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《DNA及寡核苷酸探針在原位雜交組織化學(xué)》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、中國(guó)試劑網(wǎng)6.3.1.3DNA及寡核苷酸探針在原位雜交組織化學(xué)一、DNA探針的應(yīng)用雖然一般認(rèn)為DNA探針敏感度不如cRNA探針,但在病毒的檢測(cè)等領(lǐng)域中DNA探針仍得到廣泛的應(yīng)用。在原位雜交細(xì)胞化學(xué)的操作步驟方面與cRNA探針基本相同,所不同的是:(1)雜交時(shí)需先在高溫80~95℃短時(shí)處理,使DNA探針及細(xì)胞內(nèi)靶DNA變性,解離成單鏈,迅置于冰上冷卻。然后置于37℃~42℃雜交過夜。(2)RNA酶的溶液的沖洗不能減低背景,因此,在操作步驟中省略此步。(一)地高辛-堿性磷酸酶(Dig-AKP)標(biāo)記DNA探針在石蠟包埋切片檢測(cè)病毒DNA中的應(yīng)用1.組織前處理(1)固定:組
2、織以10%中性福爾馬林液或Bouins液固定,常規(guī)石蠟包埋,切片厚4~6μm,粘附于涂有粘附劑的玻片上,入烤箱60~80℃6~8h,使切片更緊貼玻片。(2)脫蠟:二甲苯10min×2,自100%乙醇,90%,70%,50%,30%各5min。入PBS(含5mmol/lMgCl2,pH7.3~7.4)10min×2。入0.2nHCl20min以進(jìn)一步去除蛋白。(3)50℃2×SSC,含5mmol/lEDTA溶液中30min。(4)蛋白酶K(1μg/ml溶于0.1mol/lPBS中,)37℃20~25min。(5)0.2mol/l甘氨酸液:室溫10min,中止蛋白酶反應(yīng)
3、。(6)4%多聚甲醛(PBS新鮮配制):室溫20min。(7)PBS/5mmol/lMgCl2漂洗10min×2。(8)脫水,自低濃度到高濃度,無水乙醇各3min,空氣干燥。2.預(yù)雜交封閉非特異性雜交位點(diǎn),20μl/每張切片,42℃水浴半小時(shí)。3.雜交10~20μl/每張切片,加蓋硅化蓋玻片,將切片置于95℃min,使探針及病毒DNA變性,然后迅速置于冰上1min(也有報(bào)告用乙醇使之冷卻的),然后將切片置于盛有2×SSC濕盒內(nèi),42℃過夜(16~18h)。4.雜交后漂洗(1)2×SSC液內(nèi)振動(dòng)移除蓋片。中國(guó)試劑網(wǎng)6.3.1.3(2)2×SSc55℃10min×2。(
4、3)0.5×SSc55℃5min×2。(4)緩沖液II(含0.5%封阻試劑,用緩沖液I溶解)37℃30min。(5)緩沖液I(10mmol/lTris–HCl,15.0mmol/LNaClpH7.5)15min,室溫。(6)酶標(biāo)地高辛抗體(1:5000,應(yīng)用緩沖液I稀釋)37℃30min。(7)緩沖液i15min×2室溫。(8)緩沖液III(100mmol/lTris-HCl,100mmol/LNaCl,50mmol/LMgCl2,pH9.5)室溫2min。5.顯色(1)顯色液配制:緩沖液III:1ml中加入4.5μl四氮唑藍(lán)(NBT),3.5μlX-磷酸鹽(5-溴
5、-4-氯-3吲哚磷酸鹽(BCIP配成))。30μl/每張切片,置暗處顯色30min到2h。定時(shí)抽查切片,鏡檢其顯色情況。(2)緩沖IV(10mmol/lTris–HCl,1mmol/LEDTA,pH8.0)10min終止反應(yīng),甲綠復(fù)染5min,二甲苯透明,DPX封固,鏡檢。(二)熒光標(biāo)記DNA探針的應(yīng)用1.概述在原位雜交細(xì)胞化學(xué)中熒光標(biāo)記DNA探針(FluorescenceinsituDNAhybridisa-tion,FISH)的應(yīng)用在細(xì)胞培養(yǎng)和染色體鋪片(見二十一章)中較為廣泛。FISH屬于非放射性標(biāo)記,其優(yōu)點(diǎn)在于簡(jiǎn)便,快速,其敏感性可與放射性同位素標(biāo)記核酸探針
6、相等。不少實(shí)驗(yàn)室報(bào)告應(yīng)用FISH(2~5kbp探針)可成功地達(dá)到單個(gè)拷貝(copy)的特異性定位。2.熒光標(biāo)記DNA探針應(yīng)用于ISHH中的基本原則(BarbaraTraok和DanPinkel1990)(1)首先應(yīng)使組織或染色體中靶核苷酸高溫加熱變性解離為單鏈DNA,化學(xué)性標(biāo)記的DNA探針除外。(2)雜交:一般在37℃進(jìn)行,探針稀釋濃度在2ng/μl,染色體鋪片探針濃度在0.4ng/μl,雜交液2~3μl/每cm2蓋片,每張蓋片大約1.8cm2,約需10μl雜交液。有實(shí)驗(yàn)室報(bào)告,如每張蓋片(溫度為室溫)加入雜交液將會(huì)降低雜交溫度所需要的37℃,因此,建議對(duì)蓋片應(yīng)用前
7、在37℃進(jìn)行預(yù)熱。(3)用免疫細(xì)胞化學(xué)或組織化學(xué)方法顯示熒光標(biāo)記。自80年代以來,熒光中國(guó)試劑網(wǎng)6.3.1.3素標(biāo)記檢測(cè)系統(tǒng)日益增加。包括:①生物素標(biāo)記探針與熒光素標(biāo)記的抗生物素(avidin)或抗生物素抗體。②氨乙酰基熒光(aminoacetylfluroence,AAF)-改良探針(modifiedprobe),與抗AAF抗血清。③磺酸(sulfonatc)改良探針,以抗磺酸抗血清檢測(cè)(OrganicLtd,Yavene,Israel和TMcBioproductsRocklandME可提供此藥盒)。④汞標(biāo)記探針(mercuratedprobe),以硫氫基(s