NEB常用酶介紹

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1、DpnI識(shí)別位點(diǎn)在不同反應(yīng)緩沖液的活性NEBuffer1.1:100%NEBuffer2.1:100%NEBuffer3.1:75%CutSmartBuffer:100%來源重組E.coli菌株,包含有從DiplococcuspneumoniaeG41(S.Lacks)克隆的DpnI基因。特性CutSmart、重組酶、省時(shí)酶。連接和再切經(jīng)過DpnI20倍過量消化,大約25%的DNA片段能被連接,連接片段中>95%能被再切。反應(yīng)條件CutSmart緩沖液,37℃。熱失活:80℃20分鐘。濃度20,000units

2、/ml?!就ㄟ^pBR322DNA(dam甲基化后)鑒定】。甲基化敏感性只有當(dāng)識(shí)別位點(diǎn)被甲基化時(shí),DpnI才能切割。從dam+菌株純化而來的DNA才是DpnI切割的底物。對(duì)哺乳動(dòng)物基因組DNACpG甲基化敏感。NcoI識(shí)別位點(diǎn)在不同反應(yīng)緩沖液的活性NEBuffer1.1:100%NEBuffer2.1:100%NEBuffer3.1:100%CutSmartBuffer:100%特性重組酶、省時(shí)酶。反應(yīng)條件NEBuffer3.1,37℃。熱失活:80℃20分鐘。濃度10,000和50,000units/ml。甲基

3、化敏感性對(duì)dam、dcm和哺乳動(dòng)物CpG甲基化均不敏感。NotI識(shí)別位點(diǎn)在不同反應(yīng)緩沖液的活性NEBuffer1.1:<10%NEBuffer2.1:50%NEBuffer3.1:100%CutSmartBuffer:25%特性重組酶、省時(shí)酶。反應(yīng)條件NEBuffer3.1,37℃。熱失活:65℃20分鐘。濃度10,000和50,000units/ml。甲基化敏感性對(duì)哺乳動(dòng)物基因組DNACpG甲基化敏感。注意事項(xiàng)徹底消化超螺旋質(zhì)粒需要的NotI酶量為消化線性DNA的5倍。T4DNA連接酶特性■高效連接粘性末端和

4、平末端■T/A克隆■dsDNA切刻修復(fù)■構(gòu)建高豐度克隆文庫■RNA和DNA的連接概述該酶催化雙鏈DNA或RNA上相鄰的5′-磷酸末端和3′-羥基末端形成磷酸二酯鍵。該酶不僅能夠催化平齊末端或粘性末端之間的連接,還可以修復(fù)雙鏈DNA、RNA或DNA/RNA雜交雙鏈中的單鏈切刻。來源純化自E.coliC600pcl857pPLc28lig8。反應(yīng)條件1XT4DNA連接酶反應(yīng)緩沖液[50mMTris-HCl(pH7.5@25℃),10mMMgCl2,10mMDTT,1mMATP]。推薦DNA5′末端濃度為0.1-1.

5、0μM,16℃溫育。熱失活:65℃10分鐘。室溫連接反應(yīng)為方便起見,連接反應(yīng)可以在室溫(20-25℃)條件下進(jìn)行。粘性末端連接:在20μl反應(yīng)體系中加入1μlT4DNA連接酶,反應(yīng)10分鐘。平齊末端連接:在20μl反應(yīng)體系中加入1μlT4DNA連接酶反應(yīng)2小時(shí),或者加入1μl高濃度T4DNA連接酶反應(yīng)10分鐘。另外,NEB快速連接試劑盒[NEB#M2200S(30次反應(yīng)),或NEB#M2200L(150次反應(yīng))]可在室溫下5分鐘內(nèi)完成平齊和粘性末端的連接。單位定義(粘性末端活性單位)1單位指在20μl1XT4D

6、NA連接酶反應(yīng)緩沖液中,16℃反應(yīng)條件下,30分鐘能使50%的經(jīng)HindⅢ消化的λDNA片段[5′端濃度為0.12μM(300μg/ml)]連接所需的酶量。濃度400,000units/ml和2,000,000units/ml。注意事項(xiàng)與E.coliDNA連接酶需要NAD+作輔因子不同,T4DNA連接酶的輔因子是ATP。稀釋后的T4DNA連接酶應(yīng)于-20℃、50%甘油貯存緩沖液(稀釋緩沖液A,NEB#B8001)中保存。如稀釋后馬上使用,也可用1XT4DNA連接酶反應(yīng)緩沖液稀釋。只要在反應(yīng)體系中補(bǔ)加1mMATP

7、,連接反應(yīng)就可以在NEB提供的四種限制性內(nèi)切酶緩沖液或在T4DNA多聚核苷酸激酶反應(yīng)緩沖液中進(jìn)行。參考文獻(xiàn)(1)Engler,M.J.andRichardson,C.C.(1982).InP.D.Boyer(Ed.),TheEnzymes,Vol.5,(p.3).SanDiego:AcademicPress.(2)Remaut,E.,Tsao,H.andFiers,W.,(1983)Gene,22,103–113.(3)Sambrook,J.etal.(1989).MolecularCloning:ALabor

8、atoryManual,(2nded.),(pp.1.53–1.73).ColdSpringHarbor:ColdSpringHarborLaboratoryPress.

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