農(nóng)學(xué)]考研農(nóng)學(xué)生化沖刺班講義a版本

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1、考研農(nóng)學(xué)沖刺班 生物化學(xué)復(fù)習(xí)的原則:總體把握理解原理注意細(xì)節(jié)融會(huì)貫通結(jié)構(gòu)(氨基酸/蛋白質(zhì))性質(zhì)如何用結(jié)構(gòu)解釋性質(zhì),或:特定的性質(zhì)與何種結(jié)構(gòu)有關(guān)。功能結(jié)構(gòu)與功能密切相關(guān),特定的功能必然具有特定的結(jié)構(gòu)。第二章蛋白質(zhì)化學(xué)——復(fù)習(xí)要點(diǎn)分類基本結(jié)構(gòu)縮寫蛋白質(zhì)中的常見氨基酸性質(zhì)酸堿性質(zhì)立體化學(xué)紫外吸收化學(xué)反應(yīng)第二章蛋白質(zhì)化學(xué)——蛋白質(zhì)氨基酸第二章蛋白質(zhì)化學(xué)——肽肽鍵氨基酸殘基肽鏈的方向天然多肽谷胱甘肽第二章蛋白質(zhì)化學(xué)——蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次(6個(gè)層次)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系(Ctyc,Hb)空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系(RNase,H

2、b)蛋白質(zhì)的性質(zhì)蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì);紫外吸收(280nm);變性與復(fù)性;變性蛋白質(zhì)的特性;蛋白質(zhì)的顯色反應(yīng)(定量測(cè)定)蛋白質(zhì)的純化重點(diǎn):電泳、層析、離心例題與解析水溶液中(pH7.0),非極性氨基酸一般處于球狀蛋白質(zhì)分子的內(nèi)部,而極性氨基酸一般處于球狀分子的表面。問(wèn):⑴下列氨基酸中,哪些最有可能處于分子內(nèi)部?哪些最有可能處于分子表面?Val、Pro、Phe、Asp、Lys、Ile、His。⑵為什么Gly和Ala通常既可能處于分子內(nèi)部也可能處于分子表面?答:(1)Val、Pro、Phe、Ile都是疏水氨基酸,一般處于球狀蛋白質(zhì)分子的內(nèi)部。Asp、

3、Lys、His是極性氨基酸,一般處于分子的表面。(2)Gly和Ala的側(cè)鏈很小,不足以產(chǎn)生較強(qiáng)的疏水作用,因此可以處于分子的內(nèi)部和表面。一種蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量為3600(氨基酸殘基的平均分子量為120)。請(qǐng)問(wèn):1、如果這種蛋白質(zhì)是一條連續(xù)的α-螺旋,它是多長(zhǎng)?2、如果這種蛋白質(zhì)是一條單股的β-折疊,它是多長(zhǎng)?答:蛋白質(zhì)中氨基酸的數(shù)目:3600÷120=30(個(gè)氨基酸)α-螺旋中2個(gè)氨基酸的距離為0.15nm;平行β-折疊股中2個(gè)氨基酸的距離為0.325nm,反平行β-折疊股中2個(gè)氨基酸的距離為0.35nm。所以:1、0.15nm×30=4.

4、5nm2、0.325nm×30=9.75nm(平行)0.35nm×30=10.5nm(反平行)簡(jiǎn)述蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)及其與生物進(jìn)化的關(guān)系。答:一級(jí)結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)多肽鏈中的氨基酸序列。不同物種的親緣關(guān)系越遠(yuǎn),同源蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的差異越大。親緣關(guān)系越近,同源蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的差異越小。與功能密切相關(guān)的氨基酸殘基不變,與進(jìn)化相關(guān)的氨基酸殘基可變。第三章核酸化學(xué)——復(fù)習(xí)要點(diǎn)DNA結(jié)構(gòu)、性質(zhì)RNA結(jié)構(gòu)實(shí)驗(yàn)技術(shù)DNA測(cè)序;PCR第三章核酸化學(xué) ——DNA的結(jié)構(gòu)Chargaff規(guī)則DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)(定義)DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的多態(tài)性(A-,B-,Z

5、-DNA)DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)(定義)DNA的結(jié)構(gòu)要點(diǎn)、參數(shù)及計(jì)算、穩(wěn)定雙螺旋的力第三章核酸化學(xué) ——RNA的結(jié)構(gòu)RNA的結(jié)構(gòu)一級(jí)結(jié)構(gòu)、二級(jí)結(jié)構(gòu)(莖環(huán)結(jié)構(gòu))tRNA的結(jié)構(gòu)一級(jí)結(jié)構(gòu)、二級(jí)結(jié)構(gòu)(三葉草形、四環(huán)四臂)、三級(jí)結(jié)構(gòu)(倒L形)rRNA的結(jié)構(gòu)核糖體與相應(yīng)的rRNA;真核;原核mRNA的結(jié)構(gòu)原核以及真核mRNA的結(jié)構(gòu);二者結(jié)構(gòu)的區(qū)別第三章核酸化學(xué)——核酸的性質(zhì)核酸的變性核酸的性質(zhì)核酸的復(fù)性增色效應(yīng);Tm值和與Tm值有關(guān)的因素減色效應(yīng)、退火、核酸的分子雜交性質(zhì)純化DNA測(cè)序PCR原理第三章核酸化學(xué)——核酸的性質(zhì)與純化性質(zhì):溶解度、沉降、粘度紫外吸

6、收(260nm)純化:除去蛋白質(zhì);避免大分子降解DNA與蛋白質(zhì)形成的核蛋白易溶于高鹽溶液。RNA與蛋白質(zhì)形成的核蛋白易溶于低鹽溶液,避免RNase的污染。DNA序列測(cè)定(雙脫氧法)反應(yīng)需要引物、模板、dNTP、2’,3’-ddNTP、DNA聚合酶。dNTP是合成DNA的原料ddNTP(雙脫氧核苷三磷酸)使DNA的延長(zhǎng)隨機(jī)終止。用32P標(biāo)記DNA引物的5’端;反應(yīng)體系分成4組,每組加入dNTP和一種2’,3’-ddNTP,合成DNA;電泳分離,放射自顯影;確定核苷酸的排列順序。5’-GATTCGAGCTGA-3’3’-CTAAGCTCGACT-

7、5’被測(cè)序列模板鏈DNA序列測(cè)定(雙脫氧法)94℃變性52℃退火72℃延伸模板DNATaqDNA聚合酶1個(gè)循環(huán)引物(正向)引物(反向)PCR原理例題與解析簡(jiǎn)述DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的基本特征。答案見教科書或講義。簡(jiǎn)述tRNA結(jié)構(gòu)的基本特征答案應(yīng)包括tRNA的一級(jí)、二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu),具體內(nèi)容見教科書或講義。從動(dòng)植物細(xì)胞勻漿中提取基因組DNA時(shí),常用EDTA、氯仿-異戊醇混合液和95%乙醇試劑。請(qǐng)根據(jù)蛋白質(zhì)和核酸的理化性質(zhì)回答:1、該實(shí)驗(yàn)中這些試劑各起什么作用?2、舉出一種可以鑒定所提取基因組DNA中是否殘留RNA的方法。答:EDTA可螯合金屬離子,抑制

8、DNA酶活性。氯仿-異戊醇混合液使蛋白質(zhì)變性,并能除去脂類物質(zhì)。95%乙醇使DNA沉淀。用地衣酚試劑檢測(cè),如果反應(yīng)液呈綠色,說(shuō)明有RNA殘留。檢測(cè)A260/A280

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