用pubmed查文獻方法

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1、先給大家一段查詢語言:(myocardial[Title/Abstract]ANDinfarction[Title/Abstract])AND("loattrfulltext"[sb]AND"2008/09/26"[PDat]:"2009/09/25"[PDat]ANDEnglish[lang]ANDReview[ptyp])。能看懂嗎,是不太復(fù)雜了?其實就是查詢近一年的關(guān)于心肌梗死的英文綜述。所幸的是,我們不需要記這樣的查詢語言,有了PubMed,我們完全可以簡單的操作就可查到想要的目標(biāo)文獻。呵呵,

2、有點像做廣告哈。先介紹一下pubmedPubMed包括MEDLINE和PREMEDLINE的完整內(nèi)容。它還包括一些被MEDLINE認為超出范圍的文章和雜志,(這些文章或雜志)由于內(nèi)容或在某一時期不在索引范圍內(nèi)。因此PubMed是比MEDLINE的更大的集合??匆幌滤珍浀臄?shù)據(jù)庫:PubMed現(xiàn)已有19million文章信息(文章的名稱,發(fā)布日期雜志,摘要,全文鏈接以及與要查詢內(nèi)容相關(guān)的文章),最早的文章可追塑到1948年。另外,PubMedCentral還能提供大概300000篇免費全文。因此,Pu

3、bMed是科研過程中文獻查找的一個最重要的工具,就我個人而言,一般是先在PubMed中找到全文鏈接,然后再上相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫查找。下面我們就一步步的教大家如何有效應(yīng)用該資源。?首先,進入PubMed的首頁面,網(wǎng)址是http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/,如果從NCBI首頁進入,Search的地方選擇PubMed就可進入了。?頁面介紹:最上面一行為查詢框,在首頁的文字部分給出了三種查詢方式:1、topic主題檢索。很簡單,在查詢框輸入主題詞(如:心肌梗死m(xù)yocardiali

4、nfarction),點右邊的“go”就OK了;2、authors著者檢索。注意:這里人名用的是中國人的習(xí)慣,即姓+名字的首字母。如中國作者張海洋為ZhangHY,外國作者FishmanEK,都是姓在前,名在后。3、journals期刊檢索。可以用期刊的全稱或縮寫。?從最簡單的開始,比如說我們想要查詢一篇心肌梗死的文章,在查詢框中輸入myocardialinfarction,出現(xiàn)以下頁面,注意,在查詢由兩個以上的單詞組成的主題詞的時候,我們可以將其加上括號或者雙引號,如(myocardialinfar

5、ction),“myocardialinfarction”,這樣PubMed在查找的時候會將其做為一個整體來查詢,而不會將兩者分開分別進行查詢。?從上圖中我們可以看到,默認情況下,文章信息包括題目,作者,雜志及其發(fā)表年月卷期頁,PMID號,以及相關(guān)文章等列出來,每頁20篇文獻,以發(fā)表日期為排序依據(jù)。文章的顯示信息的方式是可以更改的,其中,Display可選擇Summary,Brief(簡要信息,包括雜志和PMID),Abstract(僅摘要)o等其他方式。Show表示每頁顯示的文章數(shù),可選擇20、50

6、、100篇等。SortBy指的是文章的排序,可按作者,發(fā)表日期,雜志名等排序。Sendto指的是將該頁面發(fā)送到想要存放的地方,其選擇有Text(文本格式),F(xiàn)ile(文本文件即txt文件,該格式是很多文獻引用軟件導(dǎo)入文獻時所用的格式,如Endnote等),E-mail等;但需注意的是,保存或發(fā)送的僅僅是該頁面的文章,也就是默認情況下的20篇,如果想將較多的文獻一起保存的話,可以在Show中選擇每頁展示多一些的文章數(shù)后再保存。?表示本次查詢到共158208篇文章,其中綜述19646篇,我們點擊它后便只顯

7、示綜述類文章了。在綜述文章后面還有一個小工具的圖標(biāo),它允許用戶在PubMed上注冊用戶,然后可將這些搜索結(jié)果保留下來,還可以將該查詢相關(guān)的新的文章發(fā)到個人E-mail中,是一項很有用的工具。?在檢索結(jié)果頁面的右側(cè)還有該次檢索結(jié)果中PubMed中心擁有的免費文章,可以免費得到全文下載。?上面介紹的是最基本的查詢,但我們發(fā)現(xiàn),這樣查找出來的文章如以心肌梗死m(xù)yocardialinfarction為主題詞查找共查出來158208篇,如此大數(shù)量的文章是沒法閱讀的,也沒有重點,因此我們需要將查詢細化,這時我們便

8、用到了下圖圈出的工具了。Limit可以限制檢索的主題詞在印刷物題目,摘要還是全文,可限制文獻的語言是英文,中文或者其他,可限制文獻性質(zhì)是研究文章還是綜述,還可限制文章的發(fā)表日期。值的注意的是,使用“Limit”會排除還未標(biāo)引好的文獻。如果你要查找最新文獻,建議不要使用Limit。下面給一個具體的例子,比如說我們要查找一篇最近1年發(fā)表的題目或摘要中有心肌梗塞主題詞的英文綜述文章,要求找到的文獻有全文,我們在limit中便如做如下選擇了:此為限制文章有全文可

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