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《基于rna-seq技術(shù)的宮頸鱗癌轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、?W:.廣.'.■.-'—■?■rM京誠和皆聲從中固#5鐘令獻博±研究生學(xué)位論文臟北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院研究生院中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院-北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博±研巧生學(xué)位論文學(xué)校代碼:10023學(xué)號:B2012001025博±學(xué)位論文基于RNA-seq技術(shù)的宮頸鮮痛轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究所院:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院姓名:郭朋指導(dǎo)教師:向陽教授導(dǎo)師小組;朱寶利教授學(xué)科專業(yè):婦產(chǎn)科學(xué)研究方向:婦科腫瘤完成日期:20巧年5月I中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院-北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院謗±
2、研究生學(xué)位論文TranscriptomerofilinofcervicalsuamouscellcarcinomapgqbyRNAsequencing乂DissertationSubmitted化PekingUnionMedicalColl巧eApplyingfortheDoctoraldereeMaoronObstetricsandGynecologjgyByenGuoPgUndertheGuidanceof..ProfYanX
3、ianandProfBaoliZhuggDepartmentofObstetricsandGynecologyPekinUnionMe化calColleeHosi化1ggpChinese乂cademofMedicalSciences&PekinUnionMedicalColleeyggM巧2015,Beijhig,ChinaII中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院-化京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博±研巧生學(xué)位論文目錄中文摘要14一-RNAe7第部分基
4、于sq技術(shù)的宮頸鱗癌和癌旁組織的差異表達基因分析前S7材料與方法12234753參考文獻54-第二部分基于RNAseq技術(shù)的宮頸鱗癌和癌旁組織的可變剪接分析6868It胃材料與方法73結(jié)果77im86結(jié)論899099論文綜述100英文縮略詞114攻讀博±期間論文發(fā)表和基金資助情況116致謝117學(xué)位論文獨創(chuàng)性聲明及版權(quán)使用授權(quán)書118I凸中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院-北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博±研巧生學(xué)位論文中文
5、搪要一第部分基于RNA-seq技術(shù)的宮頸鱗痛和癌旁組織的差異表達基因分析目的:一宮頸癌是婦科最常見的惡性腫瘤之,居女性癌癥患者死亡原因的第4位。除HPV感染外,被感染細胞的基因組異常才能最終導(dǎo)致宮頸癌的發(fā)生發(fā)展,因此與細胞生長分化相關(guān)的基因表達調(diào)控異常在宮頸癌的發(fā)病機制中同樣具有重要作用。轉(zhuǎn)錄姐是基因功能及結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)和出發(fā)點-se。本研究擬應(yīng)用RNAq技術(shù)全面分析宮頸鱗癌組織和癌旁組織的轉(zhuǎn)錄組,篩選出差異表達基因,進而分析差異表達基因的相互作用、涉及的信號通路、(^]?及差異表達基
6、因與宮頸鱗癌臨床病理因素的相關(guān)性,尋找可能的宮頸鱗癌診斷的分子標(biāo)記物和幫向治療目標(biāo),為宮頸癌的診治提供實驗依據(jù)和理論基礎(chǔ)。方法:cDNA-構(gòu)建文庫后,應(yīng)用RNAseq全面分析3對宮頸鱗癌和對應(yīng)癌旁組織的轉(zhuǎn)錄組,篩選出宮預(yù)鱗癌組織和癌旁組織的差異表達基因。應(yīng)用GOGeneOntolo法(gy訪分析差異表達基因的功能聚類,應(yīng)用KEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes)信號通路富集性方法分析差異表巧基因相關(guān)的信號通路。構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),分
7、析差異表達基因之間的相互作用,篩選出重要的差異表達基因。應(yīng)用實時蒙光定量PCR和免疫組化的方法驗證宮頸鱗癌組織和癌旁組織的差異基因的表達水平,并分析差異基因與宮頸鱗癌臨床病理因素的相關(guān)性。結(jié)果:一3對宮頸鱗癌組織和癌旁組織共有347個差異表達基因,包括104個表達致上一調(diào)的基因、148個表達致下調(diào)的基因347個差異表達基因被分為73,。個功能聚類一一104個表達致上調(diào)的差異表達基因被分為34個功能聚類,148個表達致下調(diào)的差異表法基因被分為80個功能聚類。通過KEGG信號通路富集性分析,我
8、們發(fā)現(xiàn)差異表達基因富集到6條信號通路上-,包括細胞因子細胞因子受體相互作用信號通路、1中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院-北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博±研巧生學(xué)位論文補體系統(tǒng)及凝血相關(guān)信號通路、視黃醇代謝相關(guān)信號通路、趨化因子相關(guān)信號通路、細胞色素p450外源性物質(zhì)代謝相關(guān)信號通路、黑素原生成相關(guān)信號通路。蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析發(fā)現(xiàn)H個重要的差異表達基