利用高密度snp標(biāo)記分析中國(guó)240份玉米自交系的遺傳特征

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1、分鮮密敏ＵＤＣ編號(hào)中國(guó)農(nóng)化巧學(xué)巧？±后研巧工作巧告利用高密度ＳＮＰ標(biāo)記分祈中國(guó)２４０份玉米自交系的逸傳特征刈旨林２０一工作完成曰期１３年８月２０１５年６月飯鏈肢日期２０１５年６月中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院ｄｔ京）２０１５年６月分類(lèi)號(hào)密級(jí)ＵＤＣ編號(hào)中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院巧±后研究工作報(bào)告利用高密度ＳＮＰ標(biāo)記分析中國(guó)２４０份玉米自交系的遺傳特征劉昌林工作完成曰期２０１３年８月一２０１５年６月報(bào)告提交日期２０１５年６月中國(guó)

2、農(nóng)業(yè)科學(xué)院。ｆｃ京）２０１５年６月利用高密度ＳＮＰ標(biāo)記分析中國(guó)２４０份玉米自交系的遺傳特征＇ＧｅｎｅｔｉｃＰｒｏｅｒｔｉｅｓｏｆ２４０ＣｈｉｎｅｓｅＭａｉｚｅＩｎｂｉｅｄＬｉｎｅｓＲｅｖｅａｌｅｄｂｙｐ曲ｈ－ｄｅｎｓｒｒｓｉｔｙＳＮＰＭａｋｅｇ博：ｔ后姓名：劉昌林一流動(dòng)站級(jí)學(xué)科名稱(chēng)：作物學(xué)（）專(zhuān)業(yè)（二級(jí)學(xué)科）名稱(chēng)：生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究工作起始時(shí)間：２０１３年８月１３日研究工作期滿時(shí)間：２０１５年６月１３日中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院（北京）２０１５年６月

3、獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果，除了文中特別加Ｗ標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)。盡我所知表或撰寫(xiě)過(guò)的研究成果，也不包含為獲得中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證一書(shū)而使用過(guò)的材料。與我同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說(shuō)明并表示了謝意。；月＾博±后簽名：／＾時(shí)間：如＆年日１隻！關(guān)于論文使用授權(quán)的聲明本人完全了解中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，即：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院有權(quán)保留送交論文的復(fù)印

4、件和磁盤(pán)，允許論文被查閱和借閱，可Ｗ采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存。、匯編學(xué)位論文同意中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院可Ｗ用不同方式在不同媒體上發(fā)表。、傳播學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容博±后簽名：時(shí)間：年至月古曰句受！、合作導(dǎo)師簽名；時(shí)間：１〇５年ｉ月叫曰岑巧要玉米（ＺｅａｗａｙｓＬ．）是重要的糧食與飼料作物，在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)與經(jīng)濟(jì)發(fā)展中占有重要地位，研究玉米自交系的遺傳特征有利于解析其遺傳多樣性，并為種質(zhì)改良與育種提供基礎(chǔ)。本研究利用包含５６１１０個(gè)單核巧酸多態(tài)性（ＳｉｎｇｌｅＮｕｃｌｅｏｔｉ

5、ｄｅＰｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ，ＳＮ巧標(biāo)記的ＭａｉｚｅＳＮＰ５０ＢｅａｄＣｈｉｐ分析了２４０份中國(guó)常用玉米，包括３個(gè)骨干親本丹３４０、Ｍｏｌ７與黃早四及其衍生系自交系的基因型。主要研究結(jié)果如下：在Ｂ７３基因組上僅有１個(gè)匹配位點(diǎn)的４０７５７個(gè)ＳＮＰ成功地進(jìn)行了基因型分型，其平均間距為５０Ｋｂ。利用稀有等位基因頻率（ＭｉｎｏｒＡｌｌｅｌｅＦｒｅｑｕｅｎｃｙ，ＭＡＦ）２００Ｐ５，大于０．的４０００個(gè)高質(zhì)量ＳＮ將２４０份玉米自交系劃分成了個(gè)亞群即Ｌａｎ、Ｌ艮Ｃ、ＰＢ、Ｒｅｉｄ和

6、ＳＰＴ。２在連鎖不平衡（ＬｉｎｋａｇｅＤｉｓｅｑｕｉｌｉｂｒｉｕｍ，ＬＤ）ｒ小于０．１００水平下，玉米１０條染色體的平均ＬＤ衰減距離差異較大，分布于３９７Ｋｂ到８１９Ｋｂ之間，平均衰減距離６４３閒。２在ｒ＜０．１００水平下，根據(jù)同源傳遞片段（ＩｄｅｎｔｉｔｙＢｙＤｅｓｃｅｎｔ，舊Ｄ）所在染色體平均ＬＤ衰減距離與舊０所在染色體區(qū)域ＬＤ衰減距離，丹３４０、黃早四與Ｍｏｌ７衍生系中分別檢測(cè)到２６、３５和２３個(gè)舊Ｄ。同時(shí)，基于３個(gè)衍生系群體，ｔＴｒａｉｔＬｏｃｕｓＴＬｒ分別在

7、控制穗行數(shù)的數(shù)量性狀位點(diǎn)（Ｑｕａｎｉｔａｔｉｖｅｎ７、控制甘，Ｑ）抑旗花葉病毒抗性的ＱＴＬｙｃｗｖ／和控制絲黑穗病抗性的ＱＴＬ９／／Ｓ２Ｗ內(nèi)檢測(cè)到了Ｔ’Ｄａｊｉｍａｓ的低峰。本研究結(jié)果為玉米雜種優(yōu)勢(shì)群劃分與重要農(nóng)藝性狀遺傳結(jié)構(gòu)解析奠定了基礎(chǔ)。，，，雜種優(yōu)關(guān)鍵詞，單核巧酸多態(tài)性連鎖不平衡同源傳遞片段：玉米自交系勢(shì)群ＩＡｂｓｔｒａｃｔＭａｉｚｅ｛ＺｅａｍａｙｓＬ．ｉｓａｎｉｍｏｒｔａｎｔｃｒｏｐｗｈｉｃｈｓｅｒｖｅｓａｓｆｏｏｄａｎｄｆｏｒａｅ．Ｉｔｌ

8、ａｓａｎ）ｐｇｐｙｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｒｏｌｅｉｎａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌａ打ｄｅｃｏｎｏｍｉｃｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ．Ｃｈａｒａｄｅｒｉｚａｔｉｏｎｏｆｔｈｅｇｅｎｅｔｉｃｒｏｅｒｔｉｅｓｏｆｍａｉｚｅｉｎｂｒｅｄｌｉｎｅｓｉｓｂｅｎｅｆｉｃｉａｌｎｏｔｏｎｌｆｏｒｉｎｃｒｅａｓｉｎｐｐｙｇｋｎ