報告人黃理明導師林東昕教授.ppt

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1、報告人：黃理明導師：林東昕教授染色體6q13拷貝數(shù)多態(tài)與胰腺癌發(fā)病相關(guān)中國醫(yī)學科學院腫瘤研究所胰腺癌臨床及流行病學特點臨床特點：1、病程短，進展快，預后差；2、目前最有效的治療方法就是早期根治性切除；3、起病隱匿，根治性切除率僅20%。流行病學特點：1、發(fā)病水平與社會經(jīng)濟狀況有一定關(guān)系；2、我國胰腺癌的發(fā)病率和死亡率均呈上升趨勢。WangL,etal.2005胰腺癌發(fā)病的危險因素確定的危險因素可能的危險因素年齡糖尿病吸煙不良飲食習慣慢性胰腺炎某些職業(yè)性暴露遺傳性胰腺炎膽囊炎或膽囊切除史胰腺癌發(fā)病的遺傳因素研究人群病例數(shù)量對照數(shù)量基因基因功能高加索及美國人309964GSTT1香煙致癌

2、物代謝高加索及德國人52235UGT1A7香煙致癌物代謝高加索、西班牙、365379NAT1香煙致癌物代謝非洲及北美人群高加索及美國人309964XRCC1堿基切除修復多人群GWAS38513934ABO血型抗原中國人163337MTHFR/TS葉酸代謝中國人397907FasL/CASP8死亡受體通路中國人393786COX2前列腺素合成拷貝數(shù)多態(tài)的定義拷貝數(shù)變異：copynumbervariation,CNV>1kb的DNA片段獲得（插入或重復）和缺失包含堿基數(shù)>SNP拷貝數(shù)多態(tài)：copynumberpolymorphism,CNP人群中發(fā)生的頻率>1%拷貝數(shù)多態(tài)與疾病關(guān)聯(lián)研究G

3、ENETYPELOCUSPHENOTYPENBPF23Loss/Gain1q21.1neuroblastomaunknownLoss2p24.3prostatecancerFCGR3Loss1q23.3Glomerulonephritis,systemiclupuserythematosusLCE3B/3CLoss1q21psoriasisLPALoss/Gain6q25.3AlteredcoronaryheartdiseaseriskCCL3L1/CCL4L1Loss/Gain17q12ReducedHIVinfection;reducedAIDSsusceptibilityCYP

4、2A6Loss19q13.2AlterednicotinemetabolismSNP芯片病例和對照的基本資料VariablePatients(n=420)Controls(n=817)P*No.(%)No.(%)Sex0.659Male265(63.10)505(61.81)Female155(36.90)312(38.19)Age(y)0.503?4022(5.24)40(4.90)41-60174(41.43)367(44.92)>60224(53.33)410(50.18)*Two-sided?2test.染色體6q13拷貝數(shù)多態(tài)與胰腺癌發(fā)病風險的關(guān)系CopynumberPat

5、ients(n=420)Controls(n=817)OR*(95%CI)PNo.(%)No.(%)2copies144(34.28)364(44.55)1.00(reference)1copy233(55.48)362(44.31)1.75(1.33–2.31)7.56×10-50copy43(10.24)91(11.14)1.07(0.68–1.69)0.780or1copy276(65.72)453(55.45)1.61(1.24–2.11)4.41×10-4*Datawerecalculatedbylogisticregression,adjustedforsex,agean

6、dsmokingstatus.breakpointMappingchr6:74,648,791chr6:74,659,169CNV精確定位芯片粗略定位：chr6:74649185-74658419長度：9235bpPreModPredictedRegulatoryModules(hg17,Build35)BLASTNalignhumanandmousegenomeHumanMouse生物信息學分析功能研究假設(shè)FeukL,etal.2006**100020003000400050006000SV40promoterPredictedRegulatoryModuleP-targetP-c

7、ontrol報告基因?qū)嶒濸<0.01初步結(jié)論染色體6q13拷貝數(shù)多態(tài)與胰腺癌發(fā)病相關(guān)該拷貝數(shù)多態(tài)的具體定位：chr6:74,648,791-74,659,169該區(qū)段可能包含一個負調(diào)控元件主要參考文獻1.WangL,etal.ThechangingpancreaticcancermortalityinChina(1991-2000).ChinJInternMed,2005,44(7):509-513.2.LochanR,etal.Geneticsuscep