外源基因的表達1

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1、第七章外源基因的表達第一節(jié)外源基因在原核細胞中的表達1.原核生物基因表達的特點與真核細胞相比,原核細胞的基因表達有以下特點:(1)原核生物只有一種RNA聚合酶(真核細胞有三種)識別原核細胞的啟動子,催化所有RNA的合成。(2)原核生物的基因表達是以操縱子為單位的。(3)由于原核生物無核膜,所以轉(zhuǎn)錄與翻譯是偶聯(lián)的,也是連續(xù)進行的。(4)原核基因一般不含有內(nèi)含子,在原核細胞中缺乏真核細胞的轉(zhuǎn)錄后加工系統(tǒng)。(5)原核生物基因的控制主要在轉(zhuǎn)錄水平,這種控制要比對基因產(chǎn)物的直接控制要慢。(6)在大腸桿菌mRNA的核糖體結合位點上,含有一個轉(zhuǎn)譯起始密碼子及1

2、6S核糖體RNA3’末端堿基互補的序列,即S-D序列,而真核基因則缺乏此序列。2.原核表達系統(tǒng)的注意事項從上述特點可以看出,欲將外源基因在原核細胞中表達,必須考慮表達載體、外源基因的性質(zhì)、原核細胞的啟動子和S-D序列、閱讀框架及宿主菌調(diào)控系統(tǒng)等基本條件,也就是說必須滿足以下條件:(1)通過表達載體將外源基因?qū)胨拗骶⒅笇拗骶拿赶到y(tǒng)合成外源蛋白。(2)外源基因不能帶有內(nèi)含子,因而必須用cDNA或化學合成的基因,而不能用基因組DNA。(3)必須利用原核細胞的強啟動子和S-D序列等調(diào)控元件控制外源基的表達。(4)外源基因與表達載體連接后,必須形

3、成正確的開放閱讀框架。(5)利用宿主菌的調(diào)控系統(tǒng),調(diào)節(jié)外源基因的表達,防止外源基因的表達產(chǎn)物對宿主菌的傷害。3.原核生物基因表達的調(diào)控序列只有在了解了原核生物基因表達調(diào)控序列的基礎上,才能夠構建高效的表達載體,使外源目的基因在原核細胞中得到高效率、高水平地表達。對于原核細胞來講,基因表達的調(diào)控序列主要涉及啟動子、S-D序列、終止子、增強子、衰減子等序列。(1)啟動子啟動子(promoter)是DNA鏈上一段能與RNA聚合酶結合并能起始mRNA合成的序列,它是基因表達不可缺少的重要調(diào)控序列。沒有啟動子,基因就不能轉(zhuǎn)錄。原核生物的啟動子是由兩段彼此分

4、開且高度保守的核苷酸序列組成。■-35區(qū)(TTGACA):位于轉(zhuǎn)錄起始位點上游的-35bp附近,是RNA聚合酶初始識別和結合位點?!?10區(qū)(Pribnow框,TATAAT):RNA聚合酶結合于此處導致DNA雙鏈形成單鏈。原核表達系統(tǒng)中通常使用的可調(diào)控的強啟動子有l(wèi)ac(乳糖啟動子)、trp(色氨酸啟動子)、PL及PR(λ噬菌體左向和右向啟動子)、tac(乳糖和色氨酸的雜合啟動子)等。(2)終止子在一個基因或一個操縱子的3’端往往有一個特定的核苷酸序列,它有終止轉(zhuǎn)錄的功能,這一段DNA序列稱為終止子(terminator)。終止子在結構上有一些共

5、同的特點,即有一段富含A/T的區(qū)域和一段富含G/C的區(qū)域,G/C區(qū)域具有回文對稱結構,使轉(zhuǎn)錄后的RNA具有莖環(huán)結構。根據(jù)轉(zhuǎn)錄終止作用類型,終止子可分為兩種:依賴于ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止子及不依賴于ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止子。(3)S-D序列S-D序列是位于起始密碼子(AUG)上游3~10bp處的由3~9bp組成的序列。這段序列正好與16SrRNA3’端序列互補,是rRNA的識別和結合位點。S-D序列存在與否及S-D序列與起始密碼子之間的距離,是影響mRNA翻譯成蛋白質(zhì)的主要因素之一。(4)增強子增強子(enhancer)是能夠增強啟動子轉(zhuǎn)錄活性的DNA順式作用

6、序列。4.幾種類型的原核表達載體在原核細胞中表達外源基因時,由于實驗設計的不同,總的來說可以產(chǎn)生融合型和非融合型表達蛋白。不與細菌的任何蛋白或多肽融合在一起的表達蛋白稱為非融合蛋白。融合蛋白指蛋白質(zhì)的N末端由原核DNA序列或其它DNA序列編碼,C端由真核DNA的完整序列編碼。(1)非融合型表達蛋白載體pKK223-3具有一個強的tac(trp-lac)啟動子,這個啟動子是由trp啟動子的-35區(qū)、lacUV5啟動子的-10區(qū)、操縱基因及S-D序列組成。緊接著tac啟動子的是一個取自pUC8的多位點接頭,使之很容易把目的基因定位在啟動子和S-D序列

7、之后。在多位點下游的一段DNA序列中,還包含一個很強的rrnB核糖體RNA的轉(zhuǎn)錄終止子。載體的其余部分由pBR322組成。(2)分泌型克隆表達載體pINIII系統(tǒng)這個載體系統(tǒng)是由pBR322為基礎構建的。帶有大腸桿菌最強的啟動子之一,即Ipp(脂蛋白基因)啟動子。在啟動子的下游裝有l(wèi)acUV5的啟動子及其操縱基因,并把lac阻遏子的基因(lacI)也克隆到這個質(zhì)粒上。這樣目的基因的表達就成為可調(diào)節(jié)的了。在轉(zhuǎn)錄控制的下游再裝上人工合成的高效翻譯起始序列(S-D序列及ATG)。信號肽序列取自于大腸桿菌中分泌蛋白的基因ompa(外膜蛋白基因)。在編碼序

8、列的下游緊接著一段人工合成的多克隆位點片斷,包括三個單一酶切位點,EcoRI、HindIII、BamHI。(3)融合蛋白表達載體pGEX

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