老齡腎陽(yáng)虛證的差異表達(dá)基因譜分析

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1、老齡腎陽(yáng)虛證的差異表達(dá)基因譜分析作者:李煒弘雍小嘉范懷昌譚從娥張?zhí)於鹜趺浊菊磕康牟捎没虮磉_(dá)譜芯片技術(shù),分析老齡腎陽(yáng)虛證的發(fā)生與基因表達(dá)異常間的聯(lián)系。方法篩選腎陽(yáng)虛證患者3名和正常對(duì)照者3名,采用美國(guó)Affymetrix公司的HG-u133Plus2.0基因表達(dá)譜芯片,通過(guò)組間比較,篩選出老齡腎陽(yáng)虛患者差異表達(dá)基因。結(jié)果芯片數(shù)據(jù)組間比較分析后獲得34條差異表達(dá)基因,聚類分析得到6條有特征性地差異表達(dá)基因,主要涉及細(xì)胞周期和凋亡,腫瘤發(fā)生以及免疫。結(jié)論老齡腎陽(yáng)虛證的發(fā)生涉及一系列免疫紊亂的復(fù)雜的過(guò)程,可能與個(gè)體的衰老存在密切關(guān)聯(lián)?!娟P(guān)鍵詞】腎陽(yáng)虛證差異表達(dá)基因免疫衰老Abstra

2、ct:ObjectiveToexploretherelevancebeteandthedifferentiallyexpressedgenesbycDNAarrary.MethodsThreekidney-Yangdeficiencypatientsandthreehealthypeopleplesduringtheepidemiologicsurveyofthekidney-Yangdeficiencysyndrome.ThedifferentiallyexpressedgenesetrixGeneChip.Results34mondifferentiallyexpressedge

3、nesorigenesisandimmunityeisrelatedtothedysfunctionoftheimmunesystem,maybeclosedrelatedtobodyagEingasmuneresponse;AgEIng隨著人類基因組計(jì)劃的深入,尤其是功能基因組學(xué)研究技術(shù)的不斷發(fā)展,在基因表達(dá)譜芯片技術(shù)平臺(tái)上[1]開展的“證候-基因表達(dá)譜”研究從一個(gè)新的視角,系統(tǒng)、全面地深化人們對(duì)中醫(yī)證候的認(rèn)識(shí),把證候與分子網(wǎng)絡(luò)的功能聯(lián)系起來(lái)。在以往對(duì)腎陽(yáng)虛的研究中,已進(jìn)行腎陽(yáng)虛半定量化操作標(biāo)準(zhǔn)[2]以及虛寒證、心陽(yáng)虛證等基因芯片實(shí)驗(yàn)研究[3]提示,腎陽(yáng)虛證一定具有特定的分子生物學(xué)

4、基礎(chǔ);腎陽(yáng)虛的辨證論治其理其法在基因水平、分子水平有深層次的科學(xué)依據(jù)。研究中還發(fā)現(xiàn)年齡是“證”的基因表達(dá)不可忽略的影響因素,而腎陽(yáng)虛證在老齡人群中占有較大比例。結(jié)合多年“證候-基因組”研究的經(jīng)驗(yàn),筆者選用國(guó)際公認(rèn)的美國(guó)Affymetrix公司的人全基因組表達(dá)譜芯片,開展了特定老齡人群腎陽(yáng)虛證的差異基因表達(dá)譜的分析研究,探討老齡腎陽(yáng)虛證所涉及的分子生物學(xué)過(guò)程,為進(jìn)一步揭示腎陽(yáng)虛證的本質(zhì)奠定基礎(chǔ)。1研究對(duì)象在60歲以上老齡人群腎陽(yáng)虛證的流行病學(xué)調(diào)查過(guò)程中篩選了3例腎陽(yáng)虛證患者,年齡在60~70歲之間,體檢無(wú)西醫(yī)診斷的器質(zhì)性疾病,經(jīng)中醫(yī)專家診斷和腎陽(yáng)虛證量表[2]評(píng)分相結(jié)合,符合典型腎陽(yáng)虛

5、證診斷。另外,選取同年齡段、性別一致的3例健康老人為正常對(duì)照,此3例對(duì)照者經(jīng)體檢,均無(wú)西醫(yī)診斷的器質(zhì)性疾病,無(wú)身體不適癥狀,并經(jīng)過(guò)中醫(yī)專家診斷和腎陽(yáng)虛證量表評(píng)分,均無(wú)腎陽(yáng)虛臨床表征。2方法2.1提取總RNA分別采取腎陽(yáng)虛證患者與正常人的空腹靜脈血10ml,裂解紅細(xì)胞,分離獲得白細(xì)胞,采用Trizol法提取總RNA,并對(duì)總RNA進(jìn)行定量、質(zhì)檢。2.2基因芯片檢測(cè)利用單輪cRNA擴(kuò)增、生物素標(biāo)記法對(duì)樣品進(jìn)行靶標(biāo)制備,然后用于芯片雜交;芯片采用美國(guó)Affymetrix公司的HG-u133Plus2.0基因表達(dá)譜芯片,每例樣品檢測(cè)1張,共6張。用FluidicsStation450進(jìn)行洗脫和

6、染色,然后用Scanner3000掃描芯片;用GeneChipOperatingsoftetrix公司寡核苷酸芯片檢測(cè)結(jié)果已得到國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)界的公認(rèn)。采用成組T檢驗(yàn)的方法分析結(jié)果,用foldchange大于1.5或者小于0.6667,pvalue小于0.05,得到腎陽(yáng)虛證組與健康對(duì)照組間的差異表達(dá)基因34個(gè),其中表達(dá)水平下調(diào)的有28條基因,表達(dá)水平上調(diào)的僅有6條基因。見表2。3.2.2腎陽(yáng)虛證差異表達(dá)基因的聚類分析采用Cluster3.0對(duì)上述34條基因進(jìn)行聚類分析,如圖1所示。腎陽(yáng)虛證組和健康對(duì)照組間有6條基因有明顯的組間辨識(shí)特征。見表3。表16例樣本腎陽(yáng)虛證各癥狀因子及其定量評(píng)分

7、結(jié)果(略)sh1,sh2,sh3為3例典型腎陽(yáng)虛證患者,腎陽(yáng)虛證半定量診斷總分值分別為36,29,36;h1,h2,h3為3例健康對(duì)照者,腎陽(yáng)虛證半定量診斷總分值分別為3,2,5表2腎陽(yáng)虛證差異表達(dá)基因(略)表3腎陽(yáng)虛證特征差異表達(dá)基因(略)圖1腎陽(yáng)虛證差異表達(dá)基因聚類圖(略)4討論4.1實(shí)驗(yàn)的質(zhì)量控制既往對(duì)腎陽(yáng)虛證病機(jī)、診斷、治療、生理、生化、神經(jīng)-內(nèi)分泌-免疫調(diào)控等研究,提示該證很可能涉及一大群差異表達(dá)基因,擁有復(fù)雜而獨(dú)特的分子生物學(xué)內(nèi)涵[4]?;蛐?/p>

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