資源描述：
《核盤菌(sclerotiniasclerotiorum)誘導(dǎo)的桑樹差異表達(dá)基因及功能分析》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在工程資料-天天文庫。
1、核盤菌（Sclerotiniasclerotiorum）誘導(dǎo)的桑樹差異表達(dá)基因及功能分析殷培峰鄭必平曾其偉何寧佳談建中蘇州大學(xué)建筑學(xué)院滁州學(xué)院生物與食品工程學(xué)院家蠶基因組生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室摘要:桑扌甚菌核病是影響桑祺產(chǎn)量和品質(zhì)的主要病害，核盤菌（Sclerotiniasclerotiorum）是一種新發(fā)現(xiàn)的疑似桑扌甚菌核病的病原真菌。以果桑品種大10為供試材料，利用數(shù)字基因表達(dá)譜技術(shù)，篩選核盤菌侵染相關(guān)的差異表達(dá)基因（DEGs）并分析其功能與代謝途徑。在感染和未感染核盤菌的桑樹幼果樣品Z間檢測到了顯著差異表達(dá)基因1226個(gè)（上調(diào)表達(dá)基因
2、1088個(gè)，下調(diào)表達(dá)基因138個(gè)），其中包含33類172個(gè)抗性相關(guān)基因，35類112個(gè)轉(zhuǎn)錄因子基因。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，顯著差異表達(dá)基因顯著富集于4個(gè)細(xì)胞組分（胞外區(qū)、細(xì)胞壁、外部封裝結(jié)構(gòu)、質(zhì)外體）、6種分子功能（抗氧化活性、酶催化活性、酶調(diào)節(jié)活性、核酸結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子活性、營養(yǎng)物質(zhì)代謝、翻譯調(diào)控活性等）和6個(gè)代謝通路（亞油酸代謝、半胱氨酸和蛋氨酸代謝、植物-病原互作、苯丙氨酸代謝、芳香族氨基酸生物合成、糖類次生代謝產(chǎn)物生物合成）。選取可能與桑樹對(duì)核盤菌感染應(yīng)答相關(guān)的Fbox等5個(gè)基因作為目的基因，進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測驗(yàn)證，檢測數(shù)據(jù)與R
3、NA-seq表達(dá)譜的分析結(jié)果基本一致。研究結(jié)果為闡釋桑樹應(yīng)答核盤菌侵染的分子機(jī)制積累了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。關(guān)鍵詞：桑樹；桑扌甚菌核病;核盤菌;數(shù)字表達(dá)譜;基因差異表達(dá);功能注釋;KEGG信號(hào)通路;實(shí)吋熒光定量PCR;作者簡介：殷培峰（1979—）,男，博士研究生。E-mail:ypfl97912@126.com作者簡介：談建中，教授，博士生導(dǎo)師。E-mail:suda.tanjz@163.com作者簡介：何寧佳，教授，博士生導(dǎo)師。E-mail:hejia@swu.edu.cn收稿日期：2017-06-10基金：家蠶基因組牛物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放基金
4、資助課題（No.sklsgb2013008）AnalysisofDifferentiallyExpressedGenesinMulberryInfectedbySclerotiniasclerotiorumYinPeifengZhengBipingZengQiweiHeNingjiaTanJianzhongCollegeofArchitecture,SoochowUniversity;StateKeyLaboratoryofSilkwormGenomeBiology;Abstract：Mulberryissusceptibletomulb
5、erryfruitsclerotiniosiswhichseriouslyaffectstheyieldandqualityofmulberryfruit.Sclerotiniasclerotiorumisanewlydiscoveredpathogenicfunguscausingmulberryfruitsclerotiniosis.Inthisstudy,afruitmulberryvarietyDalOwasusedasmaterialanddigitalgeneexpressionprofilingwasemployedtodi
6、ssectdifferentiallyexpressedgenes(DEGs)andtoanalyzetheirfunctionsandmetabolicpathwaysrelatedtoSclerotiniasclerotioruminfection.Asaresult,1226significantlydifferentiallyexpressedgenesweredetectedbetweentheinfectedandnon-infectedmulberryfruitsamples.Amongthem,1088geneswereu
7、p-regulatedand138genesweredown-regulated.Thereare172genesrelatedtodiseaseresistance(dividedinto33classes)and112genesoftranscriptionfactors(dividedinto35classes)?ThroughGOfunctionalannotation,thesignificantlydifferentiallyexpressedgeneswerefoundtoenrichsignificantlyin4cel1
8、components(extracellularregion,cellwall,externalencapsulatingstructure,andapoplast),in6molecular
