、ＣＳＦＦ力場(chǎng)為基礎(chǔ)，補(bǔ)充并完成了購(gòu)丁基環(huán)糊ｐ－－精的力場(chǎng)制作。在周期性水環(huán)境中考察了Ｐ－環(huán)糊精、橫丁基Ｐ環(huán)糊精對(duì)花的相互作用。－－－相對(duì)位置分析發(fā)現(xiàn)．６％，擴(kuò)丁基Ｐ環(huán)糊精在９４的情況下可以穩(wěn)定包合客體分子，而Ｐ。環(huán)糊精

6、僅在７９．９％的情況下穩(wěn)定包合－－－－－３０－０－環(huán)糊精－０－擴(kuò)丁基－０最終，從種ＣＤｓ中挑選出２擴(kuò)丁基Ｐ、６Ｐ環(huán)糊精、（２，６－－甲基環(huán)糊精三種ＣＤｓ，其均能與ＰＯＰｓ形成穩(wěn)定包合物。同時(shí)通過(guò)側(cè)鏈對(duì)環(huán)糊精包合）Ｐ效果分析顯示，ＣＤｓ的包合效果不僅與側(cè)鏈結(jié)構(gòu)和其取代位置、取代度有關(guān)，還與ＰＯＰｓ分子結(jié)構(gòu)存在相關(guān)性。因此，釆用ＰＯＰｓ的在實(shí)際生物修復(fù)中，應(yīng)針對(duì)污染物組成，制定個(gè)性化的環(huán)糊精使用方案。該研宄工作，嘗試建立了ＣＤｓ衍生物結(jié)構(gòu)構(gòu)建方法、編寫(xiě)了對(duì)接結(jié)果批處理腳本，并完成了ＣＤｓ缺失力場(chǎng)參數(shù)的補(bǔ)充。可以為評(píng)價(jià)ＣＤｓ在促進(jìn)土壤中ＰＯＰｓ污染物生物

7、利用率、批量對(duì)接數(shù)據(jù)處理、力場(chǎng)缺失狀態(tài)下的動(dòng)力學(xué)計(jì)算等工作提供參考。：環(huán)糊精關(guān)鍵詞；持久性有機(jī)污染物；分子對(duì)接；動(dòng)力學(xué)包合物；－－Ｉ環(huán)糊精與持久性有機(jī)污染物相互作用的分子模擬ＭｏｌｅｃｕｌａｒＳｉｍｕｌａｔｉｏｎｏｆｔｈｅＩｎｃｌｕｓｉｏｎＣｏｍｌｅｘｅｓｏｆＣｃｌｏｄｅｘｔｒｉｎｓｐｙｗｉｔｈＰｅｒｓｉｓｔｅｎｔＯｒａｎｉｃＰｏｌｌｕｔａｎｔｓｇＡｂｓｔｒａｃｔＴｈｅｍａｉｎｄｉｆｆｉｃｕｌｔｙｆｏｒｔｈｅｒｅｍｅｄｉａｔｉｏｎｏｆ