向GenBank批量上傳序列地方法

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1、實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔向GenBank批量上傳序列的方法Qin1.利用DNAstar的editSeq制作待序列的FASTA文檔：待上傳序列刪減至合適長(zhǎng)度后，將待上傳序列全部打開隨后點(diǎn)擊File-exportasone，保存文件格式為：*.fas，將待上傳序列全部歸至一個(gè)FASTA文檔。注意序列命名：文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔2.在GenBank的SubmissionTools里，下載序列信息編輯軟件Sequin。網(wǎng)址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/（下圖中點(diǎn)擊Instructions下載軟件）注意打開安裝文件后，程序會(huì)自動(dòng)安裝在安裝包所在的文件夾。3.打開Sequin

2、，點(diǎn)擊StartNewSubmission。文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔4.隨后選擇序列發(fā)布日期，輸入論文題目。若之前保存有模板，可以點(diǎn)擊下面的“Clickheretoimportatemplate”導(dǎo)入。模板導(dǎo)出在下文的第五點(diǎn)提到。文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔5.聯(lián)系人、作者信息、機(jī)構(gòu)或者學(xué)校信息文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔建議導(dǎo)出模板，之后修改信息時(shí)可以直接導(dǎo)入模板而不需重新輸入。5.選擇上傳的序列類型。6.導(dǎo)入之前準(zhǔn)備好的FASTA文件：文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔導(dǎo)入之后，輸入序列ID（序號(hào)ID相當(dāng)于編號(hào)，可以自由命名，只要各個(gè)序列的ID不一致即可。在這里以病人編號(hào)作為序列ID）：文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔導(dǎo)入序列成功后

3、，顯示各個(gè)序列信息如下：文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔點(diǎn)擊SequencingMethod，將測(cè)序方法輸入：文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔選擇上傳序列的用途：病毒類型：文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔5.編輯每條序列的信息：點(diǎn)擊ImportSourceTable可以導(dǎo)入模板，點(diǎn)擊ExportThisTable可以輸出模板備用。6.選擇核酸類型，序列內(nèi)容后，點(diǎn)擊OpenRecordViewer。文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔5.添加每條序列的信息，包括編碼區(qū)重復(fù)區(qū)RNA結(jié)構(gòu)等等。雙擊相關(guān)信息可進(jìn)行修改，點(diǎn)擊Annotate添加相關(guān)信息。文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔5.檢查信息是否有誤（也可以點(diǎn)擊Search里的Validate檢測(cè)是否有明顯錯(cuò)

4、誤）：有些錯(cuò)誤是可以忽略的，如上傳的序列為CDS序列，那么軟件報(bào)錯(cuò)”序列無終止子”時(shí)可忽略。隨后，點(diǎn)擊Done保存待上傳序列：注意此時(shí)保存的文件包含所有序列信息，因此只需保存一次即可。文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔12.將保存好的文件作為郵件附件，發(fā)送至：gb-sub@ncbi.nlm.nih.gov13.收到accessionnumber即表示上傳成功。文案大全實(shí)用標(biāo)準(zhǔn)文檔文案大全