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《毛果楊全基因組iqd基因的鑒定及表達分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學術(shù)論文-天天文庫。
1、分類號：Q785S722.36S792.119單位代碼：10364密級：學號：12720136安徽農(nóng)業(yè)大學學位論文毛果楊全基因組IQD基因的鑒定及表達分析Genome-WideIdentificationandExpressionAnalysisoftheIQDGeneFamilyinPopulustrichocarpa研究生：馬慧指導教師：項艷教授申請學位門類級別：農(nóng)學碩士專業(yè)名稱：園林植物與觀賞園藝研究方向：園林植物遺傳育種所在學院：林學與園林學院答辯委員會主席：2015年6月I獨創(chuàng)性聲明本人聲明所呈的學位論文是本人在導師指導下進行的研究工作及取得的研究成果。據(jù)我所知，除了文中特別
2、加以標注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含為獲得安徽農(nóng)業(yè)大學或其它教育機構(gòu)的學位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。學位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學位論文作者完全了解安徽農(nóng)業(yè)大學有關(guān)保留、使用學位論文的規(guī)定，有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機構(gòu)送交論文的復印件和電子文件，允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)安徽農(nóng)業(yè)大學可以將學位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進行檢索，收錄到《中國學位論文全文數(shù)據(jù)庫》，可以采用影印、縮印或掃描等復制手段保存、匯編學位論文，向社會公眾提供信息服務。(保密的學位論文在解密
3、后應遵守此協(xié)議)。II摘要鈣調(diào)素(CaM)是一類重要的Ca2+受體蛋白、廣泛的存在于真核細胞中，其通過介導信號傳遞來調(diào)節(jié)細胞的生理功能。研究表明：IQD蛋白中含有數(shù)個鈣調(diào)素結(jié)合結(jié)構(gòu)域（CaMBD），所以推測IQD可能參與并且協(xié)調(diào)了CaM和其同源蛋白之間的相互作用，在轉(zhuǎn)錄水平及轉(zhuǎn)錄后水平上來調(diào)節(jié)基因的表達，在植物體的生長發(fā)育以及應對各種逆境壓力中扮演著不可或缺的角色。本研究對毛果楊I(lǐng)QD基因家族進行相關(guān)信息的鑒定分析，并對該家族成員進行理化性質(zhì)、染色體位置、系統(tǒng)進化關(guān)系、外顯子/內(nèi)含子的結(jié)構(gòu)、基因的復制和表達模式等方面全面開展研究，獲得以下主要結(jié)果：1.在Phytozome網(wǎng)站中進行序列
4、搜索，隨后通過比對、篩選以及在線分析，最終篩選到40個毛果楊I(lǐng)QD類型基因并將它們分別編號為PtIQD1-PtIQD40。使用ExPasy站點對毛果楊I(lǐng)QD蛋白的相關(guān)理化性質(zhì)進行分析。亞細胞定位分析顯示，65%的毛果楊I(lǐng)QD成員定位在細胞核中。鈣調(diào)素結(jié)合位點分析表明，每條IQD蛋白都至少含有一個鈣調(diào)素結(jié)合位點。2.對這40個毛果楊I(lǐng)QD保守域進行序列比對，隨后構(gòu)建系統(tǒng)進化樹并對其進行分組。分組結(jié)果表明：這40個IQD蛋白被分為四個亞家族(I、II、III、IV)。其中，第I和第III這兩個亞家族又可以分別細分為Ia、Ib、Ic以及IIIa、IIIb共5個小亞組。3.對PtIQD基因的結(jié)
5、構(gòu)進行分析，結(jié)果顯示這40個基因編碼外顯子從2到6個不等。進一步分析發(fā)現(xiàn)許多旁系同源基因?qū)Χ加兄鴺O其相似的外顯子/內(nèi)含子結(jié)構(gòu)。4.通過MEME網(wǎng)站對全部毛果楊I(lǐng)QD蛋白保守基序進行在線分析顯示，1號基序（motif1）是IQD的核心序列，即IQmotif，其廣泛存在于毛果楊I(lǐng)QD蛋白家族中。多數(shù)進化關(guān)系比較近的蛋白質(zhì)有著相同的基序組成模式。5.利用MapInspect軟件獲得PtIQD成員的染色體物理定位信息，這40個PtIQD基因廣泛地分布在除7號染色體以外的其他18條染色體上。PtIQD基因組中，復制基因占整個PtIQD基因家族的80%，且它們?nèi)坑善螐椭飘a(chǎn)生。6.EST表達分析
6、結(jié)果顯示，大多數(shù)IQD基因在不同的組織或器官中都有表達。同時，NCBI網(wǎng)站提供的微陣列數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示，多數(shù)IQD基因存在明顯的組織特異性表達模式。其中，14對復制基因?qū)χ械?對有著比較相似的表達模式。7.利用qRT-PCR技術(shù)對PtIQD第III亞家族基因在茉莉酸甲酯（MeJA，100μM）以及聚乙二醇（PEG-6000，20%）這兩種脅迫處理條件下的誘導表達情況進行分析。結(jié)果顯示，大多數(shù)的PtIQD基因被MeJA和PEG-6000這兩種脅迫所誘導。關(guān)鍵詞：毛果楊，IQ67結(jié)構(gòu)域，IQD，全基因組鑒定分析，表達譜研究IIIAbstractCaMisoneofthemostimport
7、anttypeofcalciumreceptorproteins,anditiswidespreadineukaryotes.CaMmediatessignaltransmissionthatcanthenregulatecellularphysiologicalfunctions.PreviousresearchesshowedthatIQDproteinscontainseveralcalmodulin-bindingdomains,sos
