侵染勝紅薊和假馬鞭的雙生病毒的分子鑒定

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1、浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文侵染勝紅薊和假馬鞭的雙生病毒的分子鑒定姓名:范三微申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師:周雪平2003.5.1致謝本論文是在導(dǎo)師周雪平教授的悉心指導(dǎo)下完成的,從論文立題、構(gòu)思、實(shí)驗(yàn)到撰寫的過程中,無不傾注了導(dǎo)師的心血和智慧。導(dǎo)師嚴(yán)謹(jǐn)?shù)闹螌W(xué)態(tài)度、執(zhí)著的敬業(yè)精神以及在學(xué)術(shù)方面的造詣。使我在病毒室學(xué)習(xí)的三年中受益匪淺;導(dǎo)師給予的兄長般的點(diǎn)滴關(guān)懷使我倍感溫暖。借此機(jī)會(huì),我要向一直給予我鼓勵(lì)和教誨的導(dǎo)師表示誠摯的敬意和深深的感謝!病毒室的李桂新老師在實(shí)驗(yàn)室的管理方面盡心盡力,創(chuàng)造了一個(gè)良好的學(xué)習(xí)環(huán)境,同時(shí)李老師在生活上給予我很多幫助,提出過很多良好的建議,其獨(dú)特的人格

2、魅力值得我尊敬。吳建祥老師也曾給過我悉心的指導(dǎo),在此向你們表示衷心的感謝!還有病毒室的兄弟姐妹們,無論在學(xué)習(xí)還是在生活中你們都是我的良師益朋友,在實(shí)驗(yàn)方面你們都曾給過我熱心的指導(dǎo)和幫助,在此向你們說聲感謝!能與你們在同一個(gè)實(shí)驗(yàn)室學(xué)習(xí)我深感榮幸。我也要向所有關(guān)心我支持我給過我?guī)椭呐笥驯硎靖兄x!最后,我要感謝我的親人,他們是我能夠安心學(xué)習(xí)的堅(jiān)強(qiáng)后盾,他們給予我的愛是我人生中最寶貴的財(cái)富!范三微2003年5月18日杭州塑望奎堂堡圭蘭垡鯊j∑—————————————一摘要本研究對侵銎勝窒[塑(Agerat“,'lconyzoides)和!!!燮(Stachytarphetajamaicensis)

3、的雙生病毒進(jìn)行了分子鑒定,并獲得如下結(jié)果:+--I●___-_‘a(chǎn)。一利用三抗體夾心ELISA(TAS—ELISA)及PCR檢測的方法對采白海南的勝紅薊(Ageratu腳conyzoides)和假馬鞭(StachytarpheCajamaicensis)的5個(gè)病樣進(jìn)行了檢測,表明均為粉虱傳雙生病毒。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物克隆后進(jìn)行序列測定,結(jié)果表明存在兩類雙生病毒,其中樣品Hn2存在兩類病毒的復(fù)合侵染。這是在海南首次報(bào)道存在有粉虱傳雙生病毒。在此基礎(chǔ)上我們對勝紅薊和假馬鞭上WTGs基因組進(jìn)行了研究。,/從勝紅薊樣本Hn2中克隆并測定了兩個(gè)ONA—A全序列(Hn2一l和Hn2—19),經(jīng)NCBI檢索和序

4、列比較分析發(fā)現(xiàn),Hn2-t除與勝紅薊黃脈病毒(AYVV,基因登錄號(hào)X74516)有85.6%的同源性外,其余均在85.0%以下。根據(jù)雙生病毒全基因組核營酸序列同源性小于89%為不同病毒的原則,我們將這些病毒分離物命名為中國勝紅薊黃脈病毒,英文名為AgeratumyellowveinChinavirus(AYVCNV)。Hn2—19和Hn2—1為Hn2樣品中擴(kuò)增到的不同分子,其基因組序列同源性高達(dá)97.7%,這表明Hn2中存在同種雙生病毒的不同分離物的復(fù)合侵染。從假馬鞭樣本Hn5和Hn6中克隆并測定了三個(gè)DNA—A全序列(Hn5.4、Hn5.1和Hn6-1),經(jīng)NCBI檢索和序列比較分析發(fā)現(xiàn),H

5、n5.1、Hn5.4和Hn6.1基因組均與亞洲報(bào)道的粉虱傳雙生病毒的基因組同源性最高。Hn5.4、Hn5.1和Hn6.13個(gè)序列闖同源性>95%,與印度尼西亞報(bào)道的番茄曲葉病毒(ToLCV,基因登錄號(hào)ABl00305)的同源性最高,為81.5%。根據(jù)雙生病毒分類命名原則,Hn5.1、Ha5.4和Hn6.1為同種病毒的不同分離物,我們將這些病毒分離物命名為假馬鞭曲葉病毒(Stachytarphetaleat"curlvirus,StaLCV)。Hn5一l和Hn5—4為從Hn5樣品中擴(kuò)增到的2個(gè)不同的分了,說明Hn5中存在同種病毒不同分離物的復(fù)合侵染。^產(chǎn)’一一塑婆查蘭堡主蘭堡笙壅————————

6、—————————p———————————_————————————————————————一。AbstractGeminivirusesinfectingAgeratumconyzoidesandStac砂tarphetajamaicensiswereidentifiedwithmoleculardatainthispaper.5virussamplescollectedfromAgeratumconyzoidesandStachytarphetajamaicensisinHainanweredetectedwithtripleantibodysandwichELISA(TAS—ELISA)

7、andPCR,resultsshowedallthevirussampleswereinfectedbywhitefly-transmittedgeminiviruses.Sequenceanalysesshowedtwotypesofvirusesexistedamongthosesamples,andsampleHn2wasmix—infectedbytWOtypesofviruses.Ont

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