花生種質資源重要農(nóng)藝品質性狀的全基因組關聯(lián)分析碩士論

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1、學校代碼學號或申請?zhí)柮芗?0459z20106202鄭州大孚專業(yè)碩士學位論文題目：花生種質資源重要農(nóng)藝和品質性狀的全基因組關聯(lián)分析作者姓名：導師姓名：學科門類：專業(yè)名稱：培養(yǎng)院系：完成時間：嚴玫田保明教授張新友研究員遺傳學與分子生物學生物工程生物工程系2012年5月。1==urAthesissubmittedtoZhengzhouUniversityforthedegreeofMasterGenome-wideAssociationanalysisofMainAgronomicandQualitytraitsinaworldwidecollectio

2、nofpeanut(Arachishypogaea)germplasmByMeiYanSupervisor：Prof．BaomingTianProf．XinyouZhangGeneticsandMoleculerbiologyBiologicalEngineeringBiologicalEngineeringDepartmentMay20122㈣5Ⅲ6Ⅲj1Ⅲ2㈣0iiii●■●洲2舢Y原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明：所呈交的學位論文，是本人在導師的指導下，獨立進行研究所取得的成果。除文中已經(jīng)注明引用的內容外，本論文不包含任何其他個人或集體己經(jīng)發(fā)表或撰寫過的

3、科研成果。對本文的研究作出重要貢獻的個人和集體，均已在文中以明確方式標明。本聲明的法律責任由本人承擔。學位論文作者：日期：年月日學位論文使用授權聲明本人在導師指導下完成的論文及相關的職務作品，知識產(chǎn)權歸屬鄭州大學。根據(jù)鄭州大學有關保留、使用學位論文的規(guī)定，同意學校保留或向國家有關部門或機構送交論文的復印件和電子版，允許論文被查閱和借閱；本人授權鄭州大學可以將本學位論文的全部或部分編入有關數(shù)據(jù)庫進行檢索，可以采用影印、縮印或者其他復制手段保存論文和匯編本學位論文。本人離校后發(fā)表、使用學位論文或與該學位論文直接相關的學術論文或成果時，第一署名單位仍然為鄭

4、州大學。保密論文在解密后應遵守此規(guī)定。學位論文作者：2日期：年月摘要花生(ArachishypogaeaL．)是世界上五大重要的油料作物之一。我國是世界花生生產(chǎn)大國，產(chǎn)量、消費量和出口量均居世界首位。在我國油料作物中，花生產(chǎn)量約占油料作物總產(chǎn)的48％，而且發(fā)展?jié)摿薮蟆Ｒ虼?，開展花生基因組研究對振興我國花生乃至油料作物產(chǎn)業(yè)，緩解食用植物油供需矛盾，具有重要的戰(zhàn)略意義。本研究選用166份花生種質，包括國內不同年代的花生育成品種136個和外國種質30份，具有廣泛的代表性和豐富的遺傳多樣性。采用傳統(tǒng)的統(tǒng)計學方法對多個農(nóng)藝性狀的表型數(shù)據(jù)進行分析，初步揭示不同

5、性狀的遺傳特性。同時以多個已構建的花生遺傳連鎖圖譜及復合圖譜中的連鎖群為花生擬染色體，在以往試驗結果的基礎上，選用64對遺傳多樣性豐富的SSR位點，對整個花生基因組進行掃描，通過標記的基因型數(shù)據(jù)，利用STRUCTURE2．3．1軟件對群體進行結構劃分。最終選用19項農(nóng)藝性狀的表型數(shù)據(jù)和種質的基因型數(shù)據(jù)，以結構劃分依據(jù)Q因子作協(xié)變量對166份進行簡單線性回歸GLM模型分析。目的是通過表型．基因型全基因組關聯(lián)分析，進一步揭示新的遺傳現(xiàn)象，驗證已有的遺傳規(guī)律，同時發(fā)掘優(yōu)異的基因位點。主要研究結果如下：l、通過性狀頻數(shù)分布圖、聚類分析、結構劃分的分析，可將1

6、66份種質劃分為7大亞類。①從主莖高、側枝長、結果枝、單株飽果數(shù)、百仁重、粗蛋白質含量、脂肪酸含量、油酸(C18：1)含量、亞油酸(C18：2)含量、油酸／亞油酸比值(a兒)對應的頻數(shù)分布圖，可發(fā)現(xiàn)各性狀值主要集中分布在7個區(qū)段；②根據(jù)17個性狀的綜合聚類分析結果，也將種質劃分為7個亞群；③依據(jù)Hardy-Weinberg平衡理論，經(jīng)過LD檢測，基于Bayesian模型和遺傳聚類分析的結果，對166份種質進行結構劃分，最終劃分為7個亞群，其中2個亞群主要為外國核心種質(平均90％以上)，這與表型聚類分析劃分結果相似。2、對2011年度獲取的19個性狀

7、的表型數(shù)據(jù)與種質群體的基因型數(shù)據(jù)進行關聯(lián)分析。結果顯示，在所用“對引物中有55對與性狀呈顯著關聯(lián)，等位變異位點有536個。其中，與植物學性狀關聯(lián)的位點有30個，與產(chǎn)量性狀關聯(lián)的位點的有46個，與品質性狀關聯(lián)的分別有23個(2010結果)和29個(2011年結果)，與抗病性關聯(lián)的有11個。從2010年和2011年品質性狀關聯(lián)數(shù)據(jù)中發(fā)掘出12個呈顯著關聯(lián)且穩(wěn)定遺傳的SSR位點。摘要3、對花生種質的相關數(shù)值進行簡單統(tǒng)計分析與關聯(lián)分析，揭示并驗證遺傳規(guī)律。①采用描述統(tǒng)計、相關性分析對性狀遺傳多樣性分布特點及不同性狀間關系的分析表明，同類型性狀的數(shù)值頻數(shù)分布極

8、為相似，不同類型性狀間相關性要低于同類型內不同性狀間的相關性。在相關分析表中，產(chǎn)量性狀(8個)和品質性狀(5