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1、WesternBlot技術(shù)專輯之PAGE膠電泳和轉(zhuǎn)膜PAGE倒膠的儀器我們?cè)谇懊鎃esternBlot儀器之選已經(jīng)介紹過(guò)了,除了順手的工具能防止漏膠,PAGE配膠的試劑和配方比例對(duì)電泳結(jié)果的質(zhì)量當(dāng)然有決定性的影響,這個(gè)配膠的比例,在《分子克隆》上有詳細(xì)的論述,相信大家都不難查到。容易忽視的問(wèn)題主要在于過(guò)硫酸銨(AP)一定要新鮮——最好用小指管配AP(寫日期)保存在-20度,超過(guò)2周的AP扔掉算了,或者已經(jīng)反復(fù)打開使用多次的AP都別用,小氣病發(fā)作的后果往往是得不償失——膠凝不好多半是這里疏忽(或者混合不勻),因?yàn)橄鄬?duì)配膠的其他組分
2、,AP算最活躍分子——如果還有諸如漏加某組分或者配比錯(cuò)誤或者Buffer搞錯(cuò),那絕對(duì)是你自己找罵,不值得同情。水要用去離子的純水,MilliQ級(jí)更好。Cambrex(原來(lái)的FMC)有商品化的丙烯酰胺母液,很貴,也很好——配出的膠對(duì)200KD以上的蛋白的分辨率高于普通PAGE膠,條帶清晰漂亮,可惜一直沒有搞清楚配方的奧秘;但是數(shù)十倍于丙烯酰胺粉劑的價(jià)格令人卻步,不過(guò),對(duì)接觸丙烯酰胺粉塵嚴(yán)重過(guò)敏的人可以選擇這個(gè)。更加豪華的選擇是已經(jīng)凝好的預(yù)制膠,各種配方各種比例各種梳孔大小多少任君選擇,打開即用,當(dāng)然更直接方便,更吸引人的是結(jié)果漂亮
3、,分辨率高,特別是重復(fù)性好,條帶真正是"razorsharp"??!平時(shí)都能用這么豪華的東西心情當(dāng)然超爽啊,實(shí)驗(yàn)緊湊又輕松,效率也更高??!如果實(shí)驗(yàn)都能這么“好馬配好鞍”,想必更容易出結(jié)果,也就更容易拿經(jīng)費(fèi)吧!什么時(shí)候我們的實(shí)驗(yàn)才能實(shí)現(xiàn)這種良性循環(huán)?。nvitrogen旗下的Norvex和Cambrex(原來(lái)的FMC)PAGEr都是首選預(yù)制膠??墒窃凇吧鐣?huì)主義初級(jí)階段”這種奢侈品平時(shí)流流口水就算了,偏偏最近Invitrogen公司推出了新的優(yōu)惠活動(dòng),買3盒NuPAGE預(yù)制膠就送電泳儀或者電轉(zhuǎn)移,面對(duì)這種誘惑,你難道就沒有一點(diǎn)非份之
4、想的沖動(dòng)?上樣電泳:上樣前蛋白樣品最好離心,上樣量不宜過(guò)多,以免看結(jié)果時(shí),每個(gè)條帶都彎彎地“笑”你貪多嚼不爛哦。其他的操作,按照說(shuō)明控制電流,不要過(guò)多重復(fù)使用電泳Buffer(別小氣,重復(fù)使用會(huì)降低緩沖能力的),好像基本不會(huì)出問(wèn)題了。當(dāng)預(yù)染的Marker告訴你,你要分辨的蛋白已經(jīng)到達(dá)最佳分辨區(qū)——分離膠的2/3處,OK,電泳結(jié)束了。電泳結(jié)果檢查:如果要做WesternBlot,是否需要先檢查電泳結(jié)果呢?能先看看結(jié)果如何再進(jìn)行下一步轉(zhuǎn)膜當(dāng)然最好。考馬斯亮藍(lán)使用簡(jiǎn)便快速,可以分辨1ug左右的條帶,是最經(jīng)濟(jì)通用的蛋白PAGE膠電泳染色
5、方法。銀染操作復(fù)雜一些但分辨率高很多,可以分辨2-5ng蛋白??墒怯捎诳捡R斯亮藍(lán)染色或者銀染經(jīng)過(guò)固定不可逆結(jié)合,會(huì)干擾后面的WesternBlot實(shí)驗(yàn),很多人會(huì)選擇省略掉這一步——同樣的樣品跑2塊膠,一塊染色一塊轉(zhuǎn)膜,一般也可以說(shuō)明問(wèn)題。如果想在轉(zhuǎn)膜前看看電泳結(jié)果,你需要用SYPROTangerine——這種金色熒光蛋白染料靈敏度很高——檢測(cè)4ng-8ng蛋白,接近銀染,但使用非常簡(jiǎn)單,最重要的是由于不用酸堿或者有機(jī)溶劑固定,不干擾蛋白活性,特別適合Western轉(zhuǎn)膜前的染色,或者非變性膠的活性蛋白的檢測(cè)(比如染色后還需要在膠上
6、進(jìn)行活性檢測(cè)等等)??上YPROTangerine價(jià)格挺貴的,500ul(5000x)要2000元,即使很節(jié)約的用只夠大概100多次呢。所以最經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的方法是:麗春紅S,直接染色轉(zhuǎn)移膜,檢測(cè)轉(zhuǎn)膜效果,充分脫色后不干擾Western結(jié)果。麗春紅的檢測(cè)靈敏度和考馬斯亮藍(lán)差不多。轉(zhuǎn)膜:經(jīng)過(guò)PAGE電泳分離后的蛋白質(zhì)樣品需要經(jīng)過(guò)“轉(zhuǎn)膜”步驟——從PAGE膠轉(zhuǎn)移到膜上固定,才能用各種方法進(jìn)行WesternBlot的檢測(cè)和顯色,而且為了防止沒有電場(chǎng)的情況下已經(jīng)分離的蛋白條帶擴(kuò)散,轉(zhuǎn)移要盡快進(jìn)行轉(zhuǎn)膜的首要是選膜。在轉(zhuǎn)移膜上顯色其實(shí)就像是畫家
7、在畫布上作畫一樣,不光要有好的畫筆和顏料,適合的畫布也是相當(dāng)之重要。WesternBlotting亦是如此,沒有選擇好合適的轉(zhuǎn)移膜是無(wú)法做出漂亮的結(jié)果的。因此,選擇適合的轉(zhuǎn)移膜,要讓轉(zhuǎn)移“膜”高一尺,幫襯而不是阻礙到我們的實(shí)驗(yàn)。WesternBlot印跡常用的轉(zhuǎn)移膜主要是硝酸纖維素膜(NitrocelluloseBlottingMembranes,NC)和PVDF膜(Polyvinylidene-Fluoride),此外也有用尼龍膜、DEAE纖維素膜做蛋白印跡。具體哪種膜適合于哪些實(shí)驗(yàn)?zāi)??選擇的根據(jù)主要有:a.膜與目的蛋白分子的
8、結(jié)合能力(也就是單位面積的膜能結(jié)合蛋白的載量),以及膜的孔徑(也就是攔截蛋白的大?。籦.不影響后續(xù)的顯色檢測(cè)(也就是適和用于所選的顯色方法,信噪比好);c.如果后繼實(shí)驗(yàn)有其他要求,比如要做蛋白測(cè)序或者質(zhì)譜分析,還要根據(jù)不同目的來(lái)挑選不同的轉(zhuǎn)移膜,就像國(guó)畫要選擇