基因表達2蛋白質(zhì)翻譯

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1、第五章蛋白質(zhì)翻譯(ProteinTranslation)翻譯:指將mRNA鏈上的核苷酸從一個特定的起始位點開始,按每三個核苷酸代表一個氨基酸的原則,依次合成一條多肽鏈的過程。蛋白質(zhì)合成的場所是蛋白質(zhì)合成的模板是模板與氨基酸之間的接合體是蛋白質(zhì)合成的原料是核糖體mRNAtRNA20種氨基酸主要內(nèi)容第一節(jié)蛋白質(zhì)翻譯系統(tǒng)----遺傳密碼、tRNA、核糖體第二節(jié)蛋白質(zhì)的合成第三節(jié)蛋白質(zhì)的運轉(zhuǎn)----起始、肽鏈延伸、肽鏈的終止及釋放、前體加工----翻譯-運轉(zhuǎn)同步、翻譯后運轉(zhuǎn)第一節(jié)蛋白質(zhì)翻譯系統(tǒng)(TranslationSystem)一、遺傳密碼二、tRNA三、核糖體一、遺

2、傳密碼——三聯(lián)子(一)三聯(lián)子密碼mRNA鏈上每三個核苷酸翻譯成蛋白質(zhì)多肽鏈上的一個氨基酸,這三個核苷酸就稱為密碼子(coden)或三聯(lián)子密碼(tripletcoden)。mRNA5′-GCUAGUACAAAACCU-3′(二)密碼破譯遺傳密碼的破譯,即確定代表每種氨基酸的具體密碼。破譯工作始于1954年,至1966年20種氨基酸對應(yīng)的61個密碼子和3個終止密碼子全部被查清。(三)遺傳密碼的性質(zhì)1、簡并性由一種以上密碼子編碼同一個氨基酸的現(xiàn)象稱為簡并(degeneracy)。減少了變異對生物的影響對應(yīng)于同一氨基酸的密碼子稱為同義密碼子(synonymouscodo

3、n)。其特征為:第一、第二位核苷酸往往相同,而第三位核苷酸的改變不一定影響所編碼的氨基酸。簡述密碼的簡并性(degeneracy)和同義密碼子(synonymouscodon)武漢大學(xué)2003年試題2、普遍性與特殊性蛋白質(zhì)生物合成的整套密碼,從原核生物到人類都通用。已發(fā)現(xiàn)少數(shù)例外,如動物細胞的線粒體、植物細胞的葉綠體。線粒體與核DNA密碼子使用情況的比較3、連續(xù)性編碼蛋白質(zhì)氨基酸序列的各個三聯(lián)體密碼連續(xù)閱讀,密碼子間既無間斷也無交叉。基因損傷引起mRNA開放式閱讀框架(openreadingframe,ORF)內(nèi)的堿基發(fā)生插入或缺失,會導(dǎo)致整個閱讀框架移位(fr

4、ameshift)。4、擺動性轉(zhuǎn)運氨基酸的tRNA上的反密碼子需要通過堿基互補與mRNA上的遺傳密碼子反向配對結(jié)合,在密碼子與反密碼子的配對中,前兩對嚴格遵守堿基配對原則,第三對堿基有一定的自由度,可以“擺動”,這種現(xiàn)象稱為密碼子的擺動性(wobble)。mRNA上的密碼子與tRNA上的反密碼子配對示意圖tRNA上的反密碼子與mRNA上的密碼子的配對與“擺動”分析二、tRNA的結(jié)構(gòu)、功能與種類tRNA在蛋白質(zhì)生物合成過程中起關(guān)鍵作用。tRNA不但為每個三聯(lián)密碼子翻譯成氨基酸提供了接合體,還為準確無誤地將所需氨基酸運送到核糖體上提供了運送載體,所以它又被稱為第二遺

5、傳密碼。原核生物中大約有30-45種tRNA,真核細胞中可能存在50種tRNA。(一)tRNA的結(jié)構(gòu)最常見tRNA分子有76個堿基,相對分子質(zhì)量約為2.5×104,不同的tRNA分子可有74~95個核苷酸不等。tRNA的稀有堿基含量非常豐富,約有70余種。每個tRNA分子至少含有2個稀有堿基,最多有19個,多數(shù)分布在非配對區(qū),特別是在反密碼子3′端鄰近部位出現(xiàn)的頻率最高,對于維持反密碼環(huán)的穩(wěn)定性、密碼子和反密碼子之間的配對很重要。1、tRNA的二級結(jié)構(gòu)不同tRNA在結(jié)構(gòu)上存在大量的共性,由小片段堿基互補配對形成三葉草形分子結(jié)構(gòu),有5條根據(jù)結(jié)構(gòu)或已知功能命名的手臂

6、和4個環(huán)。D臂/環(huán)(Darm/loop)D臂是根據(jù)它含有特殊的堿基D(Dihydrouracil,二氫尿嘧啶)命名的;一般有2–3個D堿基;莖區(qū)長度常為4bp;氨基酰tRNA聚合酶結(jié)合反密碼子臂/環(huán)(anti-codonarm/loop)莖區(qū)長度常為5bp的配對;環(huán)區(qū)含有反密碼子(anti-codon);負責對mRNA上的密碼子的識別與配對。額外臂/環(huán)(Extraarm/loop)長度可變性大,從4nt到21nt不等;有些tRNA沒有額外臂/環(huán);連接兩個區(qū)域(D-反密碼子臂和TψC-受體臂)。TψC臂/環(huán)(TψCarm/loop)特殊的堿基ψ(假尿嘧啶);莖區(qū)長

7、度常為5bp的配對;負責和核糖體上的rRNA識別結(jié)合;受體臂(acceptorarm)tRNA的5′與3′-末端7bp堿基配對形成的桿狀結(jié)構(gòu)和3‘端未配對的3-4個堿基所組成;3′端的最后3個堿基序列永遠是CCA,最后一個堿基A的3′或2′自由羥基(-OH)可以被氨?;回撠煍y帶氨基酸。2、tRNA的三級結(jié)構(gòu)研究酵母tRNAPhe、tRNAfMet和大腸桿菌tRNAfMet、tRNAArg等的三級結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)都呈L形折疊式。酵母tRNAphe的三級結(jié)構(gòu)示意圖(根據(jù)X-射線衍射數(shù)據(jù)繪制)。a和b表示用不同方法構(gòu)建的模型。D臂和反密碼子臂的桿狀區(qū)域形成了第二個雙螺旋。

8、“L”形三級結(jié)構(gòu)組成特點

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