甜瓜種質(zhì)資源多樣性分析與指紋圖譜的構(gòu)建

甜瓜種質(zhì)資源多樣性分析與指紋圖譜的構(gòu)建

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1、2015(9):31-38中國蔬菜CHINAVEGETABLES研究論文甜瓜種質(zhì)資源多樣性分析與指紋圖譜的構(gòu)建*顧 冉 周金蒙 馬鴻艷 欒非時(shí)(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院,農(nóng)業(yè)部東北地區(qū)園藝作物生物學(xué)與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,黑龍江哈爾濱150030)摘 要:采用15個(gè)形態(tài)學(xué)標(biāo)記和32個(gè)CAPS(CleavedAmplifiedPolymorphismSequences,CAPS)標(biāo)記鑒別73份甜瓜材料。通過15個(gè)形態(tài)學(xué)標(biāo)記,在遺傳相似系數(shù)為0.82時(shí)將73份甜瓜材料分為3種類型。在分子標(biāo)記中,被篩選的32對(duì)CAPS引物多態(tài)性比率為29.63%,PIC值分布在0

2、.22~0.38,平均值為0.34;經(jīng)過CAPS標(biāo)記聚類分析,73份甜瓜材料間的遺傳相似系數(shù)在0.50~0.97之間,當(dāng)相似系數(shù)在0.60時(shí),可以將供試材料分為3種類型。通過構(gòu)建指紋圖譜代碼與QR編碼,為73份甜瓜材料建立了獨(dú)特的核酸指紋圖譜,每份材料可以相互區(qū)別,以便快速對(duì)種質(zhì)資源進(jìn)行鑒定。關(guān)鍵詞:甜瓜;形態(tài)學(xué)標(biāo)記;CAPS標(biāo)記;多樣性分析;指紋代碼甜瓜為葫蘆科甜瓜屬一年生蔬菜作物,在我國中38份為厚皮甜瓜,35份為薄皮甜瓜。2種植面積已達(dá)41.04萬hm,占世界甜瓜生產(chǎn)面積1.2 田間試驗(yàn)的45%以上(楊艷濤等,2012;王志丹,2014)。1.2.1 田間試驗(yàn)設(shè)

3、計(jì) 田間試驗(yàn)于2014年3~8月目前,我國甜瓜種質(zhì)資源豐富,遺傳多樣性較為在東北農(nóng)業(yè)大學(xué)香坊實(shí)驗(yàn)實(shí)習(xí)基地西甜瓜育種溫室寬泛(宋海斌,2012;李瑞峰,2014),但缺少對(duì)進(jìn)行。將73份甜瓜材料每份取20粒種子浸種催芽,種質(zhì)資源的身份鑒定,存在選育的品種親緣關(guān)系不80%種子出芽后播于營(yíng)養(yǎng)缽中,待幼苗長(zhǎng)至2~3詳、品種混亂等現(xiàn)象。因此,本試驗(yàn)收集了國家西片真葉時(shí),采用完全隨機(jī)區(qū)組試驗(yàn)設(shè)計(jì)定植于溫瓜甜瓜種質(zhì)中期庫中有代表性的73份甜瓜材料,室,每份供試材料每個(gè)小區(qū)定植5株,3次重復(fù),對(duì)其15個(gè)田間性狀進(jìn)行標(biāo)記分析,利用CAPS標(biāo)株距40cm,行距70cm,共種植甜瓜10

4、95株,試2記分析其多樣性,構(gòu)建每份甜瓜材料獨(dú)一無二的核驗(yàn)總面積為310m。酸指紋代碼,可高效、準(zhǔn)確地鑒定甜瓜種質(zhì)資源,1.2.2 田間試驗(yàn)方法 待果實(shí)成熟時(shí),對(duì)所有甜瓜為甜瓜品種選育和親緣關(guān)系分析提供理論依據(jù)。材料的田間性狀進(jìn)行統(tǒng)計(jì)調(diào)查,每份材料隨機(jī)調(diào)查5個(gè)果實(shí),調(diào)查的果實(shí)性狀包括7個(gè)質(zhì)量性狀(芳1 材料與方法香氣、網(wǎng)紋、裂紋、果皮底色、果肉顏色、瓤色、1.1 試驗(yàn)材料果肉質(zhì)地)和8個(gè)數(shù)量性狀(坐果期、果皮硬度、供試材料為73份甜瓜品種,均取自國家西瓜果實(shí)長(zhǎng)度、果實(shí)寬度、果形指數(shù)、果腔大小、單果甜瓜種質(zhì)中期庫(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究質(zhì)量、可溶性固形物)。果實(shí)長(zhǎng)度

5、(cm)、果實(shí)寬所),其編號(hào)、品種名稱、類型、來源見表1,其度(cm)、果腔大?。╟m)使用游標(biāo)卡尺測(cè)量;單果質(zhì)量(kg)用電子稱測(cè)定;果皮硬度(Pa)用顧冉,女,碩士研究生,專業(yè)方向:甜瓜分子育種,E-mail:GY-1型果實(shí)硬度計(jì)測(cè)定;可溶性固形物含量(%)gr48726@163.com 用手持測(cè)糖儀測(cè)定。*通訊作者(Correspondingauthor):欒非時(shí),女,教授,博士生導(dǎo)師,1.2.3 田間數(shù)據(jù)分析方法 所有性狀調(diào)查方法和專業(yè)方向:西甜瓜分子遺傳育種,E-mail:Luanfeishi@sina.com標(biāo)準(zhǔn)參照《甜瓜種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)》收稿日

6、期:2015-01-06;接受日期:2015-03-30(馬雙武和劉君璞,2006),質(zhì)量性狀以有或無進(jìn)基金項(xiàng)目:國家西甜瓜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系—分子育種崗位項(xiàng)目(CARS-26-02),黑龍江省攻關(guān)項(xiàng)目(GC12B112)行記錄,有記為“1”,無記為“0”。數(shù)量性狀的—31—《中國蔬菜》學(xué)術(shù)論文下載www.cnveg.org研究論文中國蔬菜CHINAVEGETABLESm調(diào)查,參照尚建立等(2012)的方法,根據(jù)平均值樣性指數(shù),計(jì)算公式為H'=∑ppijlnij,其中i為某一i=1(X)和標(biāo)準(zhǔn)差(δ)計(jì)算,將數(shù)量性狀分為10級(jí),

7、性狀的表型代碼(i=1,2,3,…,m,m為性狀所1級(jí)≤X-2δ,10級(jí)≥X+2δ,中間每級(jí)間隔0.5δ。分的等級(jí)數(shù),不同性狀m不同),j為性狀數(shù)(j=1,各性狀的平均值、標(biāo)準(zhǔn)差、變異系數(shù)在Excel中計(jì)2,3,…,n,n=15),Pij為第j個(gè)性狀第i種表型算完成;采用Shannon信息指數(shù)計(jì)算田間性狀的多代碼的頻率,即其在群體中所占的比率。表1 供試甜瓜材料編號(hào)品種名稱類型來源編號(hào)品種名稱類型來源編號(hào)品種名稱類型來源1米籽黃旦子厚皮北疆26臺(tái)灣蜜薄皮黑龍江51Caravelle厚皮法國2賽熱克可口奇厚皮南疆27平果青薄皮江西

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