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《豬流行性腹瀉病毒分離鑒定與實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立-論文.pdf》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展,2014,35(8):31—35ProgressinVeterinaryMedicine豬流行性腹瀉病毒分離鑒定與實(shí)時(shí)熒光定量RT—PCR檢測(cè)方法的建立唐金明。,陳書琨,林慶燕,黃新亞。,盧體康,孫潔,阮周曦,曾少靈,祁振強(qiáng),呂建強(qiáng),楊俊興,曹琛福,張彩虹,劉建利,廖立珊,花群義,秦智鋒¨(1.深圳出入境檢驗(yàn)檢疫局,廣東深圳518045;2.華南農(nóng)業(yè)大學(xué),廣東廣州510642;3.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué),湖南長(zhǎng)沙410000;4.深圳市寶舜泰生物醫(yī)藥股份有限公司,廣東深圳市518001)摘要:采用Vero-76細(xì)胞系從臨
2、床樣品小腸內(nèi)容物中分離到1株豬流行性腹瀉病毒(PEDV),通過RT-PCR進(jìn)行了鑒定。針對(duì)PEDV,參照保守的M基因序列設(shè)計(jì)了特異性引物和探針,建立了針對(duì)PEDV特異性的實(shí)時(shí)熒光定量RT_PCR檢測(cè)方法(PEDV-rRT—PCR)。所建立的方法特異性強(qiáng),與傳染性胃腸炎病毒、輪狀病毒、豬細(xì)小病毒等豬主要病原體無交叉反應(yīng);方法靈敏度高,檢測(cè)靈敏度達(dá)到重組質(zhì)粒1O稀釋度(約20cop);重復(fù)性好,組內(nèi)變異系數(shù)≤0.26。20份田間樣品檢測(cè)結(jié)果表明,所建立的PEDV-rRT—PCR方法快速、靈敏,檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確可靠,適合用于PEDV的
3、快速檢測(cè)和流行病學(xué)調(diào)查。關(guān)鍵詞:豬流行性腹瀉病毒;病毒分離;實(shí)時(shí)熒光定量RT—PCR中圖分類號(hào):$852.28;$852.659.6文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):1007-5038(2014)08—0031—05豬流行性腹瀉(Porcineepidemicdiarrhea,個(gè)州,造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。PEDV與豬傳染性PED)是由豬流行性腹瀉病毒(Porcineepidemicdi—胃腸炎病毒(Transmissiblegastroenteritisvirus,arrheavirus,PEDV)引起的一種急性、高度接觸性TGEV)
4、、輪狀病毒A(RotavirusgroupA,Rota—A)腸道傳染病,主要臨床表現(xiàn)為腹瀉、嘔吐、脫水和哺感染后所引起的臨床癥狀相似,臨床難以鑒別診斷,乳仔豬高致死率。PED呈世界范圍性流行,1971年給疾病的確診、治療和防控帶來了很大困難,給養(yǎng)豬在英國(guó)和比利首次報(bào)道,此后加拿大、匈牙利、德國(guó)、業(yè)造成嚴(yán)重經(jīng)濟(jì)損失。日本及韓國(guó)等多個(gè)國(guó)家都報(bào)道了該病的發(fā)生。中國(guó)2013年,從規(guī)?;B(yǎng)豬場(chǎng)采集2O多份臨床樣于1976年首次報(bào)道PED_1]。最近幾年,PED危害品,采用Vero-76細(xì)胞系分離出了1株P(guān)EDV,并通性進(jìn)一步加大,流行
5、呈明顯上升趨勢(shì)口_3]。從2010過RT—PCR方法和測(cè)序?qū)ζ溥M(jìn)了鑒定。為建立年春季至今,我國(guó)的很多省份、泰國(guó)、菲律賓、韓國(guó)及PEDV的快速檢測(cè)方法,采用實(shí)時(shí)熒光定量RT-美國(guó)等國(guó)家的規(guī)模化豬場(chǎng)暴發(fā)嚴(yán)重的豬流行性腹瀉PCR(real-timeRT—PCR,rRT—PCR)技術(shù)建立一種疫情。2013年,豬流行性腹瀉病毒已蔓延美國(guó)13能快速、靈敏、準(zhǔn)確檢測(cè)PEDV的實(shí)時(shí)熒光定量RT一收稿日期:2013-12—27基金項(xiàng)目:深圳市技術(shù)創(chuàng)新計(jì)劃資助項(xiàng)目(CXZZ2013032o154210829)作者簡(jiǎn)介:唐金明(1986一),男,
6、湖南永州人,助理獸醫(yī)師,碩士,主要從事動(dòng)物疫病檢測(cè)工作。*通訊作者崠豢米DevelopmentandApplicationofSemi-nestedPCRforOrfVirusDetectionDENGYu(SchoolofAnimalScience,XichangCollege,Xichang,Sichuan,615013,China)Abstract:AceordingtothesequenceofFILgeneofOrfvirusinGenBank,threeprimersweredesignedandsynthesi
7、zed.Asemi—nestedPCRassayfordifferentiatingOrfvirus(ORFV),sheeppoxvirus(SPV)andgoatpoxvirus(GPV)wasdeveloped.The450bpDNAfragmentwasamplifiedinORFVXC13strain,butnobandswereamplifiedwithtemplatesextractedrespectivelyfromSPV,GPVandavianpoxvirus.Sensi—tivityofthesemi—ne
8、stedPCRassaywas3.64×10copies//,LORFV.Intherepeatabilitytestandthefieldtrail,thesemi—nestedPCRassaycouldbeusedasamethodforthedetectionandmolecular