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《核盤菌(sclerotiniasclerotiorum)誘導的桑樹差異表達基因及功能分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關內容在工程資料-天天文庫。
1、核盤菌（Sclerotiniasclerotiorum）誘導的桑樹差異表達基因及功能分析殷培峰鄭必平曾其偉何寧佳談建中蘇州大學建筑學院滁州學院生物與食品工程學院家蠶基因組生物學國家重點實驗室摘要:桑扌甚菌核病是影響桑祺產量和品質的主要病害，核盤菌（Sclerotiniasclerotiorum）是一種新發(fā)現的疑似桑扌甚菌核病的病原真菌。以果桑品種大10為供試材料，利用數字基因表達譜技術，篩選核盤菌侵染相關的差異表達基因（DEGs）并分析其功能與代謝途徑。在感染和未感染核盤菌的桑樹幼果樣品Z間檢測到了顯著差異表達基因1226個（上調表達基因
2、1088個，下調表達基因138個），其中包含33類172個抗性相關基因，35類112個轉錄因子基因。生物信息學分析發(fā)現，顯著差異表達基因顯著富集于4個細胞組分（胞外區(qū)、細胞壁、外部封裝結構、質外體）、6種分子功能（抗氧化活性、酶催化活性、酶調節(jié)活性、核酸結合轉錄因子活性、營養(yǎng)物質代謝、翻譯調控活性等）和6個代謝通路（亞油酸代謝、半胱氨酸和蛋氨酸代謝、植物-病原互作、苯丙氨酸代謝、芳香族氨基酸生物合成、糖類次生代謝產物生物合成）。選取可能與桑樹對核盤菌感染應答相關的Fbox等5個基因作為目的基因，進行實時熒光定量PCR檢測驗證，檢測數據與R
3、NA-seq表達譜的分析結果基本一致。研究結果為闡釋桑樹應答核盤菌侵染的分子機制積累了基礎數據。關鍵詞：桑樹；桑扌甚菌核病;核盤菌;數字表達譜;基因差異表達;功能注釋;KEGG信號通路;實吋熒光定量PCR;作者簡介：殷培峰（1979—）,男，博士研究生。E-mail:ypfl97912@126.com作者簡介：談建中，教授，博士生導師。E-mail:suda.tanjz@163.com作者簡介：何寧佳，教授，博士生導師。E-mail:hejia@swu.edu.cn收稿日期：2017-06-10基金：家蠶基因組牛物學國家重點實驗室開放基金
4、資助課題（No.sklsgb2013008）AnalysisofDifferentiallyExpressedGenesinMulberryInfectedbySclerotiniasclerotiorumYinPeifengZhengBipingZengQiweiHeNingjiaTanJianzhongCollegeofArchitecture,SoochowUniversity;StateKeyLaboratoryofSilkwormGenomeBiology;Abstract：Mulberryissusceptibletomulb
5、erryfruitsclerotiniosiswhichseriouslyaffectstheyieldandqualityofmulberryfruit.Sclerotiniasclerotiorumisanewlydiscoveredpathogenicfunguscausingmulberryfruitsclerotiniosis.Inthisstudy,afruitmulberryvarietyDalOwasusedasmaterialanddigitalgeneexpressionprofilingwasemployedtodi
6、ssectdifferentiallyexpressedgenes(DEGs)andtoanalyzetheirfunctionsandmetabolicpathwaysrelatedtoSclerotiniasclerotioruminfection.Asaresult,1226significantlydifferentiallyexpressedgenesweredetectedbetweentheinfectedandnon-infectedmulberryfruitsamples.Amongthem,1088geneswereu
7、p-regulatedand138genesweredown-regulated.Thereare172genesrelatedtodiseaseresistance(dividedinto33classes)and112genesoftranscriptionfactors(dividedinto35classes)?ThroughGOfunctionalannotation,thesignificantlydifferentiallyexpressedgeneswerefoundtoenrichsignificantlyin4cel1
8、components(extracellularregion,cellwall,externalencapsulatingstructure,andapoplast),in6molecular
