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《雷蒙德氏棉一段單拷貝序列的fish分析》由會員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、棉花學(xué)報(bào)CottonScience2016,28(2):179―183雷蒙德氏棉一段單拷貝序列的FISH分析1111121崔興雷袁徐俊民袁劉玉玲袁劉方袁高巧麗袁彭仁海袁王春英袁11111*周忠麗袁王星星袁蔡小彥袁王玉紅袁王坤波淵1.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所/棉花生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室袁河南安陽455000曰2.安陽工學(xué)院袁河南安陽455000冤摘要院雷蒙德氏棉基因組草圖的完成為棉花的基礎(chǔ)研究奠定基礎(chǔ)袁然而該基因組草圖仍需要后續(xù)的補(bǔ)充和完善遙利用雷蒙德氏棉基因組草圖信息袁分別在6條較長染色體的端部選取了4kb的序列遙通過生物信息學(xué)分析這些序列在基因組中的拷貝情況袁發(fā)現(xiàn)2號染色體一端的序列Ch
2、r2D屬于單拷貝序列袁且其內(nèi)部沒有重復(fù)序列遙隨后以該段序列為探針袁對雷蒙德氏棉有絲分裂中期染色體進(jìn)行熒光原位雜交袁結(jié)果顯示在1號染色體和4號染色體的一端有明顯的雜交信號袁信號大小遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于4kb序列所能產(chǎn)生信號的大小袁而信號的強(qiáng)度則比正常的雜交信號暗弱遙試驗(yàn)結(jié)果說明該4kb序列Chr2D可能在1號染色體和4號染色體的1個(gè)端部有較高的拷貝數(shù)袁而信號強(qiáng)度的暗弱則說明該序列在染色體上的分布方式可能為散漫分布遙雜交信號在1號染色體和4號染色體上的相似性說明袁這2對染色體可能有一定的親緣關(guān)系遙該結(jié)果將對雷蒙德氏棉基因組草圖的補(bǔ)充完善有幫助遙關(guān)鍵詞院雷蒙德氏棉曰基因組草圖曰熒光原位雜交曰重復(fù)序列中圖分
3、類號院S562.035文獻(xiàn)標(biāo)志碼院A文章編號院1002-7807(2016)02-0179-0510.11963/issn.1002-7807.2016020111111121CuiXinglei,XuJunmin,LiuYuling,LiuFang,GaoQiaoli,PengRenhai,WangChunying,Zhou11111*Zhongli,WangXingxing,CaiXiaoyan,WangYuhong,WangKunbo(1.455000,;2.455000,)Whilethedraftgenomeofprovidesafirmfoundationforcottonf
4、undamentalresearch,itrequiresfurtherworktomakeitcompleteandrobust.Four-kilobyte-longsequenceswereselectedfromterminalsectionsofsixofthelongerchromosomesusingthedraftgenome.Afteranalysisoftheselectedsequencesbybioinformatics,Chr2Dwasfoundtobeasingle-copysequencewithoutrepetitivesequences.Obvioushy
5、bridizationsignalsweredetectedinonetermi-nalregionofchromosomes1and4whensequenceChr2DwasusedasaprobeandmitoticmetaphasechromosomesofwereusedastargetDNA.Thesizeofthesignalissignificantlylargerthana4-kbsequencewouldaccountforwhilethesignalbrightnessisfainterthanthatofnormalhybridizationsignals.This
6、indicatesthatChr2Dmaynotactuallybeasingle-copysequenceandthatthecopynumberofthesequenceinoneterminalregionofchromosomes1and4maybehuge.Thebrightnessofthesignalsuggeststhatthedistributionofrepetitivesequencemaybeloose.Thesimilarityofhybridizationsignalsonchro-mosome1and4showthatthepairofchromosomes
7、maybehomologous.Theseresultswillhelpcomplementthedraftgenomeof.;genomicdraft;FISH;repetitivesequence[2]棉花是世界上重要的纖維經(jīng)濟(jì)作物袁也是研組(A―K)和1個(gè)四倍體基因組(AD)組成遙其中究細(xì)胞遺傳學(xué)堯植物多倍體化堯基因組結(jié)構(gòu)和基A基因組和D基因組大約分化于670萬年以前袁[1]因組進(jìn)化的模式植物遙棉屬由8個(gè)二倍體基因經(jīng)過大約50
