基于rna-seq技術(shù)的宮頸鱗癌轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

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1、？Ｗ：．廣．＇．■．－＇—■？■ｒＭ京誠和皆聲從中固＃５鐘令獻博±研究生學(xué)位論文臟北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院研究生院中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院－北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博±研巧生學(xué)位論文學(xué)校代碼：１００２３學(xué)號：Ｂ２０１２００１０２５博±學(xué)位論文基于ＲＮＡ－ｓｅｑ技術(shù)的宮頸鮮痛轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究所院：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院姓名：郭朋指導(dǎo)教師：向陽教授導(dǎo)師小組；朱寶利教授學(xué)科專業(yè)：婦產(chǎn)科學(xué)研究方向：婦科腫瘤完成日期：２０巧年５月Ｉ中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院－北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院謗±

2、研究生學(xué)位論文ＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｒｏｆｉｌｉｎｏｆｃｅｒｖｉｃａｌｓｕａｍｏｕｓｃｅｌｌｃａｒｃｉｎｏｍａｐｇｑｂｙＲＮＡｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ乂ＤｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎＳｕｂｍｉｔｔｅｄ化ＰｅｋｉｎｇＵｎｉｏｎＭｅｄｉｃａｌＣｏｌｌ巧ｅＡｐｐｌｙｉｎｇｆｏｒｔｈｅＤｏｃｔｏｒａｌｄｅｒｅｅＭａｏｒｏｎＯｂｓｔｅｔｒｉｃｓａｎｄＧｙｎｅｃｏｌｏｇｊｇｙＢｙｅｎＧｕｏＰｇＵｎｄｅｒｔｈｅＧｕｉｄａｎｃｅｏｆ．．ＰｒｏｆＹａｎＸ

3、ｉａｎａｎｄＰｒｏｆＢａｏｌｉＺｈｕｇｇＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＯｂｓｔｅｔｒｉｃｓａｎｄＧｙｎｅｃｏｌｏｇｙＰｅｋｉｎＵｎｉｏｎＭｅ化ｃａｌＣｏｌｌｅｅＨｏｓｉ化１ｇｇｐＣｈｉｎｅｓｅ乂ｃａｄｅｍｏｆＭｅｄｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ＆ＰｅｋｉｎＵｎｉｏｎＭｅｄｉｃａｌＣｏｌｌｅｅｙｇｇＭ巧２０１５，Ｂｅｉｊｈｉｇ，ＣｈｉｎａＩＩ中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院－化京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博±研巧生學(xué)位論文目錄中文摘要１４一－ＲＮＡｅ７第部分基

4、于ｓｑ技術(shù)的宮頸鱗癌和癌旁組織的差異表達基因分析前Ｓ７材料與方法１２２３４７５３參考文獻５４－第二部分基于ＲＮＡｓｅｑ技術(shù)的宮頸鱗癌和癌旁組織的可變剪接分析６８６８Ｉｔ胃材料與方法７３結(jié)果７７ｉｍ８６結(jié)論８９９０９９論文綜述１００英文縮略詞１１４攻讀博±期間論文發(fā)表和基金資助情況１１６致謝１１７學(xué)位論文獨創(chuàng)性聲明及版權(quán)使用授權(quán)書１１８Ｉ凸中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院－北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博±研巧生學(xué)位論文中文

5、搪要一第部分基于ＲＮＡ－ｓｅｑ技術(shù)的宮頸鱗痛和癌旁組織的差異表達基因分析目的：一宮頸癌是婦科最常見的惡性腫瘤之，居女性癌癥患者死亡原因的第４位。除ＨＰＶ感染外，被感染細胞的基因組異常才能最終導(dǎo)致宮頸癌的發(fā)生發(fā)展，因此與細胞生長分化相關(guān)的基因表達調(diào)控異常在宮頸癌的發(fā)病機制中同樣具有重要作用。轉(zhuǎn)錄姐是基因功能及結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)和出發(fā)點－ｓｅ。本研究擬應(yīng)用ＲＮＡｑ技術(shù)全面分析宮頸鱗癌組織和癌旁組織的轉(zhuǎn)錄組，篩選出差異表達基因，進而分析差異表達基因的相互作用、涉及的信號通路、（＾］？及差異表達基

6、因與宮頸鱗癌臨床病理因素的相關(guān)性，尋找可能的宮頸鱗癌診斷的分子標(biāo)記物和幫向治療目標(biāo)，為宮頸癌的診治提供實驗依據(jù)和理論基礎(chǔ)。方法：ｃＤＮＡ－構(gòu)建文庫后，應(yīng)用ＲＮＡｓｅｑ全面分析３對宮頸鱗癌和對應(yīng)癌旁組織的轉(zhuǎn)錄組，篩選出宮預(yù)鱗癌組織和癌旁組織的差異表達基因。應(yīng)用ＧＯＧｅｎｅＯｎｔｏｌｏ法（ｇｙ訪分析差異表達基因的功能聚類，應(yīng)用ＫＥＧＧ（ＫｙｏｔｏＥｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａｏｆＧｅｎｅｓａｎｄＧｅｎｏｍｅｓ）信號通路富集性方法分析差異表巧基因相關(guān)的信號通路。構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)，分

7、析差異表達基因之間的相互作用，篩選出重要的差異表達基因。應(yīng)用實時蒙光定量ＰＣＲ和免疫組化的方法驗證宮頸鱗癌組織和癌旁組織的差異基因的表達水平，并分析差異基因與宮頸鱗癌臨床病理因素的相關(guān)性。結(jié)果：一３對宮頸鱗癌組織和癌旁組織共有３４７個差異表達基因，包括１０４個表達致上一調(diào)的基因、１４８個表達致下調(diào)的基因３４７個差異表達基因被分為７３，。個功能聚類一一１０４個表達致上調(diào)的差異表達基因被分為３４個功能聚類，１４８個表達致下調(diào)的差異表法基因被分為８０個功能聚類。通過ＫＥＧＧ信號通路富集性分析，我

8、們發(fā)現(xiàn)差異表達基因富集到６條信號通路上－，包括細胞因子細胞因子受體相互作用信號通路、１中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院－北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博±研巧生學(xué)位論文補體系統(tǒng)及凝血相關(guān)信號通路、視黃醇代謝相關(guān)信號通路、趨化因子相關(guān)信號通路、細胞色素ｐ４５０外源性物質(zhì)代謝相關(guān)信號通路、黑素原生成相關(guān)信號通路。蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析發(fā)現(xiàn)Ｈ個重要的差異表達基