基因表達(dá)與蛋白質(zhì)純

基因表達(dá)與蛋白質(zhì)純

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資源描述:

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1、報(bào)告人曹雪美基因表達(dá)與蛋白質(zhì)純化技術(shù)探討讀書報(bào)告2010年9月30日主要內(nèi)容基因表達(dá)體系及優(yōu)劣勢大腸桿菌中表達(dá)蛋白質(zhì)及純化方法可能碰到的問題什么是基因表達(dá)呢?基因表達(dá)(geneexpression)是指儲存遺傳信息的基因經(jīng)過一系列步驟表現(xiàn)出其生物功能的整個(gè)過程。典型的基因表達(dá)是基因經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、翻譯,產(chǎn)生有生物活性的蛋白質(zhì)的過程?;虮磉_(dá)體系1.原核體系2.真核體系大腸桿菌(Escherichiacoli)E.coli是重要的原核表達(dá)體系。在重組基因轉(zhuǎn)化入E.coli菌株以后,通過溫度、誘導(dǎo)劑用量以及

2、誘導(dǎo)時(shí)間的控制,誘導(dǎo)其在宿主菌內(nèi)表達(dá)目的蛋白質(zhì),將表達(dá)樣品進(jìn)行SDS-PAGE以檢測表達(dá)蛋白質(zhì)大腸桿菌(Escherichiacoli)遺傳背景清楚,基因工程操作方便,商品化表達(dá)載體種類齊全,表達(dá)效率高;基本不分泌蛋白,易形成包含體(無正確折疊的立體結(jié)構(gòu)),無加糖等修飾枯草桿菌(Bacillussubtilis)分泌蛋白質(zhì)能力強(qiáng),一般有天然立體結(jié)構(gòu);無加糖修飾功能,培養(yǎng)液中蛋白酶活性高,重組蛋白易受蛋白酶的水解;質(zhì)粒不穩(wěn)定,尚無商品化的表達(dá)載體其他乳酸菌(Lacticacidbacteria)沙門

3、氏菌(Salmonellatyphimurium)蘇云金桿菌(Bacillusthuringiensis)真核表達(dá)真核細(xì)胞表達(dá)體系酵母細(xì)胞昆蟲細(xì)胞哺乳動物細(xì)胞/組織植物細(xì)胞/組織酵母細(xì)胞可生產(chǎn)分泌型蛋白;有天然立體結(jié)構(gòu),有加糖修飾功能;可進(jìn)行染色體整合型基因表達(dá);糖鏈與哺乳動物加工的不一致,培養(yǎng)上清多糖濃度高;商品化表達(dá)體系:釀酒酵母(Saccharomycecerevisiae);畢氏酵母(Pichiapastoris);裂殖酵母(Schizosaccharomycepombe)昆蟲細(xì)胞可以病毒

4、感染的型式在成蟲中生產(chǎn),也可在體外培養(yǎng)細(xì)胞中生產(chǎn)蛋白;適合分泌型和膜蛋白的表達(dá),有加糖修飾;糖鏈有所區(qū)別,表達(dá)量有限;作為藥物宿主細(xì)胞未被FDA認(rèn)可CHO細(xì)胞可進(jìn)行分泌表達(dá),有天然立體結(jié)構(gòu),加糖方式與人體蛋白質(zhì)完全一致;表達(dá)量不夠高,培養(yǎng)成本較高植物組織植物可大面積種植,可以廉價(jià)大規(guī)模生產(chǎn);轉(zhuǎn)基因植物制作費(fèi)時(shí),表達(dá)的組織特異性較難控制;表達(dá)量較難提高,分離純化不方便動物乳腺組織分泌生產(chǎn)有天然立體結(jié)構(gòu)和活性的蛋白質(zhì)至乳汁,產(chǎn)量高,分離純化方便,特別適合藥用蛋白的生產(chǎn);轉(zhuǎn)基因動物制作花費(fèi)巨大,實(shí)驗(yàn)周期

5、長原核表達(dá)與真核表達(dá)的區(qū)別1、載體的區(qū)別---整合機(jī)制2、表達(dá)產(chǎn)物的區(qū)別---蛋白修飾的程度區(qū)別表達(dá)類型載體載體舉例產(chǎn)物原核表達(dá)一般簡單,質(zhì)粒不整合到大腸桿菌的DNA而是自己復(fù)制表達(dá)pET系列產(chǎn)物一級結(jié)構(gòu)正確,但折疊不一定正確,沒有糖基化和磷酸化等修飾真核表達(dá)一般由宿主細(xì)胞匹配的整合機(jī)制的載體整合載體在基因組上表達(dá)酵母Y系列產(chǎn)物一般修飾的比較好,糖基化等完全,更接近天然蛋白體系選擇研究基因功能:大腸桿菌,裂殖酵母,昆蟲細(xì)胞,CHO細(xì)胞多肽藥物生產(chǎn):大腸桿菌,畢氏酵母,CHO細(xì)胞,乳腺組織疫苗:大腸

6、桿菌,酵母,大多數(shù)沿用細(xì)胞培養(yǎng)產(chǎn)物進(jìn)行滅毒單抗生產(chǎn):雜交瘤細(xì)胞工業(yè)酶生產(chǎn):各種微生物在大腸桿菌中表達(dá)外源基因獲得目的基因→準(zhǔn)備表達(dá)載體→將目的基因插入表達(dá)載體中(測序驗(yàn)證)→轉(zhuǎn)化表達(dá)宿主菌→誘導(dǎo)靶蛋白的表達(dá)→表達(dá)蛋白的分析→擴(kuò)增、純化、進(jìn)一步檢測原核表達(dá)一般程序(一)獲得目的基因1、通過PCR方法:以含目的基因的克隆質(zhì)粒為模板,按基因序列設(shè)計(jì)一對引物(在上游和下游引物分別引入不同的酶切位點(diǎn)),PCR循環(huán)獲得所需基因片段。2、通過RT-PCR方法:用TRIzol法從細(xì)胞或組織中提取總RNA,以mRN

7、A為模板,逆轉(zhuǎn)錄形成cDNA第一鏈,以逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為模板進(jìn)行PCR循環(huán)獲得產(chǎn)物。原核表達(dá)操作步驟(二)構(gòu)建重組表達(dá)載體1、載體酶切:將表達(dá)質(zhì)粒用限制性內(nèi)切酶(同引物的酶切位點(diǎn))進(jìn)行雙酶切,酶切產(chǎn)物行瓊脂糖電泳后,用膠回收Kit或凍融法回收載體大片段。2、PCR產(chǎn)物雙酶切后回收,在T4DNA連接酶作用下連接入載體。1、將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,根據(jù)重組載體的標(biāo)志(抗Amp或藍(lán)白斑)作篩選,挑取單斑,堿裂解法小量抽提質(zhì)粒,雙酶切初步鑒定。2、測序驗(yàn)證目的基因的插入方向及閱讀框架均正確,進(jìn)入下步操作

8、。否則應(yīng)篩選更多克隆,重復(fù)亞克隆或亞克隆至不同酶切位點(diǎn)。3、以此重組質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)化表達(dá)宿主菌的感受態(tài)細(xì)胞。(三)獲得含重組表達(dá)質(zhì)粒的表達(dá)菌種1、挑取含重組質(zhì)粒的菌體單斑至2mlLB(含Amp50μg/ml)中37℃過夜培養(yǎng)。2、按1∶50比例稀釋過夜菌,一般將1ml菌加入到含50mlLB培養(yǎng)基的300ml培養(yǎng)瓶中,37℃震蕩培養(yǎng)至OD600≌0.4-1.0(最好0.6,大約需3hr)。3、取部分液體作為未誘導(dǎo)的對照組,余下的加入IPTG誘導(dǎo)劑至終濃度0.4mM作為實(shí)驗(yàn)組,兩組繼續(xù)3

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