我國常見補(bǔ)血草屬植物的葉綠體功能基因組研究

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1、分類號(hào):P735學(xué)號(hào):201500370001碩士學(xué)位論文我國常見補(bǔ)血草屬植物的葉綠體功能基因組研究StudyonchloroplastfunctionalgenomicsofsomepopularspeciesinLimoniumMill研究生姓名:艾麗花指導(dǎo)教師:陳世華副教授學(xué)科門類:理學(xué)專業(yè)名稱:海洋生物學(xué)論文提交日期:2018年4月1日煙臺(tái)大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要補(bǔ)血草屬植物屬于泌鹽鹽生植物,其葉綠體基因組研究對(duì)詮釋此類植物的系統(tǒng)發(fā)育,適應(yīng)鹽脅迫相關(guān)的分子遺傳機(jī)制具有重要意義。本研究選用采自黃渤海沿海灘涂地區(qū)的中華補(bǔ)血草,煙臺(tái)補(bǔ)血草,采自內(nèi)蒙地

2、區(qū)的二色補(bǔ)血草,青海地區(qū)的黃花補(bǔ)血草以及采自新疆地區(qū)的大葉補(bǔ)血草為實(shí)驗(yàn)材料。其中中華補(bǔ)血草和二色補(bǔ)血草在形態(tài)上不易區(qū)分、模式標(biāo)本分布區(qū)域也非常相似,因此分別以同一區(qū)域形態(tài)差異較大的煙臺(tái)補(bǔ)血草,中華補(bǔ)血草及不同區(qū)域的大葉補(bǔ)血草,黃花補(bǔ)血草為對(duì)照。利用分子生物學(xué)技術(shù)對(duì)其進(jìn)行鑒定,并分析其葉綠體基因組組成、基因結(jié)構(gòu)、編碼區(qū)和非編碼區(qū)序列組成、特點(diǎn)等,以此來確定它們之間的的系統(tǒng)發(fā)育、進(jìn)化及系統(tǒng)發(fā)生與各物種耐受干旱及鹽脅迫間的關(guān)系;其葉綠體基因功能的研究也對(duì)深入了解葉綠體編碼基因在脅迫應(yīng)答和光合作用中的功能具有重要意義。主要結(jié)果如下:1.5種補(bǔ)血草屬植物的系

3、統(tǒng)進(jìn)化分析。利用DNA條形碼技術(shù),基于核基因ITS,葉綠體基因psbA-trnH和trnL-trnF所建立的系統(tǒng)鄰接樹顯示:對(duì)于中華補(bǔ)血草、煙臺(tái)補(bǔ)血草、大葉補(bǔ)血草、黃花補(bǔ)血草、二色補(bǔ)血草及本地補(bǔ)血草樣品1、2、3號(hào)8個(gè)樣品,只有大葉補(bǔ)血草與其它7個(gè)樣品親緣關(guān)系較遠(yuǎn),序列差異較大,用三對(duì)引物均可明顯鑒別。而其他7個(gè)樣品之間差別不大,無法利用ITS,psbA-trnH,trnL-trnF三對(duì)引物對(duì)其進(jìn)行鑒定或?qū)ζ湎到y(tǒng)進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行分析。2.5種補(bǔ)血草屬植物葉綠體基因組的高通量測(cè)序及葉綠體基因組組成、結(jié)構(gòu)和功能分析。通過高鹽低pH法對(duì)中華補(bǔ)血草葉綠體基因組

4、DNA進(jìn)行提取和純化,經(jīng)高通量二代測(cè)序后,成功獲得了5種中國常見補(bǔ)血草屬植物的葉綠體基因組序列,通過對(duì)中華補(bǔ)血草葉綠體基因組組成進(jìn)行分類,以及對(duì)5種補(bǔ)血草植物的葉綠體基因組組成進(jìn)行比較分析,發(fā)現(xiàn)了66個(gè)共有蛋白編碼基因,通過對(duì)66個(gè)共有基因進(jìn)行比對(duì),初步揭示了5種補(bǔ)血草屬植物的進(jìn)化關(guān)系。3.5種補(bǔ)血草屬植物的耐鹽、抗旱性分子機(jī)理探究。利用qRT-PCR技術(shù)分別對(duì)5種補(bǔ)血草屬植物在200mmol/LNaCl鹽脅迫和20%PEG-6000模擬干旱脅迫處理不同時(shí)間下atpA、psaA、psbA、petA、ndhA、POD、APXI煙臺(tái)大學(xué)碩士學(xué)位論文和N

5、HX1基因的表達(dá)量進(jìn)行分析,從分子層面對(duì)補(bǔ)血草屬植物的耐鹽抗旱機(jī)制進(jìn)行了初步探究。關(guān)鍵詞:補(bǔ)血草屬植物;葉綠體基因組;DNA條形碼;耐鹽;抗旱II煙臺(tái)大學(xué)碩士學(xué)位論文AbstractLimoniumMillbelongstosaltsecretinghalophytes.Thestudyofchloroplastgenomeisofgreatsignificancetothesystemdevelopmentofsuchplantsandthemoleculargeneticmechanismrelatedtosaltstress.Inthisst

6、udy,3species,Limoniumsinense(Girard)Kuntze,Limoniumbicolor(Bunge)Kuntze,LimoniumfranchetiiKuntzewerecollectedfromHuangbohaicoastalbeacharea,and2species,Limoniumgmelinii(Willd)KuntzeandLimoniumaureum(Linn)HillwascollectedfromXinjiangandQinghairegion.Thefirsttwospecieswerenoteas

7、ilydistinguishableinmorphology,andthedistributionareasofthemodelspecimenswerealsoverysimilar.Therefore,theywerecomparedwithLimoniumfranchetiiKuntze,Limoniumaureum(Linn)whitchcollectedfromthesameregionwhilehavingmarked,differencesinmorphology,andwithLimoniumgmelinii(Willd)Kuntz

8、ecollectedindifferentregionsasacontrol.Inordertodeterminethep

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