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《基于錨定PCR技術對10種重要農業(yè)害蟲微衛(wèi)星DNA位點的篩選及其特征分析-論文.pdf》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關內容在應用文檔-天天文庫。
1、生物安全學報2014,23(1):60—65JOURNALOFBIOSAFETYhttp:ffwww.bscn.orgDOI:10.3969/j.issn.2095—1787.2014.o1.012基于錨定PCR技術對10種重要農業(yè)害蟲微衛(wèi)星DNA位點的篩選及其特征分析李慧,郎坤玲,沈長朋,李潔,陶云荔,褚棟青島農業(yè)大學農學與植物保護學院,山東省植物病蟲害綜合防控重點實驗室,山東青島266109摘要:【背景】微衛(wèi)星DNA廣泛存在于真核和原核生物的基因組中,具有多態(tài)性豐富、易于檢測等特點,在遺傳圖譜的構建、動植物遺傳學育
2、種等方面被廣泛應用。【方法】利用5錨定PCR技術對桃小食心蟲、桃蛀螟、玉米螟、二點委夜蛾、花薊馬、黃胸薊馬、棕櫚薊馬、斑翅果蠅、稻水象甲、扶桑綿粉蚧10種重要農業(yè)害蟲進行微衛(wèi)星DNA篩選,并分析各個物種的微衛(wèi)星DNA的特點?!窘Y果】不同物種的陽性克隆率、微衛(wèi)星比率、克隆效率和冗余率存在不同程度的差異;在核苷酸堿基數目上,主要為二核苷酸重復序列,占重復位點總數的93.2%~100%,三、四核苷酸重復位點較少。在二核苷酸重復位點中,CA/TG重復位點最為豐富,占重復位點總數的89.2%~100%。這與使用的錨定引物密切相關
3、;10種害蟲的微衛(wèi)星DNA平均重復次數為6.7~8.9次,其中玉米螟具有最高的微衛(wèi)星DNA重復次數(34次);在序列類型上,完全型序列占上述害蟲序列總數的91.0%~100%?!窘Y論與意義】5錨定PCR技術能夠快速挖掘害蟲的微衛(wèi)星DNA位點,本研究結果為這些害蟲微衛(wèi)星位點的進一步利用奠定了基礎。關鍵詞:農業(yè)害蟲;微衛(wèi)星;5錨定PCR技術;克?。惶卣鞣治鯥solationandCharaCterizatiOnofmicrosatelliteDNAlocifrOmtenimportantagriculturalpestin
4、sectsusinganchoredPCRmethodHuiLI,Kun-lingLANG,Chang—pengSHEN,JieLI,Yun—liTAO,DongCHUKeyLaboratoryofIntegratedCropPestManagementofShandongProvince,CollegeofAgronomyandPlantProtection,QingdaoAgriculturalUniversity,Qingdao,Shandong266109,ChinaAbstract:【Background】M
5、icrosatelliteDNAconsistsofbothprokatryoticandeukaryoticgenomes.Thecharacteristicsincluderichpolymorphismandeasydetection.Thetechniquehasbeenappliedinanimalandplantgeneticsandbreeding,fortheconstructionforgeneticmaps.【Method】Usingthe5anchoredPCRmethod,microsatcll
6、iteDNAfrom10importantagriculturalpestswereisola—tedandanalyzed,includingCarposinasasakii(Lepidoptera:Carposinidae),Conogethespunctralis(Lepidoptera:Pyralidae),Ostrinianubilalis(Lepidoptera:Pyralidae),Proxenuslepigone(Lepidoptera:Noctuidae),Frankliniellaintonsa(T
7、hysanoptera:Thripidae),Thripshamaiiensis(Thysanoptera:Thripidae),Thripspalmi(Thysanoptera:Thripidae),Drosophilasuzukii(Diptera:Drosophilidae),Lissorhoptrusoryzophilus(Coleoptera:Curculionidae)andPhenacoccussolenopsis(Hemiptera:Pseudococcidae).Thecharacteristicso
8、fmicrosatelliteDNAintheseinsectswereanalyzed.【Result】Thepositiveclonerates,microsatelliterates,clo-ningeficiencyandredundancyratesofmicrosatelliteDNAamongthespecieswe