轉錄-基因組-課件

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1、7.2.2轉錄水平的調控真核生物基因表達調控的主要環(huán)節(jié)主要涉及3個組成成分的相互作用:RNA聚合酶-催化轉錄的酶順式作用元件cis-actingelement-與結構基因串聯(lián)的特定DNA序列反式作用因子trans-actingfactor-可調節(jié)轉錄的一類蛋白質基因概念:結構基因、轉錄起始、終止和調節(jié)有關的DNA序列。原核生物中,相關的一組基因連在一起構成操縱子,由單個啟動子來調節(jié)整個操縱子的轉錄真核生物,每個基因有其自身的啟動子序列,獨立的調節(jié)。真核生物RNA聚合酶轉錄因子transcriptionfactors基本轉錄起始過程順式作用元件反式作用因子真核生物基因

2、轉錄調控的復雜性研究基因表達調控中DNA-結合蛋白相互作用的實驗方法真核生物RNA聚合酶RNA聚合酶ⅠRNA聚合酶ⅡRNA聚合酶Ⅲ復合體結構的多亞基酶,每種RNA聚合酶由12或12個以上亞基組成,5個亞基公共純化的RNA聚合酶離體不能結合到專一的DNA序列,不能有效、正確地轉錄加入細胞粗提液時,RNA聚合酶正確啟動特定基因的轉錄轉錄活化復合體:RNA聚合酶、轉錄因子(蛋白質)、轉錄起始點上游專一DNA序列蛋白質與蛋白質蛋白質與DNA的相互作用真核生物細胞中普遍存在一類蛋白質,以反式作用影響轉錄的因子RNA聚合酶是一種反式作用于轉錄的蛋白因子。真核細胞中RNA聚合酶不

3、能單獨發(fā)揮轉錄作用,而需要與其他轉錄因子共同協(xié)作。TFⅠ、TFⅡ、TFⅢ:分別與RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ相應的轉錄因子,對TFⅡ研究最多。轉錄因子transcriptionfactors,TF轉錄因子分子量(kD)功能TBP30與TATA盒結合TFⅡ-B33介導RNA聚合酶Ⅱ的結合TFⅡ-F30,74募集RNA聚合酶Ⅱ,解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35穩(wěn)定TFⅡ-D的結合TFⅡ-I120促進TFⅡ-D的結合TFⅡ-D:決定RNA聚合酶Ⅱ的轉錄起始位點,還參與其他上游DNA元件對基本轉錄速率的調節(jié)多蛋白復合體,包括兩

4、類成分,與TATA盒結合的蛋白TBP(TATAboxbindingprotein)和TBP相關因子--TAF(TBPassociatedfactors)TBP:唯一能識別TATA盒并與其結合的轉錄因子,三種RNA聚合酶轉錄時都需要TAF:其他均為TBP相關因子,與TBP緊密結合,至少包括8種轉錄因子TFⅡ-D結合到TATA盒TFⅡ-A和TFⅡ-B順序結合到轉錄起始復合體。TFⅡ-A能穩(wěn)定TFⅡ-D與TATA盒的結合,提高轉錄效率,但不是轉錄復合體所比需。TFⅡ-B的C端與TBP-DNA復合體結合,其N端能與RNA聚合酶Ⅱ親和結合,參與TFⅡ-F對RNA聚合酶Ⅱ的募集

5、兩個亞基組成的TFⅡ-F加入裝配,TFⅡ-F與RNA聚合酶形成復合體,還具有依賴于ATP供給能量的DNA解旋酶活性,能解開前方的DNA雙螺旋,在轉錄鏈延伸中起作用基本轉錄起始過程啟動子序列與TFⅡ-D、B、F及RNA聚合酶Ⅱ結合形成一個“最低限度”、有轉錄功能基礎的轉錄前起始復合物(preintitiationcomplex,PIC),能轉錄mRNA三個轉錄因子TFⅡ-E、TFⅡ-H、TFⅡ-J緊接著結合到復合體,形成完整的轉錄復合體。TFⅡ-E:兩個亞基組成的四聚體,不直接與DNA結合,可能與TFⅡ-B聯(lián)系,能提高ATP酶的活性TFⅡ-H:多亞基蛋白復合體,具有

6、依賴于ATP的DNA解旋酶活性,在轉錄鏈延伸中發(fā)揮作用;具有以RNA聚合酶Ⅱ為底物的蛋白激酶活性,使RNA聚合酶Ⅱ按羧基端結構域磷酸化。RNA聚合酶磷酸化使其離開原來位點,向轉錄起始點下游方向移動,轉錄啟動,延伸生成長鏈RNA生物體不同的組織,不同的發(fā)育階段,不同的外界環(huán)境條件,均會使轉錄過程適應生長發(fā)育過程的需要。單靠基本轉錄起始過程不可能應付復雜多變的植物生命活動。更加復雜的轉錄調節(jié)過程:建立在基本轉錄起始過程之上,仍然涉及到蛋白質-DNA以及蛋白質-蛋白質相互作用順式作用元件和反式作用因子順式作用元件基因:包括作為轉錄模板的結構基因和與之串聯(lián)的基因調控序列。調

7、控序列:不起編碼作用,對基因轉錄起始和轉錄速率等起作用的DNA序列。順式作用元件:基因調控序列由長短不等的DNA序列片段組成,離轉錄起始點的距離也遠近不同。協(xié)同作用決定了基因轉錄的精確起始與轉錄效率。啟動子遠側調節(jié)元件增強子沉默子(silencer)絕緣子(insulator)啟動子啟動子:轉錄起始必需的一些DNA序列。對于典型的由RNA聚合酶Ⅱ轉錄的基因,上游區(qū)序列與RNA聚合酶Ⅱ和轉錄因子相結合,組成起始轉錄復合體。啟動子一般可包括兩個區(qū)域:核心啟動子和啟動子近側調節(jié)序列。核心啟動子corepromoter包括轉錄起始點(transcriptionstart

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