地中海實蠅及其近緣種和桔小實蠅復(fù)合種基因芯片的研制及應(yīng)用

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1、摘要檢疫性實蠅的鑒定是國際果蔬貿(mào)易中最突出的技術(shù)問題之一。我國農(nóng)業(yè)部最新頒布的進(jìn)境植物檢疫性有害生物名錄將小條實蠅屬Ceratitis、果實蠅屬BactroceraylJ入其中。目前,實蠅的口岸檢疫鑒定以傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定為主,此方法對鑒定者經(jīng)驗依賴性強(qiáng),受實蠅蟲態(tài)、飼養(yǎng)周期等的限制。常規(guī)分子生物學(xué)的方法,如PCR、探針雜交等檢測技術(shù)只能一次對一種實蠅進(jìn)行檢測,不能滿足實際檢測的需要。基因芯片技術(shù)不但可以彌補(bǔ)上述方法自動化程度低、檢測分子數(shù)量少和低通量等不足之處,而且能大大提高檢測效率。本研究應(yīng)用基因芯片技術(shù),建立了地中海實

2、蠅Ccapitata及其近緣種和桔小實蠅丑dorsalis復(fù)合種兩種基因芯片,用于地中海實蠅三個近緣種和桔小實蠅五個復(fù)合種的鑒定,同時具有小條實蠅屬、果實蠅屬實蠅初篩的功能。本研究獲得了如下主要結(jié)果:1.地中海實蠅及其近緣種和桔小實蠅復(fù)合種基因芯片的制備選擇線粒體DNA(mtDNA)細(xì)胞色素氧化酶I基I因(COI)為分子標(biāo)記基因,根據(jù)Genbank發(fā)表的實蠅科昆蟲mtDNA.COI序列,運(yùn)用DNAstar軟件,分析基因序列間的差異性,先后設(shè)計合成通用引物2對。在通用引物擴(kuò)增區(qū)間內(nèi),設(shè)計了檢測探針16條,分別是實蠅科通用探針

3、1條,小條實蠅屬通用探針1條,果實蠅屬通用探針1條,桔小實蠅亞屬通用探針1條,地中海實蠅、芒果小條實蠅Ccosary和納塔爾小條實蠅Crosa近緣種探針2條和種特異探針4條,桔小實蠅、木瓜實她papayae、楊桃實衄carambolae、菲律賓實她philippinensis、芒果實衄occipitalis等復(fù)合種探針6條;設(shè)計了質(zhì)控探針3條,分別是定位點(diǎn)探針、陽性質(zhì)控探針和陰性質(zhì)控探針各1條。將探針按照相應(yīng)陣列點(diǎn)樣至醛基化基片,用NANO.PLOTrER2芯片點(diǎn)樣儀分別點(diǎn)樣,制備出地中海實蠅及其近緣種芯片和桔小實蠅復(fù)合種

4、芯片兩種檢測芯片。2.地中海實蠅及其近緣種和桔小實蠅復(fù)合種基因芯片雜交條件的優(yōu)化芯片雜交條件的優(yōu)化主要包括芯片雜交體系模板DNA濃度(O.09ng//tL,O.18ng//aL,0.45ng/,uL,0.9ng/,uL)、雜交時間(1h,2h,6h)、雜交液濃度(O.5xSSPE,2%SDS;lxSSPE,2%SDS;5xSSPE,2%SDS;7.5xSSPE,2%SDS10xSSPE,2%SDS;3xBlocking)和雜交溫度(42℃,44℃,46℃)的優(yōu)化。篩選出當(dāng)模板DNA濃度為0.9n幽L;雜交時間3h;雜交液濃

5、度為:10xSSPE,2%SDS;雜交溫度為46℃時,能獲得較好的雜交信號。3.地中海實蠅及其近緣種和桔小實蠅復(fù)合種兩種基因芯片的初步應(yīng)用用制備好的地中海實蠅及其近緣種基因芯片檢測了地中海實蠅(不同蟲態(tài)和地理種)、納塔爾小條實蠅和芒果小條實蠅;用桔小實蠅復(fù)合種基因芯片檢測了楊桃實蠅(不同蟲態(tài))、桔小實蠅、木瓜實蠅、菲律賓實蠅、芒果實蠅,兩種芯片的檢測結(jié)果與常規(guī)形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果完全吻合。結(jié)果表明兩種基因芯片可以作為實蠅快速檢測的一種重要手段。關(guān)鍵詞:實蠅科,地中海實蠅,桔小實蠅,近緣種,復(fù)合種,基因芯片,分類鑒定jnABSTR

6、ACTIdentificationofQuarantinefruitfly(Diptera:Tephritidae)isoneofthemostimportanttechniqueproblemintheinternationalfruitsandvegetabletrade.ThelatestpublishedquarantinelistofChinahasincludeedtheCeratitisMacleayandBactroceraMacqurtasdetrimentalorganisms.Currentmetho

7、dforidentificationoffruitflymainlyba,sedonthemorphologicalmethod.However,itdependsontheexperienceofidentifiersandisrestrainedfromtheshapeandthebreedingperiodoffruitfly.PeRtechniqueisarapid,precisemethodforthedetectionoffruitnv.butcurrentmethodsbasedPeRonlycandetec

8、tonesortoffruitflyeachtime,whichcannotsatisfytheactualapplieddemands.ThisstudyestablishamethodofgenechipfortheidentifyingofCeratitiscapitata,anditsrelat

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