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《拜氏梭菌耐氧突變及黃姜糖液發(fā)酵高產(chǎn)丁醇機(jī)理分析》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、分類號(hào)學(xué)號(hào)D201177360學(xué)校代碼10487密級(jí)博士學(xué)位論文拜氏梭菌耐氧突變及黃姜糖液發(fā)酵高產(chǎn)丁醇機(jī)理分析學(xué)位申請人:肖川學(xué)科專業(yè):微生物學(xué)指導(dǎo)老師:余龍江教授答辯時(shí)間:2018年1月29日ADissertationSubmittedinPartialFulfillmentoftheRequirementsfortheDegreeofDoctorofPhilosophyinScienceMechanismanalysisofhighbutanolyieldmediatedbygain-of-oxygentolerancemutationandSLDSfermentationb
2、yClostridiumbeijerinckiiPh.D.Candidate:ChuanXiaoMajor:MicrobiologySupervisor:Prof.LongjiangYuHuazhongUniversityofScienceandTechnologyWuhan,Hubei430074,P.R.ChinaJan,2018華中科技大學(xué)博士學(xué)位論文摘要生物丁醇因其優(yōu)良特性成為備受關(guān)注的新型可再生燃料,同時(shí),丁醇還是一種重要平臺(tái)化合物、萃取劑和車輛剎車制動(dòng)劑等。目前,生物丁醇主要來源于梭菌屬(clostridia)細(xì)菌丙酮丁醇乙醇厭氧發(fā)酵(ABE發(fā)酵)。但是,相對于石油化
3、工化學(xué)法來源的丁醇,生物丁醇發(fā)酵生產(chǎn)存在產(chǎn)量和效率偏低等問題,導(dǎo)致生產(chǎn)成本較高。因此,提高生物丁醇市場競爭力的核心是解決ABE發(fā)酵生產(chǎn)成本問題,通過調(diào)研分析,可從以下方面突破:1)增加菌株對氧的耐受性;2)提高溶劑產(chǎn)量和生產(chǎn)效率;3)降低溶劑對細(xì)胞的毒害;4)尋找廉價(jià)非糧發(fā)酵原料;5)提高菌株穩(wěn)定性,使其優(yōu)良特性不易退化。為此,本文選取拜氏梭菌(ClostridiumbeijerinckiiNCIMB8052)為對象,從增加菌株對氧的耐受性、提高溶劑產(chǎn)量和生產(chǎn)效率,以及廉價(jià)非糧原料發(fā)酵等方面深入研究,以期降低生產(chǎn)成本,并分析其高產(chǎn)機(jī)理。取得如下主要研究成果:(1)成功構(gòu)建一株拜氏
4、梭菌耐氧突變株(Cbei_1336mutant),并發(fā)現(xiàn)其丁醇和丙酮的產(chǎn)量和產(chǎn)率顯著提高。利用二型內(nèi)含子插入法成功敲除拜氏梭菌產(chǎn)溶劑退化菌株(C.beijerinckiiDS)中參與過氧化物還原機(jī)制調(diào)節(jié)的PerR抑制子基因Cbei_1336,獲得一株耐氧的兼性厭氧突變株。該突變株不但可以在有氧環(huán)境中生長良好,且與出發(fā)菌株相比,發(fā)酵液中生物量提高8.11±0.11(OD600)(3.67±0.35倍),丙酮和丁醇濃度分別提高4.7±0.40g/L(32.78±0.02倍)和10.01±0.57g/L(57.23±0.01倍),總?cè)軇┥a(chǎn)效率由產(chǎn)溶劑退化株的0.07±0.01g/L/
5、h提高到突變株的0.19±0.01g/L/h,產(chǎn)率提高了2.71±0.01倍。(2)基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)進(jìn)一步分析了耐氧突變株(Cbei_1336mutant)耐氧以及丁醇和丙酮產(chǎn)量和產(chǎn)率顯著提高的分子機(jī)理。通過比較分析C.beijerinckiiDS和Cbei_1336mutant在發(fā)酵12h、24h和36h后細(xì)胞中的基因表達(dá)變化,發(fā)現(xiàn)3個(gè)時(shí)間點(diǎn)差異表達(dá)的基因分別有2893、2597和3036條,除去其中未知蛋白后,在3個(gè)時(shí)間點(diǎn)共同上調(diào)的有975條,共同下調(diào)的有222條。GeneOntology(GO)分析顯示,在共同上調(diào)和下調(diào)的基因中,參與代謝進(jìn)程(Metabolicprocess)
6、的基因比例均是最多I華中科技大學(xué)博士學(xué)位論文的,分別占26.69%和29.28%。進(jìn)一步的基因差異表達(dá)分析顯示,編碼ABE發(fā)酵代謝路徑關(guān)鍵酶:mannitoltransportersubunitIIB,6-phosphofructokinase,glyceraldehyde-3-phosphatedehydrogenase,pyruvatekinase,2-oxoacidferredoxinoxidoreductasesubunitbeta,acetyl-CoAacetyltransferase,acetoacetatedecarboxylas和NADPH-BDH等基因在Cbei
7、_1336mutant中顯著上調(diào),而編碼phosphateacetyltransferase(PTA)和acetatekinase的基因在Cbei_1336mutant中顯著下調(diào)。此外,編碼參與氧化還原進(jìn)程的Ferredoxin,flavodoxin,rubrerythrin和radicalSAMprotein;編碼參與細(xì)胞解毒的glutaredoxin,multicopperoxidase(MCO)和Superoxidedismutase(SOD);編碼參與金屬離子相關(guān)的能量代