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《甘蔗熱帶種、割手密bac文庫序列與高粱同源序列的初步比較學(xué)分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
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3、嘗氣括裳足－指導(dǎo)教師．：陳由強教授！々｜ｒ．誇補技；’±／苗申請學(xué)位級別：ｍ，±Ｍ摩茲裏＂－’貧類－，．．ｉ哉；，啼私、：、：Ｔ：２０１５年月日．；．＼論文提交日期罕４．’論文評巧人：、，．證，＇＇聲；＇拿／二％／／＼／特抗論文答辯曰期：２０巧年月日滿：．Ｖ答辯委員會主巧：跨；妍為咬心冶?。犃x疋，’＇；‘媒、誠巧學(xué)位授予單位．Ｖ品茄：福建師范大學(xué)＿海／／＞為兵躬片１＇學(xué)位授予日期：．釋年Ｊ：辦享辯帶’巧腳！巧＂＇；敬本．ｒｆ藻氏Ｉ、．省
4、家泉必＇＇＇．．．＇‘．；．‘，Ａ於片－三＇／，ｊ：掉２０１５年６月ｒ去讀＇咬－；ｖ：乃ｒ：或如指興作，；蠢話斬：皆；銀寺：；去Ｗ貨參、．；．；ｉ．．矣．；《托進(jìn)婚挺議；；鍵《奔呵摘要中文摘要Ｉ現(xiàn)代甘廉栽培種由兩親本熱帶種和割手密經(jīng)過多次種間雜交回交而來造成了其？？高度雜合的基因組特性，其中７０８０％的基因組緣于熱帶種，１０２０％來自割手密１％左右的重組類型。因此的貢獻(xiàn)，另有０，研究甘庶基因組的合適方案應(yīng)是回歸于熱帶種與割手密的基因組研究中。熱帶種與
5、割手密細(xì)茜人工染色體文庫的建立為甘謊種質(zhì)育種與基因發(fā)現(xiàn)提供了基因組學(xué)上的便利。本研究Ｗ兩文庫作為研究素材，通過對篩選出來的ＢＡＣｓ序列與高梁序列的同源比較Ｗ及熱帶種與割手密間的同源一比較來初步揭示兩親本種的基因組信息Ｗ進(jìn)步豐富對甘旗基因組的認(rèn)識。首先－，利用比較學(xué)在高梁基因絕數(shù)據(jù)庫中捜尋ＦＴｌｉｋｅ基因（ＦｌｏｗｅｒｉｎＬｏｃｕｓＴ）ｇ１－ｌｉｋｅ并Ｗ１１條高梁序列設(shè)計探針引物，探針共篩選出個熱帶種與３個割手密含ＦＴｓ５４－克隆，注釋到４個甘荒ＦＴｅ。基因ＢＡＣ，經(jīng)過４測序和序列拼裝后
6、ｌｉｋ家族成員通過ＢＡＣｓ序列與高梁、水稻同源區(qū)的比較反映微觀共線性的存在也同時揭示了割－ｉｋｅ手密中染色體重排序現(xiàn)象的發(fā)生。另外，我們還發(fā)現(xiàn)ＦＴｌ基因周邊存有較多的調(diào)一。控基因隨后將比較的規(guī)模擴大，通過先前實驗室利用批基因探針?biāo)炄〉母适崳姡拢粒靡惶谴xｓ庫來進(jìn)行進(jìn)步的比較。完成４５４測序Ｗ及８７個ＢＡＣｓ序列的缺口。填補，Ｗ高梁基因組為媒介，比較熱帶種與割手密的同源序列發(fā)現(xiàn)熱帶種相對高。梁在基本基因組上的擴展趨勢，而割手密卻比較穩(wěn)定在重復(fù)元件上，熱帶種Ｗ突。ＬＴＲ反出的Ｇｙｐ巧反轉(zhuǎn)座子高比
7、例為特征，而割手密含有相對較少的重復(fù)序列對轉(zhuǎn)座子的調(diào)查反映了甘庶轉(zhuǎn)座元件的活躍，并觀察到其對新等位基因的促生與基因假基因化的作用。此外對ＢＡＣｓ上注釋到的ＦＲＫ果糖激酶家族成員進(jìn)行選擇壓力估一ＦＲＫ算，基因受偏向正向的選擇作用。最后我們將高梁與甘薦的進(jìn)化分支時間定？位為５．４７．０５百萬年前，熱帶種與割手密的分支時間為１．７百萬年。本研究基于兩甘旗親本種與髙梁間的同源序列的比較學(xué)分析，在通過比較學(xué)獲取目的基因的同時一，也初步地揭示了熱帶種與割手密的基因組信息，進(jìn)步豐富對甘藏基因組的認(rèn)識。關(guān)
8、鍵詞：同源比較；Ｆ村ｉｋｅ基因；熱帶種：割手密；Ｉ．？ＡｂｓｔｒａｃｔＡｂｓｈａｃｒｔＲｏｕｎｄｓｏｆＩｎｔｅｒｓｐｅｃ姐ｃｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎａｎｄｂａｃｋｃｒｏ化ｂｅｔｗｅｅｎ說ｃｃ片ａｒｗｗｏｆｉｃｉｍｒｕｍａｎｄＳａｃｃｈａｒｕｍｓｐｏｎｔａｎｅｕｍｐｒｏｄｕｃｅｄ
