花生種質(zhì)資源重要農(nóng)藝品質(zhì)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析碩士論

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1、學(xué)校代碼學(xué)號(hào)或申請(qǐng)?zhí)柮芗?jí)10459z20106202鄭州大孚專業(yè)碩士學(xué)位論文題目:花生種質(zhì)資源重要農(nóng)藝和品質(zhì)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析作者姓名:導(dǎo)師姓名:學(xué)科門類:專業(yè)名稱:培養(yǎng)院系:完成時(shí)間:嚴(yán)玫田保明教授張新友研究員遺傳學(xué)與分子生物學(xué)生物工程生物工程系2012年5月。1==urAthesissubmittedtoZhengzhouUniversityforthedegreeofMasterGenome-wideAssociationanalysisofMainAgronomicandQualitytraitsinaworldwidecollectio

2、nofpeanut(Arachishypogaea)germplasmByMeiYanSupervisor:Prof.BaomingTianProf.XinyouZhangGeneticsandMoleculerbiologyBiologicalEngineeringBiologicalEngineeringDepartmentMay20122㈣5Ⅲ6Ⅲj1Ⅲ2㈣0iiii●■●洲2舢Y原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:所呈交的學(xué)位論文,是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下,獨(dú)立進(jìn)行研究所取得的成果。除文中已經(jīng)注明引用的內(nèi)容外,本論文不包含任何其他個(gè)人或集體己經(jīng)發(fā)表或撰寫過(guò)的

3、科研成果。對(duì)本文的研究作出重要貢獻(xiàn)的個(gè)人和集體,均已在文中以明確方式標(biāo)明。本聲明的法律責(zé)任由本人承擔(dān)。學(xué)位論文作者:日期:年月日學(xué)位論文使用授權(quán)聲明本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下完成的論文及相關(guān)的職務(wù)作品,知識(shí)產(chǎn)權(quán)歸屬鄭州大學(xué)。根據(jù)鄭州大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,同意學(xué)校保留或向國(guó)家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版,允許論文被查閱和借閱;本人授權(quán)鄭州大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索,可以采用影印、縮印或者其他復(fù)制手段保存論文和匯編本學(xué)位論文。本人離校后發(fā)表、使用學(xué)位論文或與該學(xué)位論文直接相關(guān)的學(xué)術(shù)論文或成果時(shí),第一署名單位仍然為鄭

4、州大學(xué)。保密論文在解密后應(yīng)遵守此規(guī)定。學(xué)位論文作者:2日期:年月摘要花生(ArachishypogaeaL.)是世界上五大重要的油料作物之一。我國(guó)是世界花生生產(chǎn)大國(guó),產(chǎn)量、消費(fèi)量和出口量均居世界首位。在我國(guó)油料作物中,花生產(chǎn)量約占油料作物總產(chǎn)的48%,而且發(fā)展?jié)摿薮蟆R虼?,開展花生基因組研究對(duì)振興我國(guó)花生乃至油料作物產(chǎn)業(yè),緩解食用植物油供需矛盾,具有重要的戰(zhàn)略意義。本研究選用166份花生種質(zhì),包括國(guó)內(nèi)不同年代的花生育成品種136個(gè)和外國(guó)種質(zhì)30份,具有廣泛的代表性和豐富的遺傳多樣性。采用傳統(tǒng)的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對(duì)多個(gè)農(nóng)藝性狀的表型數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,初步揭示不同

5、性狀的遺傳特性。同時(shí)以多個(gè)已構(gòu)建的花生遺傳連鎖圖譜及復(fù)合圖譜中的連鎖群為花生擬染色體,在以往試驗(yàn)結(jié)果的基礎(chǔ)上,選用64對(duì)遺傳多樣性豐富的SSR位點(diǎn),對(duì)整個(gè)花生基因組進(jìn)行掃描,通過(guò)標(biāo)記的基因型數(shù)據(jù),利用STRUCTURE2.3.1軟件對(duì)群體進(jìn)行結(jié)構(gòu)劃分。最終選用19項(xiàng)農(nóng)藝性狀的表型數(shù)據(jù)和種質(zhì)的基因型數(shù)據(jù),以結(jié)構(gòu)劃分依據(jù)Q因子作協(xié)變量對(duì)166份進(jìn)行簡(jiǎn)單線性回歸GLM模型分析。目的是通過(guò)表型.基因型全基因組關(guān)聯(lián)分析,進(jìn)一步揭示新的遺傳現(xiàn)象,驗(yàn)證已有的遺傳規(guī)律,同時(shí)發(fā)掘優(yōu)異的基因位點(diǎn)。主要研究結(jié)果如下:l、通過(guò)性狀頻數(shù)分布圖、聚類分析、結(jié)構(gòu)劃分的分析,可將1

6、66份種質(zhì)劃分為7大亞類。①?gòu)闹髑o高、側(cè)枝長(zhǎng)、結(jié)果枝、單株飽果數(shù)、百仁重、粗蛋白質(zhì)含量、脂肪酸含量、油酸(C18:1)含量、亞油酸(C18:2)含量、油酸/亞油酸比值(a兒)對(duì)應(yīng)的頻數(shù)分布圖,可發(fā)現(xiàn)各性狀值主要集中分布在7個(gè)區(qū)段;②根據(jù)17個(gè)性狀的綜合聚類分析結(jié)果,也將種質(zhì)劃分為7個(gè)亞群;③依據(jù)Hardy-Weinberg平衡理論,經(jīng)過(guò)LD檢測(cè),基于Bayesian模型和遺傳聚類分析的結(jié)果,對(duì)166份種質(zhì)進(jìn)行結(jié)構(gòu)劃分,最終劃分為7個(gè)亞群,其中2個(gè)亞群主要為外國(guó)核心種質(zhì)(平均90%以上),這與表型聚類分析劃分結(jié)果相似。2、對(duì)2011年度獲取的19個(gè)性狀

7、的表型數(shù)據(jù)與種質(zhì)群體的基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示,在所用“對(duì)引物中有55對(duì)與性狀呈顯著關(guān)聯(lián),等位變異位點(diǎn)有536個(gè)。其中,與植物學(xué)性狀關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有30個(gè),與產(chǎn)量性狀關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)的有46個(gè),與品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)的分別有23個(gè)(2010結(jié)果)和29個(gè)(2011年結(jié)果),與抗病性關(guān)聯(lián)的有11個(gè)。從2010年和2011年品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)中發(fā)掘出12個(gè)呈顯著關(guān)聯(lián)且穩(wěn)定遺傳的SSR位點(diǎn)。摘要3、對(duì)花生種質(zhì)的相關(guān)數(shù)值進(jìn)行簡(jiǎn)單統(tǒng)計(jì)分析與關(guān)聯(lián)分析,揭示并驗(yàn)證遺傳規(guī)律。①采用描述統(tǒng)計(jì)、相關(guān)性分析對(duì)性狀遺傳多樣性分布特點(diǎn)及不同性狀間關(guān)系的分析表明,同類型性狀的數(shù)值頻數(shù)分布極

8、為相似,不同類型性狀間相關(guān)性要低于同類型內(nèi)不同性狀間的相關(guān)性。在相關(guān)分析表中,產(chǎn)量性狀(8個(gè))和品質(zhì)性狀(5

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