系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建PPT構(gòu)建步驟

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1、多序列比對(duì)及 系統(tǒng)發(fā)生樹的構(gòu)建——鄒長(zhǎng)江主要目的:了解分子進(jìn)化及系統(tǒng)發(fā)育分析掌握多序列比對(duì)方法熟悉系統(tǒng)發(fā)育樹建立方法掌握用Mega軟件進(jìn)行構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹系統(tǒng)發(fā)生(phylogeny)——是指生物形成或進(jìn)化的歷史系統(tǒng)發(fā)生學(xué)(phylogenetics)——研究物種之間的進(jìn)化關(guān)系系統(tǒng)發(fā)育樹(phylogenetictree)——描述物種之間進(jìn)化關(guān)系系統(tǒng)發(fā)育樹(phylogenetictree)——又稱evolutionarytree進(jìn)化樹)就是描述這一群有機(jī)體發(fā)生或進(jìn)化順序的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。它可以用來研究不同物種間的進(jìn)化關(guān)系,這一直是生物學(xué)的研究熱點(diǎn)。拓?fù)洌═opology)將討論范圍內(nèi)的事物之間

2、的相互關(guān)系表示出來,將這些事物之間的關(guān)系通過圖表示出來。兩個(gè)臨近的分支的連接處稱為節(jié)點(diǎn)(node),表示推斷祖先的現(xiàn)存類群在樹最底部的分支點(diǎn)成為根節(jié)(rootnode),一個(gè)單一的共同的祖先被定義為進(jìn)化支(clade)或者單源群(monophyleticgroup)樹的分支模式被成為拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)(treetopology)系統(tǒng)發(fā)育樹建立方法NCBI——BLAST——輸入序列對(duì)比——記錄好以下幾方面:名稱:UnculturedbacteriumcloneYU201H10序列號(hào):FJ694683/FJ694514文獻(xiàn):TITLECircumpolarsynchronyinbigriverbact

3、erioplankton序列長(zhǎng)度:353相似比:99%核酸序列分類地位Mega下載地址http://www.megasoftware.net/沒有一種方法能夠保證一棵系統(tǒng)發(fā)育樹一定代表了真實(shí)進(jìn)化途徑。然而,有些方法可以檢測(cè)系統(tǒng)發(fā)育樹檢測(cè)的可靠性。第一,如果用不同方法構(gòu)建樹能得到同樣的結(jié)果,這可以很好的證明該樹是可信的第二,數(shù)據(jù)可以被重新取樣,來檢測(cè)他們統(tǒng)計(jì)上的重要性。謝謝!

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